BMKCloud Log in
条形banner-03

Novice

Sekvenciranje transkriptoma polne dolžine na osnovi nanopor

Nanopore sekvenciranje se razlikuje od drugih platform za sekvenciranje po tem, da se nukleotidi berejo neposredno brez sinteze DNA in ustvarjajo dolga branja na desetine kilobaz.To omogoča neposredno branje celotnih transkriptov in spopadanje z izzivi v transkriptomskih študijah.

√ Nizka pristranskost, specifična za zaporedje

√ Celoten odčitek cDNA za študije strukture genov

√ Potrebnih je manj podatkov za enako število prepisov

√ Identifikacija več izoform na gen

√ Kvantifikacija izražanja na ravni izoforme

nanopore-1

Tipičen cevovod bioinformatike

Celotna dolžina-trans-bix-1024x254

Najnovejši uspešni primeri s tehnologijami biomarkerjev

1. Primerjalne analize transkriptomov polne dolžine razkrivajo dinamiko razvoja stebla Gnetum luofuense

Journal: Frontiers in Genetics

Objavljeno: marec 2021

Ključne besede: MinION |Alternativno spajanje |APA |lncRNA |Diferencialno izraženi prepisi

Preberi celotno besedilo

2. Enosmerno gibanje majhnih RNA od poganjkov do korenin v medvrstnih heterotransplantatih

Revija: Nature Plants

Objavljeno: januar 2021

Ključne besede: Nanopore |Illumina |zaznavanje mobilne mRNA v polni dolžini

3. Celotna analiza transkriptoma korenin špargljev razkriva molekularni mehanizem tolerance soli, ki jo povzročajo arbuskularne mikorizne glive

Revija: Okoljska in eksperimentalna botanika

Objavljeno: januar 2021

Ključne besede: MinION |Diferencialno izraženi prepisi |Transkripcijski faktorji |Alternativno spajanje

4. Spremembe fizioloških značilnosti in celotni transkriptom korenin in listov vrtnice (Rosa chinensis) kot odziv na sušni stres

Revija: Rastlinska in celična fiziologija

Objavljeno: oktober 2020

Ključne besede: PromethION |Diferencialno izraženi prepisi |Funkcionalna napoved |Spojene izooblike |TF in lncRNA

5. Analiza in celovita primerjava PacBio in nanopornega zaporedja RNA transkriptoma Arabidopsis

Revija: Rastlinska metoda

Objavljeno: april 2020

Ključne besede: GridION |PromethION |Nadaljevanje PacBio |Illumina NovaSeq |Poravnava genoma |Identifikacija prepisa |Alternativno spajanje |SSR |LncRNA |Kvantifikacija izoforme

Novice in poudarki želi deliti najnovejše uspešne primere z Biomarker Technologies, zajeti nove znanstvene dosežke in vidne tehnike, uporabljene med študijo.


Čas objave: 8. januarja 2022

Pošljite nam svoje sporočilo: