-
BSA
Platforma Bulked Segregant Analysis përbëhet nga analiza standarde me një hap dhe analiza e avancuar me vendosjen e parametrave të personalizuar.BSA është një teknikë e përdorur për të identifikuar shpejt shënuesit gjenetikë të lidhur me fenotipin.Rrjedha kryesore e punës së BSA përmban: 1. përzgjedhjen e dy grupeve të individëve me fenotipe jashtëzakonisht të kundërta;2. bashkimi i ADN-së, ARN-së ose SLAF-seq (Zhvilluar nga Biomarker) të të gjithë individëve për të formuar dy pjesë të ADN-së;3. identifikimi i sekuencave diferenciale kundrejt gjenomit të referencës ose ndërmjet tyre, 4. parashikimi i rajoneve të lidhura kandidate me anë të algoritmit ED dhe indeksit SNP;5. Analiza funksionale dhe pasurimi i gjeneve në rajonet kandidate, etj. Minierat më të avancuara të të dhënave duke përfshirë ekzaminimin e shënuesve gjenetikë dhe dizajnin e primerit janë gjithashtu të disponueshme.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) është zhvilluar me vite përvojë në analizën e projektit të diversitetit mikrobik, i cili përmban analiza bazë të standardizuar dhe analiza të personalizuara: analiza bazë mbulon përmbajtjen e analizës kryesore të kërkimit aktual mikrobik, përmbajtja e analizës është e pasur dhe gjithëpërfshirëse, dhe rezultatet e analizës janë paraqitur në formën e raporteve të projektit;Përmbajtja e analizës së personalizuar është e larmishme.Mostrat mund të zgjidhen dhe parametrat mund të vendosen në mënyrë fleksibël sipas raportit bazë të analizës dhe qëllimit të kërkimit, për të realizuar kërkesat e personalizuara.Sistemi operativ Windows, i thjeshtë dhe i shpejtë.
-
Gjenetika Evolucionare
Gjenetika evolucionare është një shërbim i paketuar sekuencimi i krijuar për të ofruar një interpretim gjithëpërfshirës të informacionit evolucionar të materialeve të dhëna bazuar në variacionet gjenetike, duke përfshirë SNP-të, InDels, SV-të dhe CNV-të.Ai ofron të gjitha analizat themelore të nevojshme për përshkrimin e ndryshimeve evolucionare dhe veçorive gjenetike të popullatave, të tilla si struktura e popullsisë, diversiteti gjenetik, marrëdhëniet filogjene, etj. Përmban gjithashtu studime mbi rrjedhën e gjeneve, të cilat fuqizojnë vlerësimin e madhësisë efektive të popullsisë, kohën e divergjencës.
-
Gjenomika krahasuese
Gjenomika krahasuese fjalë për fjalë do të thotë krahasimi i sekuencave dhe strukturave të plota të gjenomit të specieve të ndryshme.Kjo disiplinë synon të zbulojë evolucionin e specieve, funksionin e gjeneve, mekanizmin rregullues të gjeneve në nivel gjenomi duke identifikuar strukturat dhe elementët e sekuencës që ruhen ose diferencohen në specie të ndryshme.Studimi tipik i gjenomikës krahasuese përfshin analiza në familjen e gjeneve, zhvillimin evolucionar, dyfishimin e plotë të gjenomit, presionin selektiv, etj.
-
Gjenetika Evolucionare
Popullsia dhe platforma e analizës gjenetike evolucionare është krijuar mbi bazën e përvojës masive të akumuluar brenda ekipit të R&D të BMK për vite me rradhë.Është një mjet miqësor për përdoruesit, veçanërisht për studiuesit që nuk janë të diplomuar në bioinformatikë.Kjo platformë mundëson analizën bazë të lidhur me gjenetikën evolucionare, duke përfshirë ndërtimin e pemëve filogjenetike, analizën e disekuilibrit të lidhjeve, vlerësimin e diversitetit gjenetik, analizën e pastrimit selektiv, analizën e farefisnisë, PCA, analizën e strukturës së popullsisë, etj.
-
Asambleja e Gjenomit me bazë Hi-C
Hi-C është një metodë e krijuar për të kapur konfigurimin e kromozomeve duke kombinuar ndërveprimet e bazuara në afërsi dhe sekuencën e përçueshmërisë së lartë.Intensiteti i këtyre ndërveprimeve besohet të jetë i lidhur negativisht me distancën fizike në kromozome.Prandaj, të dhënat Hi-C mund të udhëzojnë grumbullimin, renditjen dhe orientimin e sekuencave të mbledhura në një projekt gjenom dhe ankorimin e tyre në një numër të caktuar kromozomesh.Kjo teknologji fuqizon një asamble gjenomi në nivel kromozomi në mungesë të hartës gjenetike të bazuar në popullatë.Çdo gjenom i vetëm ka nevojë për një Hi-C.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Sekuenca e gjenomit të bimëve/kafshëve De Novo
De Novosekuenca i referohet ndërtimit të të gjithë gjenomit të një specieje duke përdorur teknologjitë e sekuencës, p.sh. PacBio, Nanopore, NGS, etj., në mungesë të një gjenomi referencë.Përmirësimi i jashtëzakonshëm në gjatësinë e leximit të teknologjive të sekuencës së gjeneratës së tretë ka sjellë mundësi të reja në montimin e gjenomeve komplekse, si ato me heterozigozitet të lartë, raport të lartë të rajoneve të përsëritura, poliploide, etj. zgjidhja e elementeve të përsëritura, rajoneve me përmbajtje anormale të GC dhe rajoneve të tjera shumë komplekse.
