-
Sekuenca e amplikonit PacBio-me gjatësi të plotë 16S/18S/ITS
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) është zhvilluar me vite përvojë në analizën e projektit të diversitetit mikrobik, i cili përmban analiza bazë të standardizuar dhe analiza të personalizuara: analiza bazë mbulon përmbajtjen e analizës kryesore të kërkimit aktual mikrobik, përmbajtja e analizës është e pasur dhe gjithëpërfshirëse, dhe rezultatet e analizës janë paraqitur në formën e raporteve të projektit;Përmbajtja e analizës së personalizuar është e larmishme.Mostrat mund të zgjidhen dhe parametrat mund të vendosen në mënyrë fleksibël sipas raportit bazë të analizës dhe qëllimit të kërkimit, për të realizuar kërkesat e personalizuara.Sistemi operativ Windows, i thjeshtë dhe i shpejtë.
-
PacBio-Transkriptomë me gjatësi të plotë (jo referencë)
Duke marrë si hyrje të dhënat e sekuencës së izoformës së Pacific Biosciences (PacBio), ky aplikacion është në gjendje të identifikojë sekuencat e transkriptit me gjatësi të plotë (pa montim).Duke hartuar sekuencat me gjatësi të plotë kundrejt gjenomit të referencës, transkriptet mund të optimizohen nga gjenet e njohura, transkriptet, rajonet koduese, etj. Në këtë rast, mund të arrihet identifikimi më i saktë i strukturave të mARN-së, si p.sh. bashkimi alternativ, etj.Analiza e përbashkët me të dhënat e sekuencës së transkriptomeve NGS mundëson shënime më gjithëpërfshirëse dhe kuantifikimin më të saktë në shprehje në nivel transkripti, gjë që përfiton kryesisht shprehjen diferenciale në rrjedhën e poshtme dhe analizën funksionale.
-
Paketat e veglave
BMKCloud është një platformë lider bioinformatike që ofron zgjidhje me një ndalesë për programet gjenomike, e cila është e besuar gjerësisht nga studiues në fusha të ndryshme, duke përfshirë ato mjekësore, bujqësore, mjedisore, etj. , burime kompjuterike, bazë të dhënash publike, kurse bioinformtike në internet, etj. BMKCloud ka mjete të ndryshme bioinformatike të përdorura shpesh duke përfshirë shënimin e gjeneve, mjetet gjenetike evolucionare, ncARN, kontrollin e cilësisë së të dhënave, montimin, shtrirjen, nxjerrjen e të dhënave, mutacionet, statistikat, gjeneratorin e figurave, sekuencën analiza etj.
-
ARN e vogël
ARN-të e vogla janë një lloj ARN-je e shkurtër jo-koduese me gjatësi mesatare 18-30 nt, duke përfshirë miRNA, siRNA dhe piRNA.Këto ARN të vogla janë raportuar masivisht të përfshihen në procese të ndryshme biologjike si degradimi i mARN-së, frenimi i përkthimit, formimi i heterokromatinës, etj. Analiza e sekuencës së ARN-së së vogël është aplikuar gjerësisht në studimet mbi zhvillimin e kafshëve/bimëve, sëmundjeve, viruseve, etj. ARN e vogël Platforma e analizës së sekuencës përbëhet nga analiza standarde dhe miniera e avancuar e të dhënave.Në bazë të të dhënave të ARN-seq, analiza standarde mund të arrijë identifikimin dhe parashikimin e miRNA, parashikimin e gjenit të synuar të miRNA, analizën e shënimit dhe të shprehjes.Analiza e avancuar mundëson kërkimin dhe nxjerrjen e personalizuar të miRNA, gjenerimin e diagramit Venn, miRNA dhe ndërtimin e rrjetit të gjenit të synuar.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS është një platformë e tërë e analizës së ri-sekuencës së gjenomit, e cila është zhvilluar në bazë të përvojës së pasur në Biomarker Technologies.Kjo platformë e lehtë për t'u përdorur lejon paraqitjen e shpejtë të një fluksi pune analize të integruar duke vendosur thjesht disa parametra bazë, që përshtaten për të dhënat e sekuencës së ADN-së të krijuara nga platforma Illumina dhe platforma e sekuencës BGI.Kjo platformë është vendosur në serverin kompjuterik me performancë të lartë, i cili fuqizon analizën shumë efikase të të dhënave në një kohë shumë të kufizuar.Minierat e personalizuara të të dhënave janë të disponueshme në bazë të analizave standarde, duke përfshirë pyetjen e gjeneve të mutuara, dizajnin e primerit PCR, etj.
-
mRNA (referencë)
Transkriptomi është lidhja midis informacionit gjenetik gjenomik dhe proteomës së funksionit biologjik.Rregullimi i nivelit të transkriptimit është mënyra më e rëndësishme dhe më e studiuar e rregullimit të organizmave.Sekuenca e transkriptomit mund të renditë transkriptomin në çdo moment në kohë ose në çdo kusht, me një rezolucion të saktë në një nukleotid të vetëm. Ai mund të pasqyrojë në mënyrë dinamike nivelin e transkriptimit të gjeneve, njëkohësisht të identifikojë dhe kuantifikojë transkriptet e rralla dhe normale dhe të sigurojë informacionin strukturor të mostra të transkripteve specifike.
Aktualisht, teknologjia e sekuencës së transkriptomit është përdorur gjerësisht në agronomi, mjekësi dhe fusha të tjera kërkimore, duke përfshirë rregullimin e zhvillimit të kafshëve dhe bimëve, përshtatjen mjedisore, ndërveprimin imunitar, lokalizimin e gjeneve, evolucionin gjenetik të specieve dhe zbulimin e sëmundjeve tumorale dhe gjenetike.
