BMKCloud Log in
条形 banner-03

Produktet

Sekuenca e ADN/ARN-së – Sekuencuesi Nanopore

Sekuenca ONT është një teknologji e renditjes së sinjaleve elektrike me një molekulë në kohë reale e bazuar në nanopore, parimi i sekuencës së secilës platformë është i njëjtë.ADN/ARN me dy zinxhirë do të lidhet me proteinën nanoporoze të ngulitur në biofilm dhe do të zbërthehet nën drejtimin e proteinës motorike, nën veprimin e ndryshimit të tensionit nga të dy anët e biofilmit, vargjet e ADN/ARN-së kalojnë nëpër proteinën e kanalit nanopore në një farë mase. norma.Për shkak të dallimeve të vetive kimike të bazave të ndryshme në vargun ADN/ARN, kur një bazë e vetme ose molekulë e ADN-së kalon nëpër kanalin nanopore, do të shkaktojë ndryshimin e sinjaleve të ndryshme elektrike.Duke zbuluar dhe korresponduar me këto sinjale, mund të llogariten llojet përkatëse të bazës dhe mund të përfundojë zbulimi në kohë reale i sekuencës.


Detajet e Shërbimit

Rezultati i demonstrimit

Karakteristikat e Detajeve të Shërbimit

Platforma

Madhësia e Bibliotekës

Rendimenti teorik i të dhënave (për qelizë)

Saktësia me një bazë

Aplikacionet

Nanopore

8 Kb, 10 kb, 20 kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90 Gb/qelizë

85-92%

Thirrja SV, De novo, Sekuenca me gjatësi të plotë, Iso-Seq, Shënimi i gjeneve, Zbulimi i metilimit të ADN-së

Avantazhet e Shërbimit

● Eksperiencë mbi 5 vjet në platformën e sekuencës PacBio me mijëra projekte të mbyllura me specie të ndryshme.
● BMKGENE është një partner zyrtar i Oxford Nanopore, me certifikatë të dyfishtë ARN/ADN.
● Ekzistojnë modele të zakonshme të sekuencuesve me pajisje të plota dhe xhiro të mjaftueshme të sekuencës.
● Bazuar në platformën Nanopore, më shumë se 10 kërkime mbi kafshët dhe bimët Denovo janë botuar në revista me famë ndërkombëtare.

Kërkesat e mostrës


Lloji i mostrës

Shuma

Përqendrimi (Qubit ®)

Vëllimi

Pastërti

Të tjerët

ADN gjenomike

Varet nga kërkesat e të dhënave

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Pika e pastër në 260 nm, pa ndotje

Përqendrimi duhet të matet me Qubit dhe Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN totale

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0.5-2.5;pa kontaminime

Vlera RIN ≥7,5

 

Rrjedha e punës së shërbimit

përgatitja e mostrës

Përgatitja e mostrës

Përgatitja e Bibliotekës

Ndërtimi i bibliotekës

Sekuenca

Sekuenca

Analiza e të dhënave

Analiza e të dhënave

Shembull QC

Ofrimi i projektit


  • E mëparshme:
  • Tjetër:

  • Vlerësimi i cilësisë së të dhënave të mostrës së ADN-së

    Tabela 1. Statistikat mbi të dhënat e pastra.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    pasteSeqNum

    cleanSumBase

    pastërN50Len

    pastërN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    pastërMeanQual

    ADN_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15764

    23,090

    143,181

    9

    Vlerësimi i cilësisë së të dhënave të mostrës së ARN-së

    Tabela 1. Statistikat mbi të dhënat e pastra.

    Emri i skedarit

    ID-ja e klientit

    Numri i leximit

    Numri bazë

    N50

    Gjatësia mesatare

    Gjatesia maksimale

    Rezultati mesatar Q

    ARN_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    P12

    Figura 1. Lexoni shpërndarjen e gjatësisë

    A3

    Figura 2. Shpërndarja e rezultateve të cilësisë së të dhënave të pastra

    A4

    Figura 3. Shpërndarja e rezultateve të cilësisë dhe gjatësisë së të dhënave të pastra

    A5

    të marrë një kuotë

    Shkruani mesazhin tuaj këtu dhe na dërgoni

    Na dërgoni mesazhin tuaj: