-
Imunoprecipitacijsko sekvenciranje kromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq zagotavlja profiliranje tarč DNK na celotnem genomu za modifikacijo histonov, transkripcijskih faktorjev in drugih proteinov, povezanih z DNK.Združuje selektivnost imunoprecipitacije kromatina (ChIP) za obnovitev specifičnih kompleksov protein-DNA z močjo sekvenciranja naslednje generacije (NGS) za visoko zmogljivo sekvenciranje obnovljene DNA.Poleg tega, ker se kompleksi protein-DNA pridobijo iz živih celic, lahko primerjamo vezavna mesta v različnih tipih celic in tkivih ali pod različnimi pogoji.Aplikacije segajo od regulacije transkripcije do razvojnih poti do mehanizmov bolezni in več.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekvenciranje bisulfita celotnega genoma
Metilacija DNA na petem mestu v citozinu (5-mC) ima temeljni vpliv na izražanje genov in celično aktivnost.Nenormalni vzorci metilacije so bili povezani z več stanji in boleznimi, kot je rak.WGBS je postal zlati standard za preučevanje metilacije celotnega genoma pri enojni osnovni ločljivosti.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Test za transpozazno dostopen kromatin z visoko zmogljivim sekvenciranjem (ATAC-seq)
ATAC-seq je visoko zmogljiva metoda sekvenciranja za analizo dostopnosti kromatina v celotnem genomu, kar je pomembno za globalni epigenetski nadzor izražanja genov.Adapterji za sekvenciranje se vstavijo v odprte regije kromatina s hiperaktivno transpozazo Tn5.Po pomnoževanju PCR se izdela knjižnica sekvenciranja.Vse odprte kromatinske regije je mogoče pridobiti pod posebnimi prostorsko-časovnimi pogoji, ki niso omejeni samo na vezavna mesta transkripcijskega faktorja ali določene histonsko spremenjene regije.
-
Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
Raziskave metilacije DNK so bile vedno vroča tema v raziskavah bolezni in so tesno povezane z izražanjem genov in fenotipskimi lastnostmi.RRBS je natančna, učinkovita in ekonomična metoda za raziskave metilacije DNK.Obogatitev promotorskih in CpG otočnih regij z encimsko cepitvijo (Msp I) v kombinaciji z bisulfitnim sekvenciranjem zagotavlja visoko ločljivo detekcijo metilacije DNA.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
