BMKCloud Log in

Alaabta

Chromatin Taxanaha Tallaalka Tallaalka (ChiP-seq)

Chromatin Tallaabooyinka Taxanaha Tallaalka (ChiP-seq) Sawirka sifaysan

ChIP-Seq waxay bixisaa sifaynta genome-ballaaran ee bartilmaameedyada DNA ee wax ka beddelka histone, qodobbada qoraalka, iyo borotiinada kale ee DNA-da la xidhiidha.Waxay isku daraysaa xulashada chromatin immuno-precipitation (ChiP) si ay u soo kabsato dhismooyin borotiin-DNA gaar ah, oo leh awoodda isku xigxiga jiilka xiga (NGS) ee isku xigxiga-sare ee DNA-da la soo kabsaday.Intaa waxaa dheer, sababtoo ah iskudhafka borotiinka-DNA waxaa laga soo ceshaday unugyada nool, goobaha isku-xidhka waxaa lagu barbar dhigi karaa noocyada unugyada iyo unugyada kala duwan, ama xaalado kala duwan.Codsiyada waxay u dhexeeyaan nidaaminta qoraalka ilaa dariiqooyinka korriinka ilaa hababka cudurada iyo wixii ka baxsan.

Platform: Illumina NovaSeq Platform

Nala soo xiriir

Faahfaahinta Adeegga

Bioinformatics

Natiijooyinka Demo

Faa'iidooyinka Adeegga

● Platform: Illumina NovaSeq Platform, PE150

Nooca maktabadda: 100-500bp geli maktabadda DNA (waxay kuxirantahay qaybinta ugu sarreysa)

● Istaraatiijiyada isku xigxiga: Lammaanaha-Dhamaadka 150 bp

● Waxay ku talinayaan soo-saarka xogta: 6 Gb xog/muunad cayriin ah.

Shuruudaha Tusaalaha

Tirada DNA: ≥ 70 ng, ugu sarreeya 100 ilaa 500 bp

Tusaalaha mugga: ≥ 10 μl

OD260/280 = 1.8 ilaa 2.0 iyada oo aan hoos u dhicin ama wasakhayn RNA

Socodka shaqada ee tijaabada ah

Socodka Shaqada Adeegga

muunad keenid

Tusaalaha keenista

Diyaarinta Maktabadda

Dhismaha maktabadda

Isku xigxiga

Isku xigxiga

Falanqaynta xogta

Falanqaynta xogta

Adeegyada iibka kadib

Adeegyada iibka kadib

Hore: Taxanaha Metagenomic -NGS

Xiga: Isku xigxiga qoraalka oo dhan - Illumina

1. Qaybinta kobcinta ugu sarreysa

2. MA goobta ugu sarreysa ee kala duwan

3.Faahfaahinta KEGG

4. GO kala saarista

qaado xigasho

Halkan ku qor fariintaada oo noo soo dir

Alaabtaqaybaha

Fariintaada noo soo dir: