Izdelki

Sekvenciranje enojedrne RNA

Predstavljena slika sekvenciranja enojedrne RNA

Napredek pri zajemanju posamezne celice in tehniki gradnje posamezne knjižnice v kombinaciji z visoko zmogljivim sekvenciranjem omogoča študije izražanja genov na podlagi celice za celico.Omogoča globljo in popolno sistemsko analizo na kompleksnih celičnih populacijah, pri čemer se v veliki meri izogne maskiranju njihove heterogenosti z jemanjem povprečja vseh celic.

Nekatere celice pa niso primerne za pripravo enocelične suspenzije, zato so potrebne druge metode priprave vzorcev – ekstrakcija jedra iz tkiv, to pomeni, da se jedro ekstrahira neposredno iz tkiva ali celice in se pripravi v enojedrno suspenzijo za enojedrno suspenzijo. sekvenciranje celic.

BMK zagotavlja 10× storitev zaporedja enocelične RNA na podlagi Genomics ChromiumTM.Ta storitev se pogosto uporablja v študijah o študijah, povezanih z boleznijo, kot je diferenciacija imunskih celic, heterogenost tumorja, razvoj tkiva itd.

Čip prostorskega transkriptoma: 10 × Genomics

Platforma: Platforma Illumina NovaSeq

Kontaktiraj nas

Podrobnosti storitve

Bioinformatika

Demo rezultati

Tehnični princip

Izolacijo jeder doseže 10× Genomics ChromiumTM, ki je sestavljen iz osemkanalnega mikrofluidnega sistema z dvojnimi križišči.V tem sistemu so kroglice gela s črtnimi kodami in temeljnim premazom, encimi in eno samo jedro vkapsulirane v kapljico olja v velikosti nanolitra, kar ustvarja gelsko kroglico v emulziji (GEM).Ko se GEM oblikuje, se v vsakem GEM izvede celična liza in sprostitev črtnih kod.mRNA se reverzno prepiše v molekule cDNA s črtnimi kodami 10 × in UMI, ki so nadalje predmet standardne konstrukcije knjižnice sekvenciranja.

Tkivo ni primerno za pripravo suspenzije posameznih celic

Celica / tkivo	Razlog
Nesveže zamrznjeno tkivo	Ni mogoče pridobiti svežih ali dolgo shranjenih organizacij
Mišična celica, megakariocit, maščoba…	Premer celice je prevelik za vstop v instrument
Jetra…	Preveč krhka, da bi se zlomila, ne more razlikovati posameznih celic
Nevronska celica, možgani…	Bolj občutljiv, enostaven za stres, bo spremenil rezultate zaporedja
Trebušna slinavka, ščitnica…	Bogat z endogenimi encimi, ki vplivajo na proizvodnjo suspenzije posameznih celic

Enojedren vs enocelični

Enojedren	Enocelični
Neomejen premer celice	Premer celice: 10-40 μm
Material je lahko zamrznjeno tkivo	Material mora biti sveže tkivo
Nizek stres zamrznjenih celic	Zdravljenje z encimi lahko povzroči celično stresno reakcijo
Rdečih krvničk ni treba odstraniti	Rdeče krvničke je treba odstraniti
Jedro izraža bioinformacijo	Celotna celica izraža bioinformacijo