Sekuenca e transkriptomeve me gjatësi të plotë bazuar në nanopore
Sekuenca e nanoporeve dallohet nga platformat e tjera të sekuencës, në atë që nukleotidet lexohen drejtpërdrejt pa sintezën e ADN-së dhe gjenerojnë lexime të gjata në dhjetëra kilobazë.Kjo fuqizon leximin e drejtpërdrejtë të transkripteve të plota dhe trajtimin e sfidave në studimet transkriptomike.
√ Paragjykim i ulët i sekuencës specifike
√ Leximi i plotë i cDNA për studime të strukturës së gjeneve
√ Kërkohen më pak të dhëna për të mbuluar të njëjtin numër transkriptesh
√ Identifikimi i izoformave të shumta për gjen
√ Kuantifikimi i shprehjes në nivelin e izoformës
Tubacioni tipik i Bioinformatikës
Rastet më të fundit të suksesshme me Biomarker Technologies
1. Analizat krahasuese të transkriptomeve me gjatësi të plotë zbulojnë dinamikën e zhvillimit të kërcellit Gnetum luofuense
Revista: Kufijtë në Gjenetikë
Publikuar: Mars 2021
Fjalë kyçe: MinION |Ndarja alternative |APA |lncARN |Transkriptet e shprehura në mënyrë diferenciale
Lexoni tekstin e plotë
2. Lëvizja e njëanshme e ARN-ve të vogla nga lastarët te rrënjët në heterograftet ndërspecifike
Revista: Bimët e natyrës
Publikuar: Janar 2021
Fjalë kyçe: Nanopore |Illumina |zbulimi i mARN-së celulare me gjatësi të plotë
3. Analiza transkriptome e plotë e rrënjëve të asparagut zbulon mekanizmin molekular të tolerancës ndaj kripës të shkaktuar nga kërpudhat arbuskulare mikorizale
Revista: Botanikë Mjedisore dhe Eksperimentale
Publikuar: Janar 2021
Fjalë kyçe: MinION |Transkriptet e shprehura në mënyrë diferenciale |Faktorët e transkriptimit |Ndarja alternative
4. Ndryshimet karakteristike fiziologjike dhe transkriptimi i plotë i rrënjëve dhe gjetheve të trëndafilit (Rosa chinensis) në përgjigje të stresit të thatësirës
Revista: Fiziologjia e bimëve dhe qelizave
Publikuar: Tetor 2020
Fjalë kyçe: PromethION |Transkriptet e shprehura në mënyrë diferenciale |Parashikimi funksional |Izoformat e bashkuara |TF dhe lncARN
5. Analiza dhe krahasimi gjithëpërfshirës i sekuencës së ARN-së me bazë PacBio dhe nanopore të transkriptomës Arabidopsis
Ditari: Metoda e bimëve
Publikuar: Prill 2020
Fjalë kyçe: GridION |PromethION |Vazhdimi i PacBio |Illumina NovaSeq |Rreshtimi i gjenomit |Identifikimi i transkriptit |Ndarja alternative |SSR |LncARN |Kuantifikimi i izoformës
Lajme dhe pika kryesore synon të ndajë rastet më të fundit të suksesshme me Biomarker Technologies, duke kapur arritjet e reja shkencore si dhe teknikat e spikatura të aplikuara gjatë studimit.
Koha e postimit: Jan-08-2022