-
Sekuenca e imunoprecipitimit të kromatinës (ChIP-seq)
ChIP-Seq siguron profilizimin e gjerë të gjenomit të objektivave të ADN-së për modifikimin e histonit, faktorët e transkriptimit dhe proteinat e tjera të lidhura me ADN-në.Ai kombinon selektivitetin e imuno-precipitimit të kromatinës (ChIP) për të rikuperuar komplekse specifike proteine-ADN, me fuqinë e sekuencës së gjeneratës së ardhshme (NGS) për sekuencimin me performancë të lartë të ADN-së së rikuperuar.Për më tepër, për shkak se komplekset protein-ADN rikuperohen nga qelizat e gjalla, vendet e lidhjes mund të krahasohen në lloje dhe inde të ndryshme qelizash ose në kushte të ndryshme.Aplikimet variojnë nga rregullimi i transkriptimit në rrugët e zhvillimit te mekanizmat e sëmundjes dhe më gjerë.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekuenca e bisulfiteve të gjenomit të plotë
Metilimi i ADN-së në pozicionin e pestë në citozinë (5-mC) ka një ndikim themelor në shprehjen e gjeneve dhe aktivitetin qelizor.Modelet jonormale të metilimit janë shoqëruar me disa kushte dhe sëmundje, si kanceri.WGBS është bërë standardi i artë për studimin e metilimit në të gjithë gjenomin me rezolucion bazë të vetme.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Analiza për kromatinën e aksesueshme nga transposaza me sekuencë të përçueshmërisë së lartë (ATAC-seq)
ATAC-seq është një metodë e sekuencës me performancë të lartë për analizën e aksesueshmërisë së kromatinës në të gjithë gjenomin, e cila është e rëndësishme për kontrollin global epigjenetik të shprehjes së gjeneve.Përshtatësit e renditjes futen në rajonet e hapura të kromatinës nga transpozaza hiperaktive Tn5.Pas amplifikimit të PCR-së, ndërtohet një bibliotekë sekuencash.Të gjitha rajonet e hapura të kromatinës mund të merren nën një kusht specifik hapësinor-kohor, jo vetëm të kufizuar në vendet lidhëse të një faktori transkriptimi ose një rajoni të caktuar të modifikuar me histon.
-
Sekuenca bisulfite me përfaqësim të reduktuar (RRBS)
Hulumtimi i metilimit të ADN-së ka qenë gjithmonë një temë e nxehtë në kërkimin e sëmundjeve dhe është e lidhur ngushtë me shprehjen e gjeneve dhe tiparet fenotipike.RRBS është një metodë e saktë, efikase dhe ekonomike për kërkimin e metilimit të ADN-së.Pasurimi i rajoneve të promotorit dhe ishullit CpG me ndarje enzimatike (Msp I), i kombinuar me sekuencën e bisulfitit, siguron zbulimin e metilimit të ADN-së me rezolucion të lartë.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
