Produktet

Sekuenca e ARN-së me një bërthamë

Imazhi i veçuar i renditjes së ARN-së me një bërthamë

Përparimi në kapjen e një qelize të vetme dhe teknikën e ndërtimit të bibliotekës individuale, e kombinuar me sekuencën me performancë të lartë, lejon studimet e shprehjes së gjeneve në bazë qelizë për qelizë.Ai mundëson një analizë më të thellë dhe të plotë të sistemit mbi popullatat komplekse të qelizave, në të cilat shmang kryesisht maskimin e heterogjenitetit të tyre duke marrë mesataren e të gjitha qelizave.

Megjithatë, disa qeliza nuk janë të përshtatshme për t'u shndërruar në suspension me një qelizë, kështu që nevojiten metoda të tjera të përgatitjes së mostrës - nxjerrja e bërthamës nga indet, domethënë, bërthama nxirret drejtpërdrejt nga indet ose qeliza dhe përgatitet në suspension me një bërthamë për një. renditja e qelizave.

BMK ofron shërbimin e sekuencës së ARN me një qelizë me bazë 10× Genomics ChromiumTM.Ky shërbim është përdorur gjerësisht në studime për studime të lidhura me sëmundjet, si diferencimi i qelizave imune, heterogjeniteti i tumorit, zhvillimi i indeve, etj.

Çipi i transkriptimit hapësinor: 10× Gjenomikë

Platforma: Platforma Illumina NovaSeq

Na kontaktoni

Detajet e Shërbimit

Bioinformatika

Rezultatet e demonstrimit

Parimi teknik

Izolimi i bërthamave arrihet nga 10× Genomics ChromiumTM, i cili përbëhet nga një sistem mikrofluidik me tetë kanale me kryqëzime të dyfishta.Në këtë sistem, një rruaza xhel me barkode dhe primer, enzima dhe një bërthamë e vetme janë të kapsuluara në pikë vaji me madhësi nanolitri, duke gjeneruar Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Pasi të formohet GEM, liza e qelizave dhe lirimi i barkodeve kryhen në çdo GEM.mRNA transkriptohen në mënyrë të kundërt në molekula cDNA me barkode 10× dhe UMI, të cilat më tej i nënshtrohen ndërtimit të bibliotekës standarde të sekuencës.

Indi nuk është i përshtatshëm për përgatitjen e suspensionit njëqelizor

Qelizë / Ind	Arsyeja
Pafreskoni indet e ngrira	Nuk mund të merrni organizata të freskëta ose të ruajtura prej kohësh
Qeliza muskulore, megakariocitet, yndyra…	Diametri i qelizës është shumë i madh për të hyrë në instrument
Mëlçia…	Shumë e brishtë për t'u thyer, e paaftë për të dalluar qelizat e vetme
Qeliza neurone, truri…	Më e ndjeshme, e lehtë për t'u stresuar, do të ndryshojë rezultatet e renditjes
Pankreasi, tiroidja…	I pasur me enzima endogjene, që ndikojnë në prodhimin e suspensionit njëqelizor

Një bërthamë vs njëqelizore

Një bërthamë	Njëqelizore
Diametri i pakufizuar i qelizave	Diametri i qelizës: 10-40 μm
Materiali mund të jetë ind i ngrirë	Materiali duhet të jetë ind i freskët
Stresi i ulët i qelizave të ngrira	Trajtimi me enzimë mund të shkaktojë reaksion të stresit të qelizave
Nuk ka nevojë të hiqet qelizat e kuqe të gjakut	Qelizat e kuqe të gjakut duhet të hiqen
Bërthamore shpreh bioinformacion	E gjithë qeliza shpreh bioinformacion