Izdelki

Gljivični genom

Biomarker Technologies zagotavlja raziskavo genoma, natančen genom in popoln genom glive, odvisno od specifičnega raziskovalnega cilja.Sekvenciranje genoma, sestavljanje in funkcionalno označevanje je mogoče doseči s kombinacijo sekvenciranja naslednje generacije + sekvenciranja tretje generacije, da se doseže sestavljanje genoma na visoki ravni.Tehnologijo Hi-C je mogoče uporabiti tudi za olajšanje sestavljanja genoma na ravni kromosoma.

Platforma:PacBio Nadaljevanje II

Nanopore PromethION P48

Platforma Illumina NovaSeq

Kontaktiraj nas

Podrobnosti storitve

Demo rezultati

Prednosti storitve

● Za različne raziskovalne cilje je na voljo več strategij zaporedja

● Veliko izkušenj pri sestavljanju genoma gliv z več kot 10.000 sestavljenimi genomi, ki so popolni za pene.

● Strokovna ekipa za tehnično podporo po prodaji, ki izpolnjuje bolj specifične raziskovalne potrebe.

Specifikacije storitve

Storitev	Strategija zaporedja	Zagotovljena kakovost	Predviden čas obračanja
Fini zemljevid glivic	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 delovnih dni
Fini zemljevid glivic	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 delovnih dni
Popoln zemljevid glivične pene	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Razmerje sidranja kromosomov > 90 %	45 delovnih dni

Bioinformatske analize

● Nadzor kakovosti neobdelanih podatkov

● Sestavljanje genoma

● Analiza komponent genoma

● Opomba o funkciji gena

● Primerjalna genomska analiza

Zahteve za vzorce in dostava

Vzorčne zahteve:

Zaizvlečki DNK:

Vrsta vzorca	Znesek	koncentracija	Čistost
izvlečki DNK	> 1,2 μg	> 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

Za vzorce tkiva:

Vrsta vzorca

Priporočena obravnava vzorca

Shranjevanje in pošiljanje vzorcev

Enocelična gliva

Pod mikroskopom opazujte kvasovke in jih zberite v njihovi eksponentni fazi

Prenesite kulturo (ki vsebuje približno 3-4,5e9 celic) v 1,5 ali 2 ml eppendorf.(Ohrani na ledu)

Centrifugirajte epruveto 1 minuto pri 14000 g, da zberete bakterije in previdno odstranite supernatant

Zaprite epruveto in zamrznite bakterije v tekočem dušiku za vsaj 1-3 ure.Epruveto shranjujte v hladilniku -80 ℃.

Zamrznite vzorce v tekočem dušiku za 3-4 ure in jih shranite v tekočem dušiku ali -80 stopinj za dolgoročno rezervacijo.Zahtevano je pošiljanje vzorcev s suhim ledom.

Makro glive

Priporočljivo je tkivo v fazi aktivne rasti.

Tkivo sperite z vodo brez endotoksinov, nato s 70 % etonalom.

Vzorec shranite v krioepruvete.