● Strategjitë e shumëfishta të renditjes të disponueshme për qëllime të ndryshme kërkimore
● Me përvojë të lartë në montimin e gjenomit të kërpudhave me mbi 10,000 gjenom të kompletuar pene.
● Ekipi profesional i mbështetjes teknike pas shitjes që plotëson nevoja kërkimore më specifike.
Shërbimi | Strategjia e renditjes | Cilësi e garantuar | Koha e parashikuar e rrotullimit |
Harta e imët e kërpudhave | Illumina 50X+Nanopore 100X | Vazhdo N50≥2 Mb | 35 ditë pune |
PacBio HiFi 30X | |||
Fungal pene-hartë e plotë | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Raporti i ankorimit të kromozomit >90% | 45 ditë pune |
● Kontrolli i cilësisë së të dhënave të papërpunuara
● Asambleja e gjenomit
● Analiza e komponentëve të gjenomit
● Shënimi i funksionit të gjenit
● Analiza gjenomike krahasuese
PërEkstraktet e ADN-së:
Lloji i mostrës | Shuma | Përqendrimi | Pastërti |
Ekstraktet e ADN-së | > 1.2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Për mostrat e indeve:
Lloji i mostrës | Trajtimi i rekomanduar i mostrës | Magazinimi dhe dërgesa e mostrave |
Kërpudhat njëqelizore | Vëzhgoni majanë nën mikroskop dhe mblidhni ato në fazën e tyre eksponenciale Transferoni kulturën (që përmban përafërsisht 3-4,5e9 qeliza) në një eppendorf 1,5 ose 2 ml.(Mbani në akull) Centrifugo tubin për 1 min në 14000 g për të mbledhur bakteret dhe për të hequr supernatantin me kujdes Mbyllni tubin dhe ngrini bakteret në azot të lëngshëm për të paktën 1-3 orë.Ruajeni tubin në frigorifer -80 ℃. | Ngrini mostrat në azot të lëngshëm për 3-4 orë dhe ruajini në azot të lëngshëm ose -80 gradë deri në rezervim afatgjatë.Kërkohet dërgimi i mostrës me akull të thatë. |
Kërpudhat makro | Indet në fazën e rritjes aktive rekomandohen. Shpëlajeni indin me ujë pa endotoksina, më pas 70% etonal. Ruani kampionin në krio-tuba. |
1.Diagrami i Circos mbi komponentët gjenomikë të kërpudhave
2.Analiza gjenomike krahasuese: Pema filogjenetike