Platforma: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekuenca e Eksomës së Tërësisë Njerëzore
Sekuenca e të gjithë ekzomeve (WES) konsiderohet si një strategji e sekuencës me kosto efektive për identifikimin e mutacioneve që shkaktojnë sëmundje.Megjithëse ekzonet zënë vetëm rreth 1.7% të të gjithë gjenomit, ai përfaqëson drejtpërdrejt profilin e funksioneve totale të proteinave.Në gjenomën e njeriut, është raportuar se më shumë se 85% e mutacioneve të lidhura me sëmundjen ndodhin në rajonin kodues të proteinave.
BMKGENE ofron shërbime gjithëpërfshirëse dhe fleksibël të renditjes së eksomeve njerëzore me strategji të ndryshme të kapjes së ekzoneve të disponueshme për të përmbushur qëllime të ndryshme kërkimore.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekuenca e fragmenteve të përforcuara me vendndodhje specifike (SLAF-Seq)
Gjenotipizimi me performancë të lartë, veçanërisht në popullatën në shkallë të gjerë, është një hap themelor në studimet e asociacionit gjenetik, i cili siguron bazën gjenetike për zbulimin funksional të gjenit, analizën evolucionare, etj. Në vend të ri-sekuencës së thellë të të gjithë gjenomit, sekuenca e reduktuar e përfaqësimit të gjenomit (RRGS ) është futur për të minimizuar koston e renditjes për mostër, duke ruajtur efikasitetin e arsyeshëm në zbulimin e shënuesve gjenetikë.Kjo zakonisht arrihet duke nxjerrë fragmentin kufizues brenda diapazonit të caktuar të madhësisë, i cili quhet bibliotekë e reduktuar e përfaqësimit (RRL).Sekuenca e fragmenteve të amplifikuara me vendndodhje specifike (SLAF-Seq) është një strategji e zhvilluar vetë për gjenotipizimin e SNP me ose pa një gjenom referimi.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq -
Illumina dhe BGI
Teknologjia e sekuencës Illumina, e bazuar në Sequencing by Synthesis (SBS), është një risi NGS e përqafuar globalisht, përgjegjëse për gjenerimin e mbi 90% të të dhënave të renditjes në botë.Parimi i SBS përfshin imazhin e terminatorëve të kthyeshëm të etiketuar në mënyrë fluoreshente ndërsa çdo dNTP shtohet, dhe më pas ndahet për të lejuar përfshirjen e bazës tjetër.Me të katër dNTP-të e kthyeshme të lidhura me terminatorë të pranishëm në çdo cikël renditjeje, konkurrenca natyrore minimizon paragjykimet e inkorporimit.Kjo teknologji e gjithanshme mbështet si bibliotekat me lexim të vetëm ashtu edhe bibliotekë me fund të çiftuar, duke ofruar një sërë aplikacionesh gjenomike.Aftësitë e performancës së lartë dhe saktësia e sekuencës Illumina e pozicionojnë atë si një gur themeli në kërkimin e gjenomikës, duke i fuqizuar shkencëtarët të zbulojnë ndërlikimet e gjenomave me detaje dhe efikasitet të pakrahasueshëm.
DNBSEQ, i zhvilluar nga BGI, është një tjetër teknologji inovative NGS që ka arritur të ulë më tej kostot e renditjes dhe të rrisë xhiros.Përgatitja e bibliotekave DNBSEQ përfshin fragmentimin e ADN-së, përgatitjen e ssDNA dhe amplifikimin e rrethit rrotullues për të marrë nanotopat e ADN-së (DNB).Këto më pas ngarkohen në një sipërfaqe të fortë dhe më pas renditen me anë të Sintezës Kombinuese Sonda-Spiruese (cPAS).
Shërbimi ynë i sekuencës së bibliotekave të përgatitur paraprakisht lehtëson klientët në përgatitjen e bibliotekave të tyre të renditjes nga burime të ndryshme (mRNA, gjenomi i plotë, amplikon, ndër të tjera).Më pas, këto biblioteka mund të dërgohen në qendrat tona të sekuencës për kontrollin dhe renditjen e cilësisë në platformat Illumina ose BGI.
