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BSA
Bulked Segregant Analysis platform e aofia ai le tasi-laasaga faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga ma suʻesuʻega alualu i luma faʻatasi ai ma le faʻatulagaina o faʻasologa faʻapitoa.O le BSA ose metotia e fa'aaogaina e fa'ailoa vave ai fa'ailoga fa'ailoga e feso'otai i le phenotype.O galuega autu a le BSA o lo'o aofia ai: 1. filifilia o vaega e lua o tagata ta'ito'atasi e matua'i fa'afeagai uiga;2. fa'aputuina le DNA, RNA po'o le SLAF-seq(Atina'e e Biomarker) o tagata ta'ito'atasi uma e fausia ai le tele o DNA;3. fa'ailoaina fa'asologa o fa'asologa e fa'asaga i le genome fa'asino po'o totonu ole va, 4. va'aiga sui fa'afeso'ota'i itulagi e ED ma SNP-index algorithm;5. Su'esu'ega fa'atino ma le fa'atamaoaigaina o kenera i itulagi o sui tauva, ma isi. O lo'o avanoa fo'i le fa'aogaina o fa'amatalaga sili atu e aofia ai su'esu'ega fa'ailoga fa'atutu ma le mamanu muamua.
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Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S / 18S / ITS) faʻavae ua atiaʻe ma tausaga o le poto masani i suʻesuʻega faʻavae microbial diversity, lea e aofia ai suʻesuʻega faʻapitoa ma auʻiliʻiliga faʻapitoa: auʻiliʻiliga faʻavae e aofia ai le auʻiliʻiliga autu o suʻesuʻega microbial o loʻo i ai nei, o le auʻiliʻiliga o mea e tamaoaiga ma atoatoa, ma fa'ai'uga au'ili'ili o lo'o tu'uina atu ile tulaga o lipoti o poloketi;O le anotusi o au'ili'iliga fa'apitoa e 'ese'ese.E mafai ona filifilia faʻataʻitaʻiga ma faʻamaufaʻailoga e mafai ona faʻatulagaina fetuutuunai e tusa ai ma le lipoti o suʻesuʻega autu ma le faʻamoemoega o suʻesuʻega, e iloa ai manaʻoga faʻapitoa.Windows operating system, faigofie ma vave.
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Evolutionary Genetics
Evolutionary genetics o se auaunaga faʻasologa faʻapipiʻiina ua fuafuaina mo le tuʻuina atu o se faʻamatalaga manino i luga o faʻamatalaga faʻafouina o mea tuʻuina atu e faʻavae i luga o fesuiaiga o kenera, e aofia ai SNPs, InDels, SVs ma CNVs.E maua ai su'esu'ega fa'avae uma e mana'omia mo le fa'amatalaina o suiga fa'asolosolo ma uiga fa'atupu o le faitau aofa'i, e pei o le fausaga o le faitau aofa'i, fa'avasegaga o le kenera, so'otaga fa'aletagata, ma isi.
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Faatusatusa Genomics
Fa'atusatusa genomics o lona uiga moni o le fa'atusatusaina o fa'asologa atoa o genome ma fausaga o ituaiga eseese.O lenei a'oa'iga e fa'atatau i le fa'aalia o le fa'atupuina o ituaiga, galuega fa'atupu, faiga fa'atonutonu fa'atupu i le genome e ala i le fa'ailoaina o fa'asologa fa'asologa ma elemene na fa'asaoina pe fa'aeseese i ituaiga eseese.O suʻesuʻega faʻatusatusa faʻatusatusaga masani e aofia ai suʻesuʻega i le gafa aiga, atinaʻe evolusione, faʻasologa atoa o le genome, faʻamalosi filifilia, ma isi.
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Evolutionary Genetics
O le faitau aofa'i ma le fa'atupuina o su'esu'ega fa'avae o lo'o fa'avaeina i luga o le fa'avae o le tele o poto masani fa'aputuina i totonu o le BMK R&D team mo le tele o tausaga.Ose meafaigaluega fa'aoga fa'aoga aemaise lava mo tagata su'esu'e e le'o fa'amuamua i bioinformatics.O lenei faʻavae e faʻatagaina ai suʻesuʻega faʻavae faʻavae evolutionary genetics e aofia ai le fausiaina o laʻau phylogenetic, suʻesuʻega o le tuʻufaʻatasiga, suʻesuʻega o kenera, suʻesuʻega filifilia, suʻesuʻega o le aiga, PCA, suʻesuʻega o le faitau aofaʻi, ma isi.
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Hi-C fa'avae Genome Assembly
O le Hi-C o se metotia ua mamanuina e pu'eina ai le chromosome configuration e ala i le tu'ufa'atasia o le su'esu'eina o feso'ota'iga vavalalata ma le fa'asologa maualuga.O le malosi o nei fegalegaleaiga e talitonuina e le lelei le fesoʻotaʻiga ma le mamao faaletino i chromosomes.O le mea lea, e mafai e fa'amaumauga a le Hi-C ona ta'ita'ia le fa'aputuina, fa'atonu ma le fa'atonuina o fa'asologa o lo'o tu'ufa'atasia i se fa'ata'ita'iga genome ma fa'amau i luga o se numera o chromosomes.O lenei tekinolosi e fa'amalosia ai se fa'apotopotoga o le genome-level chromosome i le leai o se fa'afanua fa'avae fa'avae tagata.O genome ta'itasi e mana'omia se Hi-C.
