Produktet

Analiza e Shoqatës së Gjenomit

Imazhi i veçuar i analizës së asociacionit në të gjithë gjenomin

Studimi i shoqatës së gjenomit (GWAS) synon të identifikojë variantet gjenetike (gjenotip) që lidhen me tipare specifike (fenotip).Studimi GWAS heton shënuesit gjenetikë të kryqëzuar të gjenomit të një numri të madh individësh dhe parashikon lidhjet gjenotip-fenotip me anë të analizave statistikore në nivel popullate.Është aplikuar gjerësisht në kërkimet mbi sëmundjet njerëzore dhe minierat funksionale të gjeneve në tipare komplekse të kafshëve ose bimëve.

Na kontaktoni

Detajet e Shërbimit

Rezultati i demonstrimit

Publikimi i veçuar

1.Përparësitë e Shërbimit

● Raste të bollshme projektesh: që nga themelimi i saj në 2009, BMKGENE ka përfunduar qindra projekte të specieve në kërkimin e popullatës GWAS, ka ndihmuar studiuesit të publikojnë më shumë se 100 artikuj dhe faktori i ndikimit kumulativ ka arritur në 500.
● Analistë profesionistë.
● Cikli i shkurtër i analizës.
● Minim i saktë i të dhënave.

2. Specifikimet e Shërbimit

Lloji	Shkalla e Popullsisë	Strategjia dhe thellësia e renditjes
SLAF-GWAS	Numri i mostrës ≥200	Madhësia e gjenomit < 400 M, me ref-gjenom, rekomandohet WGS
		Madhësia e gjenomit ≤ 1G, 100K etiketa dhe 10X
		1G ≤ Madhësia e gjenomit ≤ 2G, 200K etiketa dhe 10X
		Madhësia e gjenomit > 2G, 300K etiketa dhe 10X
WGS-GWAS	Numri i mostrës ≥200	10X për çdo mostër

3. Përzgjedhja e materialit

Varietetet e ndryshme, nënllojet, racat tokësore/bankat e gjeneve/familjet e përziera/burimet e egra

Varietete të ndryshme, nëngrupe, raca vendase

Familje gjysmake/familje plot sib/burime të egra

4. Analiza e bioinformacionit

● Analiza e asociacionit në të gjithë gjenomin
● Analiza dhe shqyrtimi i SNP të rëndësishme
● Shënimi funksional i gjenit kandidat

5. Rrjedha e punës së shërbimit

Dizajni i eksperimentit

Dorëzimi i mostrës

Ekstraktimi i ARN-së

Ndërtimi i bibliotekës

Sekuenca

Analiza e të dhënave

Shërbimet pas shitjes

E mëparshme: Sekuenca e ARN-së me një bërthamë

Tjetër:

a.Fenotipi QC

Histogrami i shpërndarjes së frekuencës

Statistikat e fenotipeve

b.Analiza e shoqërimit (Modeli: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Komplot QQ

Komploti i Manhatanit

viti	Ditar	IF	Titulli
2022	NC	17.69	Baza gjenomike e giga-kromozomeve dhe giga-gjenomit të bozhures së pemës Paeonia ostii
2015	NP	7.43	Gjurmët e zbutjes ankorojnë rajone gjenomike me rëndësi agronomike në kokrrat e sojës
2018	MP	9.32	Resekuenca e plotë e gjenomit të një koleksioni mbarëbotëror të ngjitjeve të rapave zbulon bazën gjenetike të divergjencës së tyre ekotip
2022	HR	7.29	Analiza e lidhjes në të gjithë gjenomin ofron njohuri molekulare në ndryshimin natyror të madhësisë së farës së shalqirit