HORUMARINTA GENOME
dabeecadda
XIRIIRKA
Tixanaha genome-ga ayaa muujinaya dariiqyada kala firdhisan ee caalamiga ah waxayna soo jeedinayaan la qabsiga hidde-sidaha isku dhafan ee horumarinta faras badeedka
PacBio |Illumina |Hi-C |WGS |Kala duwanaanshaha Hidde-raaca |Taariikhda Dadweynaha |Socodka Hidde
Isku xigxiga Pacbio, kulanka genome de novo iyo adeegyada tafatirka waxaa bixiyay Biomarker Technologies.
Tilmaamaha
1.Genom-ga tayada sare leh ee heerka koromosoomyada (Hippocampus erectus) genome oo leh contig N50 ee 15.5 Mb ah ayaa la helay.
2. Wadar dhan 358 genomes oo ka yimid adduunka oo dhan 21 nooc oo faras badeed ayaa la isku xig-xigay.
3.Horse-badeedku waxa ay ka soo baxeen Oligocene dabadii iyo dariiqyadii guumaysi-caalmiyeedka ee xigay waa la aqoonsaday oo waxa ay ku xidhan yihiin isbeddelka dhaqdhaqaaqa biyaha badda iyo furnaanshaha marin-badeedka paleotemporal
4.Aasaaska hidaha ee soo noqnoqda "lafaha lafaha" phenotype la qabsiga waxay ku xiran tahay beddelaadyo madax-bannaan oo ku jira hiddaha korriinka ee muhiimka ah.
5. Rafting iyada oo loo marayo mawjadaha badda waxay magdhow u tahay kala firdhinta liidata iyo la qabsiga degdega ah ee fududeeya gumeysiga degaano cusub
Guulihii
Jaantuska 1 Kala duwanaanshaha hidda-socodka iyo xidhiidhada phylogenetic ee 358 nooc oo faras badeed ah
aGoobo muunad juquraafi ah oo loogu talagalay faras badeed la muunadeeyay oo leh qaabab kala duwanaanshiyaha nucleotide (π) ee 21ka nooc ee faras badeedka oo dhan 22 koromosoomyada.b Geed deriska la ah oo lagu dhisay genom-ballaaran SNPs oo ah 358 faras badeed.Astaamaha biinanka goobta ee (a) iyo laanta asalka ah ee (b) waxay u dhigmaan midba midka kale.
Jaantuska 2 Gumeysiga iyo taariikhda tirakoobka fardaha badeedka
aGeedka Phylogenetic iyo qiyaasaha wakhtiga kala duwanaanshaha ee 21 nooc oo faras badeed ah.Dhumucda xariiqda laanta waxay u dhigantaa qiyaasaha cabbirka dadweynaha (Ne) midabadana waxay muujinayaan abtirsiinyo kala duwan.Calaamadaha I-III waxay muujinayaan dhibcooyinka cabbirka.b–d Dariiqyada gumeysiga ee la saadaaliyay (Falaaraha midabka leh) ee fardaha badeedka ee ku saleysan kala duwanaanta waqtiga, qeybinta, dhacdooyinka xikmada, iyo qulqulka badweynta (Falaaraha cad).b Jasiiradaha Indo-Australian-ka waxay ahayd xudunta asalka ah (calaamaynta cas) ee Hippocampus ka hor intaanay farad-badeedku kala duwanayn oo u kala firdhin caalamka 18-23 Ma.C Seahorses waxay markii hore u gumaysteen Badweynta Atlaantigga iyada oo loo sii marayo marinka Tethyan ee furan, kaas oo, xidhitaankiisa ka dib (Dhacdada Terminal inta lagu guda jiro 7-13 Ma), waxay ka soocday abtirsiinta Tethyan iyo abtirkeeda walaasheeda Badweynta Hindiya.Midda dambe, oo dabadeed si degdeg ah u kala-duwan (calaamad jaalle ah) ee Badda Carabta, iyada oo dhidibbada u taagtay xarun labaad oo kala-duwanaanshaha faras badeedka.Dhacdo gumeysi labaad oo faras badeed ah oo ka dhacday Badweynta Atlaantigga ayaa ka dhacday Badweynta Hindiya oo ku saabsan 5Ma iyadoo ka soo gudubtay cidhifka Koonfur Afrika, ugu dambayntii waxay soo gaadhay Badweynta Baasifigga Bari iyada oo sii martay marin badeedka Panama oo weli furan qiyaastii 3.6 Ma.