-
Metagjenomika (NGS)
Kjo platformë analize është krijuar për analizën e të dhënave metagjenomike të armëve gjahu në bazë të përvojës shumëvjeçare.Ai përbëhet nga fluksi i integruar i punës që përmban analiza të ndryshme metagjenomike të nevojshme zakonisht duke përfshirë përpunimin e të dhënave, studimet e nivelit të specieve, studimet e nivelit të funksionit të gjeneve, lidhjen e metagjenomeve, etj. , vendosja e parametrave, gjenerimi i personalizuar i figurave, etj.
-
LncARN
ARN-të e gjata jo-koduese (lncARN) janë një lloj transkripti me gjatësi më të madhe se 200 nt, të cilat nuk janë në gjendje të kodojnë proteinat.Dëshmitë akumuluese sugjerojnë se shumica e lncARN-ve ka shumë të ngjarë të jenë funksionale.Teknologjitë e sekuencave me performancë të lartë dhe mjetet e analizës bioinformatike na fuqizojnë të zbulojmë sekuencat e lncARN-së dhe informacionin e pozicionimit në mënyrë më efikase dhe na çojnë në zbulimin e lncARN-ve me funksione rregullatore vendimtare.BMKCloud është krenar që u ofron klientëve tanë platformën e analizës së sekuencës së lncRNA për të arritur një analizë të shpejtë, të besueshme dhe fleksibël të lncRNA.
-
GWAS
Studimi i shoqatës së gjenomit (GWAS) synon të identifikojë variantet gjenetike (gjenotip) që lidhen me tipare specifike (fenotip).Studimet GWA hulumtojnë shënuesit gjenetikë të kryqëzuar me gjenomën e plotë të një numri të madh individësh dhe parashikojnë lidhjet gjenotip-fenotip me anë të analizave statistikore në nivel popullate.Risekuenca e të gjithë gjenomit mund të zbulojë potencialisht të gjitha variantet gjenetike.Duke u bashkuar me të dhënat fenotipike, GWAS mund të përpunohet për të identifikuar SNP-të, QTL-të dhe gjenet kandidate të lidhura me fenotipin, gjë që mbështet fuqimisht mbarështimin modern të kafshëve/bimëve.SLAF është një strategji e thjeshtuar e sekuencës së gjenomit e zhvilluar vetë, e cila zbulon shënuesit e shpërndarë në të gjithë gjenomin, SNP.Këto SNP, si shënues gjenetikë molekularë, mund të përpunohen për studime të lidhjes me tipare të synuara.Është një strategji me kosto efektive në identifikimin e variacioneve gjenetike të tipareve komplekse.
-
Nanopore transkriptomika me gjatësi të plotë
Izoformat alternative komplekse dhe të ndryshueshme në organizma janë mekanizma gjenetikë të rëndësishëm për rregullimin e shprehjes së gjeneve dhe diversitetit të proteinave.Identifikimi i saktë i strukturave të transkriptit është baza për studimin e thelluar të modeleve të rregullimit të shprehjes së gjeneve.Platforma e sekuencës Nanopore ka sjellë me sukses studimin transkriptomik në nivelin e izoformës.Kjo platformë analize është krijuar për të analizuar të dhënat e ARN-Seq të krijuara në platformën Nanopore në bazë të gjenomit të referencës, e cila arrin analiza cilësore dhe sasiore si në nivelin e gjeneve ashtu edhe në nivelin e transkripteve.
-
rreth-ARN
ARN rrethore (circARN) është një lloj ARN jo-koduese, e cila kohët e fundit është gjetur se luan një rol jetik në rrjetet rregullatore të përfshira në zhvillimin, rezistencën mjedisore, etj. Ndryshe nga molekulat lineare të ARN-së, p.sh. mARN, lncARN, 3' dhe 5' skajet e circARN janë bashkuar së bashku për të formuar një strukturë rrethore, e cila i shpëton ata nga tretja e ekzonukleazës dhe janë më të qëndrueshme se shumica e ARN lineare.CircRNA është gjetur të ketë funksione të ndryshme në rregullimin e shprehjes së gjeneve.CircRNA mund të funksionojë si ceRNA, e cila lidh miRNA në mënyrë konkurruese, e njohur si sfungjer miRNA.Platforma e analizës së sekuencës së CircRNA fuqizon strukturën dhe analizën e shprehjes së circRNA, parashikimin e objektivit dhe analizën e përbashkët me llojet e tjera të molekulave të ARN-së
-
BSA
Platforma Bulked Segregant Analysis përbëhet nga analiza standarde me një hap dhe analiza e avancuar me vendosjen e parametrave të personalizuar.BSA është një teknikë e përdorur për të identifikuar shpejt shënuesit gjenetikë të lidhur me fenotipin.Rrjedha kryesore e punës së BSA përmban: 1. përzgjedhjen e dy grupeve të individëve me fenotipe jashtëzakonisht të kundërta;2. bashkimi i ADN-së, ARN-së ose SLAF-seq (Zhvilluar nga Biomarker) të të gjithë individëve për të formuar dy pjesë të ADN-së;3. identifikimi i sekuencave diferenciale kundrejt gjenomit të referencës ose ndërmjet tyre, 4. parashikimi i rajoneve të lidhura kandidate me anë të algoritmit ED dhe indeksit SNP;5. Analiza funksionale dhe pasurimi i gjeneve në rajonet kandidate, etj. Minierat më të avancuara të të dhënave duke përfshirë ekzaminimin e shënuesve gjenetikë dhe dizajnin e primerit janë gjithashtu të disponueshme.
