Ndërsa sekuenca e mRNA me bazë NGS shërben si një mjet i gjithanshëm për përcaktimin sasior të shprehjes së gjeneve, mbështetja e tij në leximet e shkurtra kufizon efikasitetin e tij në analizat komplekse transkriptomike.Sekuenca PacBio (Iso-Seq), nga ana tjetër, përdor teknologjinë e lexuar gjatë, duke mundësuar renditjen e transkripteve të mRNA me gjatësi të plotë.Kjo qasje lehtëson një eksplorim gjithëpërfshirës të bashkimit alternativ, shkrirjeve të gjeneve dhe poliadenilimit, megjithëse nuk është zgjedhja kryesore për kuantifikimin e shprehjes së gjeneve.Kombinimi 2+3 mbush hendekun midis Illumina dhe PacBio duke u mbështetur në leximet e HiFi të PacBio për të identifikuar grupin e plotë të izoformave të transkriptimit dhe renditjen NGS për përcaktimin sasior të të njëjtave izoforma.
Platformat: PacBio Sequel II dhe Illumina NovaSeq