Falanqaynta Eukaryotic mRNA (oo tixraac leh)
Iyadoo lagu salaynayo taxanaha genome-ga la yaqaan iyo macluumaadka tafatirka, jiilka cusub ee xogta isku xigxiga sare leh (RNA-Seq) ayaa loo istcimaalaa gelinta ahaan, iyo goobaha cusub ee qoraalada (Hidoskoobyada cusub) iyo dhacdooyinka isbedbeddelka cusub ayaa la aqoonsaday.qiimaynta tayada xogta isku xigta;xogta isku xigxiga iyo isku xigxiga ee genome tixraaca ee la doortay, garashada xuduudaha exon / intron, falanqaynta kala duwanaanshaha hidda-socodka, sahaminta gobollada hiddo-wadaha iyo qoraallada cusub, aqoonsiga goobaha SNP ee gobolka la qoray, xadka u dhexeeya 3'iyo 5 hiddo-sideyaasha, iyo sharraxaadda shaqaynaysa iyo falanqaynta kobcinta ee muunado kala duwan (koox).
RNA-yada dheer ee aan codayn
RNA-yada dheer ee aan codeeyn (lncRNA) waa nooc qoraallo ah oo dhererkoodu ka dheer yahay 200 nt, kuwaas oo aan awoodin in ay codeeyaan borotiinada.Caddaynta urursan waxay soo jeedinaysaa in badi lncRNA-yada ay aad ugu dhowdahay inay shaqeeyaan.Tiknoolajiyada isku xigxiga-sare leh iyo aaladaha falanqaynta bioinformatic waxay nagu xoojiyaan inaan muujino taxanaha lncRNA iyo meelaynta macluumaadka si wax ku ool ah oo noo horseeda inaan ogaano lncRNAs oo leh hawlo sharciyeed oo muhiim ah.BMKCloud waxay ku faantaa inay siiso macaamiisheena madal falanqaynta taxanaha lncRNA si loo gaadho falanqeynta lncRNA degdeg ah, la isku halayn karo oo dabacsan.
16S/18S/ITS isku xigxiga amplicon
Madal falanqaynta kala duwanaanshaha microbial waxaa la horumariyay iyadoo sano oo waayo-aragnimo ah ee falanqaynta mashruuca kala duwanaansho microbial, kaas oo ka kooban falanqaynta aasaasiga ah jaangooyo iyo falanqaynta shakhsiyeed: falanqaynta aasaasiga ah daboolayaa content falanqaynta guud ee cilmi microbial hadda, content falanqaynta waa qani oo dhamaystiran, iyo natiijooyinka falanqaynta ayaa la soo bandhigay. qaabka warbixinnada mashruuca;Nuxurka falanqaynta shakhsi ahaaneed waa kala duwan.Tusaalooyinka waa la dooran karaa waxaana loo dejin karaa si dabacsan iyadoo loo eegayo warbixinta falanqaynta aasaasiga ah iyo ujeedada cilmi-baarista, si loo xaqiijiyo shuruudaha shakhsi ahaaneed.Nidaamka hawlgalka Windows, fudud oo degdeg ah.
Metagenomics Shotgun (NGS)
Xogta metagenomic waxaa loo isticmaalaa in lagu falanqeeyo walxaha genomic ee isku dhafan ee laga soo saaro muunado deegaanka, kaas oo siinaya macluumaad faahfaahsan oo ku saabsan kala duwanaanshaha noocyada iyo badnaanta, qaab dhismeedka dadweynaha, xiriirka phylogenetic, hiddo-wadaha shaqada, iyo isku-xirnaanta arrimaha deegaanka.
NGS-WGS(Illumina/BGI)
Dhuumaha falanqaynta isku dhafan ee loo sameeyay xirfadlayaasha cilmi-baarista iyada oo aan hore loo aqoon bioinformatics oo ku shaqeeya server-ka waxqabadka sarreeya.Waxay sahlaysa dhamaystirka degdega ah ee hawlaha sida xakamaynta tayada xogta, isku xidhka isku xigxiga, SNP/InDel/SV ogaanshaha kala duwanaanshiyaha, sharraxaadda, iyo hidda-wadaha isu-beddelka.
GWAS
Iyadoo la adeegsanayo habab tirokoob oo gaar ah, falanqaynta GWAS waxay rabta inay daaha ka qaaddo kala duwanaanshiyaha nucleotide-ballaaran ee genom-ga ah ee la xidhiidha kala duwanaanshaha phenotypic.Waxay door muhiim ah ka ciyaartaa sahaminta hidda-socodyada shaqeeya ee la xidhiidha cudurrada kakan ee bini'aadamka iyo sifooyinka qallafsan ee dhirta iyo xayawaanka.
BSA
Goobta falanqaynta isku dhafan waxay bixisaa is-dhexgal isticmaale-saaxiibtinimo ah oo loogu talagalay falanqaynta kala duwanaanta caadiga ah iyo shakhsi ahaaneed.Falanqaynta BSA waxay ku lug leedahay isu geynta shakhsiyaadka leh sifooyin aad u xun oo ka yimid dad kala soocida.Marka la is barbar dhigo meesha kala duwan ee u dhaxaysa shaybaarada la ururiyey, habkani wuxuu si degdeg ah u aqoonsanayaa calamadaha molecular ee xidhiidh dhow la leh hidde-sidaha bartilmaameedka ah.Si ballaaran loo isticmaalo khariidaynta hidda-wadaha ee dhirta iyo xayawaanka, waa qalab qiimo leh oo loogu talagalay taranta-caawin-ku-taabashada iyo booska hiddasidaha.
Hiddaha Kobcinta
Waa hawl-socod falanqeyn isku-dhafan oo loogu talagalay xirfadlayaasha cilmi-baarista ee leh khibradda bioinformatics xaddidan.Ka faa'iidaysiga waayo-aragnimada ballaadhan ee BMKGENE ee mashaariicda horumarinta hidda-socodka, madalkani waxa uu ku shaqeeyaa adeegayaasha waxqabadka sare leh, iyaga oo hubinaya in si degdeg ah oo sax ah loo fuliyo falanqaynta shakhsi ahaaneed.Kuwani waxay ka kooban yihiin hawlaha sida dhismaha dhirta phylogenetic, falanqaynta isku xirnaanta kala duwanaanshiyaha, qiimeynta kala duwanaanta hiddaha, aqoonsiga xaaqidda xulashada, falanqaynta qaraabada, falanqaynta qaybta ugu muhiimsan, iyo sifada qaab dhismeedka dadweynaha.
