MIKROBIAL
Pajtueshmëria bakteriale dhe imobilizimi me biokar përmirëson degradimin e tebukonazolit, përbërjen dhe funksionimin e mikrobiomit të tokës
Sekuenca e amplikonit 16S me gjatësi të plotë |PacBio HiFi |Diversiteti alfa |Diversiteti beta
Në këtë studim, sekuenca e amplikonit 16S me gjatësi të plotë nga PacBio dhe analiza bioinformatike u siguruan nga Biomarker Technologies.
Pikat kryesore
Bakteret degraduese të tebukonazolit të imobilizuara me biokar Alcaligenes faecalis WZ-2 u studiuan mbi efikasitetin e biodegradimit dhe ndikimin në tokën e kontaminuar me tebukonazol në krahasim me shtamin degradues të lirë WZ-2.
1. WZ-2 i imobilizuar me biokar, tregoi një degradim më efikas të tebukonazolit krahasuar me WZ-2 të lirë duke reduktuar gjysmën e jetës së tebukonazolit në tokë nga 18.7 ditë në 13.3 ditë.
2. WZ-2 i imobilizuar me biokaranë ishte në gjendje të rivendoste aktivitetet e enzimës mikrobike vendase të tokës, duke përfshirë ureazën, dehidrogjenazën dhe invertazën, etj.
3. Profili mikrobik në tokën e trajtuar me WZ-2 të imobilizuar me biokarburant, i përcaktuar nga sekuenca 16S me gjatësi të plotë, mbështetet fuqishëm se ky sistem mund të rivendoste shëndetin e tokës duke përmirësuar strukturën e komunitetit bakterial nën kontaminimin me tebukonazol.
Eksperimenti (në lidhje me renditjen)
Grupimi: CK: Tokë natyrale;T: Tokë e mbushur me tebukonazol;S: Tebukonazoli përmbante tokë me tendosje të lirë WZ-2;BC: Tebukonazoli përmbante tokë me biokar;BCS: Tebukonazoli përmbante tokë me biokar të imobilizuar WZ-2.
Marrja e mostrave: Ekstraktimi total i ADN-së së tokës i përforcuar nga primerët 16S rADN
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) dhe 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),duke penduar rADN 16S me gjatësi të plotë
Platforma e renditjes: PacBio RS II
Strategjia e renditjes: lexon CCS HIFI
Analiza e të dhënave:BMKCloudPlatforma bioinformatike e bën peshkun e kuq një model të shkëlqyer gjenetik për fiziologjinë dhe evolucionin e peshkut.
Rezultati
Struktura e komunitetit mikrobial të tokës u përcaktua nga sekuenca 16S rADN.Indeksi i pasurisë OTU dhe diversitetit alfa, duke përfshirë indekset Chao1, Ace, Shannon dhe Simpson u vlerësuan për të zbuluar diversitetin e specieve në secilin sistem.Pas 60 ditësh inkubacion, të gjithë indekset treguan tendencë të ngjashme, p.sh. tebukonazoli mund të nxiste reduktimin e pasurisë së specieve dhe diversitetit në tokë.Sidoqoftë, duke shtuar shtamin WZ-2, komuniteti i baktereve të tokës u rikuperua pjesërisht si në aspektin e pasurisë ashtu edhe të diversitetit.Diferenca e kufizuar u vu re midis BC, BCS dhe CK, duke treguar se biokari dhe WZ-2 i imobilizuar me biokar mund të rivendosin në mënyrë efektive shëndetin biologjik të tokës.
Metoda e papeshuar e grupeve të çifteve me mesatare aritmetike (UPGMA) u aplikua në këtë studim për të treguar diversitetin beta midis grupeve.Siç tregohet në figurën e mëposhtme, BC, BSC dhe CK ndanë model më të ngjashëm të përbërjes mikrobiale në krahasim me grupin T dhe S, gjë që tregoi më tej se futja e biokararit në bioremedicionin e tokës të kontaminuar me tebukonazol mund të lehtësojë në masë të madhe rikuperimin e komunitetit mikrobik në tokë.
Figura.Grumbullimi UPGMA i komunitetit bakterial në nivel grupi nën trajtim të ndryshëm
Referenca
Sun, Tong, etj."Përputhshmëria bakteriale dhe imobilizimi me biokar përmirëson degradimin e tebukonazolit, përbërjen dhe funksionimin e mikrobiomit të tokës."Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Lajme dhe pika kryesore synon të ndajë rastet më të fundit të suksesshme me Biomarker Technologies, duke kapur arritjet e reja shkencore si dhe teknikat e spikatura të aplikuara gjatë studimit.
Koha e postimit: Jan-08-2022