Jaantuska 3 Qulqulka hidda-wadaha iyo isbedbedelka baaxadda dadweynaha ee waxtarka leh
aQulqulka hidde-sidaha ayaa laga helay inta u dhaxaysa noocyada ku nool Koonfurta Badweynta Atlaantigga.Qulqulka hidda-wadaha waxaa lagu muujiyaa meelaha u dhow xadadka cad sida heerka guuritaanka ee laga jaray G-PhoCS.Dhumucda iyo jihada fallaaduhu waxay u dhigmaan heerarka iyo jihada socodka hidda-socodka, siday u kala horreeyaan.b Isbeddellada cabbirka dadweynaha ee waxtarka leh ee PSMC.dhidibka x waxa uu u taagan yahay wakhti sanado ka hor wakhtiga la joogo halka dhidibka y uu ka dhigan yahay cabbirka dadweynaha ee waxtarka leh.Jaantusyada waxaa loo habeeyey inta badan iyadoo loo eegayo qaybinta juqraafiga ee mid kasta oo ka mid ah noocyada leh meelo kala duwan oo qaybinta.c Heer baddu waxay isbedeshay 1 milyan sano ee la soo dhaafay mitir33.Xariiqda huruudda ah waxay tusinaysaa meesha ugu sarraysa ee glacial interglacial halka hadh cyan uu muujinayo xilliga ugu sarreeya ee glacial.
Jaantuska 4 Kobcinta laf dhabarta.
aBidix, Noocyada geedka oo muujinaya horumarka madaxbannaan ee laf dhabarta ee faras badeedka.Dhererka laanta ayaa tilmaamaysa tirada beddelka goob kasta.Afar nooc oo faras badeed lafdhabar u ah ayaa lagu muujiyay buluug.Laamaha dhumucdiisuna waxay u dhigmaan heerarka sare ee beddellada aan is-macnaha ahayn iyo kuwa isku midka ah (dN/dS) ee hiddo-wadaha bmp3.Imtixaanka Canonical iyo guud ahaan McDonald iyo Kreitman (MKT) ee hiddo-wadaha bmp3 waxaa loo sameeyay saddex nooc oo walaashiis ah oo leh astaamo kala duwan oo lafdhabarta ah iyo kuwa aan laf dhabarta ahayn oo lagu muujiyey midabada asalka ah, kuwaas oo heerarkooda muhiimka ah lagu muujiyey qiimaha p oo leh font buluug iyo casaan ah, siday u kala horreeyaan.Sax, isbarbardhigga beddelka amino acid ee borotiinka bmp3, polymorphic iyo beddelka go'an ee fardaha lafdhabarta leh ayaa lagu muujiyey goobo casaan iyo buluug ah, siday u kala horreeyaan.b Qaybinta qiyamka dN/dS ee bmp3 ee faras badeedka spiny marka la barbar dhigo noocyada aan laf dhabarta ahayn.c Kobcinta madax-bannaanida geedka phylogenetic ee dib loogu dhisay borotiinka lagu dhejiyay bmp3.d Isku-dhafka guud ee goobta isku-dhafan ee bmp3 gudaha Hippocampus erectus.
Tixraac
Li C iyo al.Tixanaha genome-ka ayaa muujinaya dariiqyada kala firdhisan ee caalamiga ah waxayna soo jeedinayaan la qabsiga hidde-sidaha isku dhafan ee horumarinta faras badeedka.Nat Commun.2021 Feb 17;12(1):1094.
Warar iyo Qodobo Muhiim ah ujeedadeedu tahay in la wadaago kiisaskii ugu dambeeyay ee lagu guulaystey Teknolojiyadda Biomarker, qabashada guulaha sayniska ee cusub iyo sidoo kale farsamooyinka caanka ah ee lagu dabaqay daraasadda.
Waqtiga boostada: Jan-06-2022