Medtem ko sekvenciranje mRNA na osnovi NGS služi kot vsestransko orodje za kvantifikacijo izražanja genov, njegovo zanašanje na kratke odčitke omejuje njegovo učinkovitost pri kompleksnih transkriptomskih analizah.Sekvenciranje PacBio (Iso-Seq) na drugi strani uporablja tehnologijo dolgega branja, ki omogoča sekvenciranje transkriptov mRNA v polni dolžini.Ta pristop omogoča celovito raziskovanje alternativnega spajanja, zlitja genov in poliadenilacije, čeprav ni primarna izbira za kvantifikacijo izražanja genov.Kombinacija 2+3 premosti vrzel med Illumina in PacBio, tako da se zanaša na odčitke PacBio HiFi za identifikacijo celotnega niza izooblik transkripta in sekvenciranje NGS za kvantifikacijo istih izooblik.
Platforme: PacBio Sequel II in Illumina NovaSeq