Gërmoni në potencialin e studimit të shumëllojshmërisë së egër të specieve kërkimore, të ilustruar nga një rast kryesor nga klientët e BMKGENE.Botuar së fundmi në edicionin e këtij viti të Revistës së Bioteknologjisë së Bimëve, artikulli i titulluar "Genomi Wild Hevea brasiliensis në nivel kromozomi: Fuqizimi i mbarështimit të asistuar nga gjenomi dhe zbulimi i vendndodhjeve vitale për rendimentin e lartë të gomës" qëndron si një referencë e vlefshme.
Pema e gomës braziliane (Hevea brasiliensis) qëndron e lartë si një burim kryesor natyror gome.Gjatë gjithë shekullit të kaluar, metodologjitë tradicionale të mbarështimit shkaktuan një rritje të jashtëzakonshme të gjashtëfishtë të prodhimit të gomës.Megjithatë, themeli gjenetik themelor përgjegjës për rritjen e mundshme të rendimentit të gomës mbetet enigmatik.
Ky studim filloi ndërtimin e një gjenomi në nivel kromozomi për pemën e gomës së egër, duke përdorur një sinergji të sekuencës së lexuar gjatë Nanopore, sekuencës Illumina NGS dhe teknologjisë Hi-C.
Paralelisht, një grumbull prej 147 burimesh germplazmash, që përfshin variacione me rendiment të lartë, shtame të egra dhe specie të ngjashme, u mblodh për rirenditjen gjithëpërfshirëse të gjenomit (WGS) duke përdorur platformën Illumina.Të dhënat e renditjes që pasuan iu nënshtruan analizave rigoroze të gjenetikës së popullsisë, duke mundësuar diseksionin e strukturës së popullsisë, diversitetit dhe disekuilibrit të lidhjes.Kjo analizë hodhi dritë mbi variacionet e zbutjes midis popullatave.
Hetimet e mëtejshme përfshinin analiza që përfshijnë Fst, π, Tajima's D dhe LD, me qëllim zbulimin e sinjaleve të përzgjedhjes që dalin nga rendimenti i përmirësuar i lateksit, veçanërisht duke u fokusuar në klonet Wickham.
Duke arritur kulmin në një analizë të asociacionit të gjenomit (GWAS), shënuesit e lidhur me tiparet e rendimentit dhe më pas gjenet e lidhura me rendimentin u vunë në dukje.Vlefshmëria fillestare zbuloi aktivitete të veçanta transkriptimi nëpër mutant të ndryshëm për dy gjene ERF, duke ofruar një vështrim paraprak në rëndësinë e tyre funksionale.Vërtetimi i mëtejshëm është planifikuar brenda hulumtimeve të ardhshme.
BMKGENE krenohet që kontribuon në rirenditjen e gjerë të gjenomit të kësaj popullate të konsiderueshme, së bashku me një rol thelbësor në analizën e bioinformatikës.Përvoja jonë e gjerë përfshin sekuencën NGS/TGS dhe analizën e bioinformatikës multiomike në një grup prej 1000+ speciesh.Ne mezi presim mundësinë e partneritetit me ju në projektet tuaja të ardhshme.
Kliko këtu për tëmësoni më shumë rreth këtij studimi
Koha e postimit: 29 gusht 2023