Ole genotyping maualuga, aemaise ile faitau aofaʻi o tagata, o se laasaga faʻavae i suʻesuʻega faʻale-aganuʻu, lea e maua ai le faʻavae mo le suʻesuʻeina o kenera galue, suʻesuʻega evolusione, ma isi. ) o lo'o fa'aofiina ina ia fa'aiti'itia le tau fa'asologa i fa'ata'ita'iga, a'o fa'atumauina le lelei talafeagai i le mauaina o fa'ailoga fa'a kenera.E masani ona maua lenei mea e ala i le su'eina o vaega fa'atapula'a i totonu ole lapo'a tu'ufa'atasia, lea e fa'aigoaina o le reded representation library(RRL).O le fa'asologa o vaega fa'aopoopo fa'apitoa-locus (SLAF-Seq) ose fuafuaga fa'avae e le tagata lava ia mo le su'esu'eina o le SNP ma le SNP genotyping o tagata to'atele.
Fa'atekinisi galuega
SLAF ma auala RRL oi ai nei
Tulaga lelei o le SLAF
E sili atu le lelei o su'esu'ega fa'ailoga fa'a kenera- Faʻatasi ma tekinolosi faʻasologa maualuga, SLAF-Seq e mafai ona ausia le fiaselau afe o pine na maua i totonu o le genome atoa e faʻataunuʻu ai le talosaga o suʻesuʻega suʻesuʻega eseese, pe faʻatasi pe leai se genome faʻasino.
Fa'ailoga fa'ata'ita'i fa'apitoa ma fetu'una'i- Mo su'esu'ega 'ese'ese po'o ituaiga, 'ese'ese ta'iala fa'alaufau fa'ama'i o lo'o avanoa e aofia ai le fa'ama'i e tasi-enzyme, lua-enzyme ma le tele-enzyme digestion.Ole ta'iala ole ga'o ole a mua'i su'esu'eina ile silico e fa'amautinoa ai se mamanu ole enzyme e sili ona lelei.
Maua maualuga i le fa'aluina o le enzymatic- O le fa'ama'iina o le enzymatic na mua'i fuafuaina e maua ai SLAF tutusa tutusa ile chromosome.E mafai ona sili atu i le 95%.
Aloese mai le fai soo- O le pasene o le faʻasologa faʻasolosolo i le SLAF-Seq faʻamaumauga e faʻaititia i lalo ifo o le 5%, aemaise lava i ituaiga o loʻo i ai le maualuga o elemene toe fai, e pei o saito, saga, ma isi.
Fa'atupuina e le tagata lava ia bioinformatic workflow– BMK atia'e se su'esu'ega bioinformatic tu'ufa'atasia e fa'atatau ile tekonolosi SLAF-Seq e fa'amautinoa ai le fa'amaoni ma le sa'o o galuega fa'ai'u.
Fa'aaogaina o le SLAF
Fa'afanua feso'ota'iga fa'a kenetoma
Fausia fa'afanua fa'atupu ma fa'ailoaina o loci e pulea uiga fugala'au ile Chrysanthemum(Chrysanthemum x morifolium Ramat.)
Tusitala: Suesuega Fa'ato'aga Fa'asalalauina: 2020.7
GWAS
Fa'ailoaina o se kenera sui e feso'ota'i ma le isofavone i totonu o fatu soya e fa'aaoga ai le genome-wide association ma feso'ota'iga fa'afanua
Tusitala: o le Plant Journal Fa'asalalauina: 2020.08
Evolutionary Genetics
O su'esu'ega fa'ato'aga o tagata ma fa'apotopotoga de novo ua fa'ailoa mai ai le amataga o le araisa vao ose ta'aloga fa'a-evolusione
Tusitala: Molecular Plant Lolomiina: 2019.5
Au'ili'iliga Tu'ufa'atasi (BSA)
GmST1, o loʻo faʻapipiʻiina se sulfotransferase, faʻatagaina le tetee atu i faʻamaʻi siama mosaic soya G2 ma G3
Tusitala: La'au, Cell & Si'osi'omaga Fa'asalalau: 2021.04
Fa'asinomaga
Sun X, Liu D, Zhang X, ma isi.SLAF-Seq: o se auala lelei ole su'esu'eina o le SNP ma le genotyping e fa'aaoga ai le fa'asologa maualuga [J].Plos one, 2013, 8(3):e58700
Pese X, Xu Y, Gao K, ma isi.Fausiaina o fa'afanua fa'afanua ma fa'ailoaina o loci o lo'o pulea uiga fugala'au ile Chrysanthemum (Chrysanthemum × morifolium Ramat.).Hortic Res.2020;7:108.
Wu D, Li D, Zhao X, ma isi.Fa'ailoaina o se ga'o sui e feso'ota'i ma le isoflavone i fatu soya e fa'aaoga ai le genome-wide association ma feso'ota'iga fa'afanua.La'au J. 2020;104(4): 950-963.
Sun J, Ma D, Tang L, ma isi.Population Genomic Analysis ma De Novo Assembly Fa'aalia le Amataga o Weedy Rice ose Ta'aloga Evolutionary.La'au Mol.2019;12(5):632-647.La'au Mol.2018;11(11):1360-1376.
Zhao X, Jing Y, Luo Z, ma isi.GmST1, lea e fa'ailoga ai le sulfotransferase, fa'ae'eina le tete'e atu i soya mosaic virus strains G2 ma le G3.Si'osi'omaga Cell La'au.2021;10.1111/pce.14066
Taimi meli: Ian-04-2022