Alaabta

BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome

Ururinta boosaska unugyadu waxa ay door muhiim ah ka ciyaaraan habab kala duwan oo bayooloji ah, sida isdifaaca difaaca, koboca embriyaha, iwmHorumarinta tignoolajiyada, qaab-dhismeedka unugyada aadka u cad iyo farqiga qaabdhismeedka dhabta ah ee muujinta molecular waxay u baahan yihiin in lagu barto xal sare.BMKGENE waxa ay bixisaa adeeg isku xigxig ah oo dhamaystiran, hal-joog ah oo qoraal qoraal ah min muunado ilaa aragtiyo noole.

Tiknooloojiyada transcriptomics Spatial transcriptomics waxay awood u siiyeen aragtiyo cusub oo ku saabsan saaxadda cilmi-baarista ee kala duwan iyadoo la xalinayo astaanta muujinta hidda-wadaha oo leh nuxur goobeed muunado kala duwan.

Chip transcriptome Spatial: BMKMANU S1000

Platform: Illumina NovaSeq Platform

Nala soo xiriir

Faahfaahinta Adeegga

Bioinformatics

Natiijooyinka Demo

BMKMANU S1000 Nidaamka Farsamada ee Farsamada Qoraalka

Faa'iidooyinka BMKMANU S1000

1) Xallinta gacanta-hoosaadka: Aag kasta oo qabsasho ah waxa uu ka kooban yahay>2 milyan oo Barcoded Barcoded ah oo dhexroorkiisu yahay 2.5 µm iyo kala dheerayn 5 µm ah inta u dhaxaysa xarumaha booska, taas oo awood u siinaysa falanqaynta qoraalka transcriptome ee leh xallinta gacanta-hoosaadka (5 µm).

2) Falanqaynta xallinta heer-kala duwan: Falanqaynta heerar badan oo dabacsan oo u dhexeysa 100 μm ilaa 5 μm si loo xalliyo sifooyinka unugyada kala duwan ee xallinta ugu fiican.

Tilmaamaha Adeegga

Maktabadda	Istaraatiijiyada isku xigxiga	Soo saarida xogta ayaa lagu taliyay
S1000 cDNA maktabadda	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60Gb/ muunad

Shuruudaha Tusaalaha

Tusaale	Tirada	Cabbirka	Tayada RNA
Unugyada unugga ee ku dhex jira OCT	2-3 baloog / muunad	Qiyaastii6.8x6.8x6.8 mm³	RIN≥7

Faahfaahin dheeraad ah oo ku saabsan hagida diyaarinta muunada iyo socodka shaqada, fadlan xor u noqo inaad la hadasho aKhabiir BMKGENE

Socodka Shaqada Adeegga

Naqshadaynta tijaabada

Tusaalaha keenista

Tijaabo ka hor

Barcoding meel bannaan ah

Dhismaha maktabadda

Isku xigxiga

Falanqaynta xogta

Adeegyada iibka kadib

Hore: 10x Genomics Visium Spatial Transcriptome

Xiga: Isku-xiridda Hiddo-sidaha Dhan ee Dhirta/Xayawaanka

Xogta ay soo saartay BMKMANU S1000 waxaa lagu falanqeeyay iyada oo la adeegsanayo software-ka "BSTMatrix", kaas oo ay si madax-bannaan u naqshadeysay BMKGENE, oo ay ku jiraan:

1) Jiilka matrix muujinta hiddaha
2) HE image processing
3) La jaanqaadi kara software-ka hoose ee dhinac saddexaad ee falanqaynta
4) Khadka tooska ah "BSTViewer" wuxuu caawiyaa in lagu helo natiijooyinka muuqaal ee qaraaro kala duwan.

1.Kooxaha Spot

1000 (4)