Sekuenca bisulfite me përfaqësim të reduktuar (RRBS)
Specifikimet e Shërbimit
Platforma: Platforma NovaSeq, PE150
Lloji i bibliotekës: Biblioteka e ADN-së e trajtuar me bisulfite 200-400bp
Strategjia e renditjes: Paired-End 150 bp
Rekomandoni daljen e të dhënave: 10 Gb të dhëna të papërpunuara/kampion
Kërkesat e mostrës
Sasia e ADN-së: ≥ 2ug
Përqendrimi i ADN-së:≥ 20ng/μl.
Pastërtia: OD260/280 = 1.8 deri në 2.0 pa degradim ose kontaminim ARN
Analiza bioinformatike
Rrjedha e punës së shërbimit
Dorëzimi i mostrës
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuenca
Analiza e të dhënave
Shërbimet pas shitjes
a.Referenca e statistikave të shtrirjes së gjenomit
Statistikat e leximeve të hartës
Sstatistikat e thellësisë së renditjes dhe mbulimit të vendit C
Ambulimi i grumbulluar
Defikasiteti i tretjes së çdo kampioni
b.Zbulimi i vendit të metilimit
Lista e niveleve të metilimit në vendin C
BShndërrimi S
Mcitozina e etiluar
Shpërndarja e nivelit të metilimit
c.Harta e metilimit
Ggjerësisht enome
Gelement enome
d.Krahasimi i niveleve të metilimit ndërmjet mostrave
Pajror Korrelacioni i metilimit CG
PMetilimi CA-CG
Clusterimi i metilimit CG
d.Analiza diferenciale e metilimit
Sstatistikat e DMR
Shpërndarja e gjatësisë DMR
Hhani hartën
DShpërndarja e MR në rajonin e synuar
