Analiza evkariontske mRNA (z referenco)
Na podlagi znanega zaporedja genoma in informacij o opombah se kot vhod uporabi nova generacija visoko zmogljivih podatkov sekvenciranja (RNA-Seq), identificirajo se nova transkripcijska mesta (nov gen) in novi spremenljivi dogodki spajanja.ocena kakovosti podatkov zaporedja;sekvenciranje podatkov in poravnava zaporedja izbranega referenčnega genoma, prepoznavanje meja eksona/introna, analiza spajanja genskih variant, raziskovanje genskih regij in novih transkriptov, prepoznavanje mest SNP transkribirane regije, meja med 3' in 5 ' genov ter funkcionalno označevanje in analizo obogatitve različnih vzorcev (skupin).
Dolge nekodirajoče RNA
Dolge nekodirajoče RNA (lncRNA) so vrsta transkriptov z dolžino, daljšo od 200 nt, ki ne morejo kodirati beljakovin.Zbrani dokazi kažejo, da je večina lncRNA zelo verjetno funkcionalnih.Visokozmogljive tehnologije sekvenciranja in orodja za bioinformatično analizo nam omogočajo učinkovitejše odkrivanje sekvenc lncRNA in informacij o pozicioniranju ter nas vodijo do odkrivanja lncRNA s ključnimi regulativnimi funkcijami.BMKCloud s ponosom ponuja našim strankam platformo za analizo sekvenciranja lncRNA za doseganje hitre, zanesljive in prilagodljive analize lncRNA.
16S/18S/ITS sekvenciranje pomnožev
Platforma za analizo mikrobne raznovrstnosti je razvita z dolgoletnimi izkušnjami pri projektni analizi mikrobne raznovrstnosti, ki vsebuje standardizirano osnovno analizo in personalizirano analizo: osnovna analiza pokriva glavno vsebino analize trenutnih mikrobnih raziskav, vsebina analize je bogata in celovita, rezultati analize pa so predstavljeni v obliki projektnih poročil;Vsebina personalizirane analize je raznolika.Vzorce je mogoče izbrati in parametre prilagodljivo nastaviti v skladu z osnovnim poročilom o analizi in raziskovalnim namenom, da se uresničijo prilagojene zahteve.Operacijski sistem Windows, enostaven in hiter.
Metagenomika puške (NGS)
Metagenomski podatki se uporabljajo za analizo mešanih genomskih materialov, pridobljenih iz okoljskih vzorcev, ki zagotavljajo podrobne informacije o raznolikosti in številčnosti vrst, populacijski strukturi, filogenetskem razmerju, funkcionalnih genih in korelacijski mreži z okoljskimi dejavniki.
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Integrirani analitični cevovod, razvit za raziskovalce brez predznanja o bioinformatiki, deluje na visoko zmogljivem strežniku.Omogoča hitro dokončanje nalog, kot so nadzor kakovosti podatkov, poravnava zaporedja, odkrivanje variacij SNP/InDel/SV, označevanje in mutacija gena.
GWAS
Z uporabo posebnih statističnih metodologij želi analiza GWAS odkriti variacije nukleotidov v celotnem genomu, povezane s fenotipskimi razlikami.Ima ključno vlogo pri raziskovanju funkcionalnih genov, povezanih s kompleksnimi človeškimi boleznimi in zapletenimi lastnostmi pri rastlinah in živalih.
BSA
Integrirana platforma za analizo zagotavlja uporabniku prijazen vmesnik za standardizirano in prilagojeno analizo raznolikosti.Analiza BSA vključuje združevanje posameznikov z ekstremnimi fenotipskimi lastnostmi iz segregacijske populacije.S primerjavo diferencialnih lokusov med združenimi vzorci ta pristop hitro identificira tesno povezane molekularne markerje, povezane s ciljnimi geni.Pogosto se uporablja pri genetskem kartiranju rastlin in živali ter je dragoceno orodje za žlahtnjenje s pomočjo markerjev in pozicioniranje genov.
Evolucijska genetika
To je integriran potek dela analize, zasnovan za raziskovalce z omejenim znanjem o bioinformatiki.Ta platforma, ki izkorišča obsežne izkušnje BMKGENE pri projektih genetske evolucije, deluje na visoko zmogljivih strežnikih, kar zagotavlja hitro in natančno izvedbo prilagojenih analiz.Te obsegajo naloge, kot je konstrukcija filogenetskega drevesa, analiza neravnovesja povezav, ocena genetske raznovrstnosti, identifikacija selektivnega pregleda, analiza sorodstva, analiza glavnih komponent in karakterizacija strukture populacije.