Tulaga: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
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La'au/Manu De Novo Genome Sequencing
De Novofa'asologa o lo'o fa'atatau ile fausiaina ole genome atoa ole ituaiga e fa'aaoga ai tekinolosi fa'asologa, fa'ata'ita'iga PacBio, Nanopore, NGS, ma isi, pe a leai se genome fa'asino.O le faʻaleleia mataʻina o le umi o le faitau o tupulaga lona tolu o tekinolosi faʻasologa na maua ai avanoa fou i le faʻapipiʻiina o genomes lavelave, e pei oi latou e maualuga le heterozygosity, maualuga maualuga o itulagi toe fai, polyploids, ma isi. fofoina o elemene fai soo, itulagi e le masani ai GC i totonu ma isi itulagi sili ona lavelave.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq Platform
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Fa'asologa o Exome Atoa a le Tagata
O le fa'asologa atoa o le exome (WES) o lo'o fa'atatauina o se ta'iala tau fa'asologa mo le fa'ailoaina o suiga e mafua ai fa'ama'i.E ui lava e na'o le 1.7% o le genome atoa e maua ai e exons, o lo'o fa'atusalia ai le talaaga o galuega fa'apolotini atoa.I le genome o le tagata, ua lipotia mai e sili atu i le 85% o faʻamaʻi e fesoʻotaʻi ma suiga o loʻo tutupu i totonu ole vaega ole polotini.
O le BMKGENE o lo'o ofoina atu au'aunaga fa'asologa fa'asologa atoa ma fetu'utu'una'i tagata fa'atasi ai ma fa'ata'ita'iga e pu'eina fa'apitoa e avanoa e fa'afetaui ai sini su'esu'e eseese.
Fa'avae: Illumina NovaSeq Platform
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Fa'asologa o Vaega Fa'aopoopo Fa'apitoa-Locus (SLAF-Seq)
O le genotyping maualuga, aemaise lava i le faitau aofaʻi o tagata, o se laasaga taua i suʻesuʻega faʻale-aganuʻu, lea e maua ai le faʻavae faʻavae mo le suʻesuʻeina o gaʻo galue, suʻesuʻega evolusione, ma isi. ) o lo'o fa'aofiina ina ia fa'aiti'itia le tau fa'asologa i fa'ata'ita'iga, a'o fa'atumauina le lelei talafeagai i le mauaina o fa'ailoga fa'a kenera.E masani ona maua lenei mea e ala i le su'eina o vaega fa'atapula'a i totonu ole lapo'a tu'ufa'atasia, lea e fa'aigoaina o le reded representation library (RRL).O le fa'asologa o vaega fa'apipi'i fa'apitoa (SLAF-Seq) ose ta'iala na fa'atupuina e le tagata lava ia mo le SNP genotyping ma pe leai se genome fa'asinomaga.
Tulaga: Illumina NovaSeq Platform -
Illumina ma le BGI
Illumina sequencing technology, fa'avae i le Sequencing by Synthesis (SBS), o se fa'afouga a le NGS i le lalolagi atoa, e nafa ma le fa'atupuina o le 90% o fa'amaumauga fa'asologa o le lalolagi.O le mataupu faavae o le SBS e aofia ai ata fa'ailoga fa'aigoa fa'alelei toe fa'afo'i a'o fa'aopoopo i ai le dNTP ta'itasi, ma soso'o ai loa ona fa'ataga e fa'ataga ai le tu'ufa'atasia o le isi fa'avae.Faatasi ai ma dNTPs uma e mafai ona toe fa'afo'i fa'amuta ua iai i ta'amilosaga fa'asologa ta'itasi, o tauvaga fa'anatura e fa'aitiitia ai le fa'aituau fa'atasi.O lenei tekinolosi fa'akomepiuta e lagolagoina uma faletusi e tasi-faitau ma faletusi fa'alua-i'uga, fa'amalieina le tele o fa'aoga genomic.Ole fa'asologa o le Illumina e mafai ona fa'aogaina ma le sa'o o lo'o fa'atulagaina e fai ma maatulimanu ile su'esu'ega genomics, fa'amalosia le au saienitisi e fa'amatalaina le lavelave o genomes ma fa'amatalaga e le mafaatusalia ma le lelei.
DNBSEQ, atiaʻe e le BGI, o se isi faʻatekonolosi NGS fou ua mafai ona faʻaititia atili i lalo tau faʻasologa ma faʻateleina le gaosiga.O le tapenaga o faletusi DNBSEQ e aofia ai le vaevaega o DNA, le saunia o le ssDNA ma le fa'alauteleina o le li'o ta'avale e maua ai le DNA nanoballs (DNB).Ona utaina lea o nei mea i luga o se mea malō ma sosoo ai ma le fa'asologa e ala i le tu'ufa'atasiga o le Su'esu'ega-Tala'au (cPAS).
O la matou 'au'aunaga fa'asologa o faletusi e fa'afaigofie ai tagata fa'atau i le sauniaina o a latou faletusi fa'asologa mai fa'apogai eseese (mRNA, genome atoa, amplicon, ma isi).Mulimuli ane, o nei faletusi e mafai ona lafo i o tatou nofoaga faʻasologa mo le faʻatonutonuina lelei ma le faʻasologa i Illumina poʻo BGI platforms.
