BMKGENE je zagotovil storitve sekvenciranja prostorskega transkriptoma za študijo "STEEL enables high-resolution delineation of spatiotemporal transscriptomic data", ki je bila objavljena v Briefings in Bioinformatics.
Ta študija je predlagala nenadzorovan in raznovrsten algoritem, ki temelji na učenju, združevanje celic tipa prostorskega transkriptoma (STEEL), ki identificira domene iz prostorskega transkriptoma z združevanjem kroglic, ki kažejo zelo podobne profile izražanja genov in tesno prostorsko razdaljo v obliki grafov.
Celovita ocena STEEL na prostorskih transkriptomskih naborih podatkov iz platforme 10X Visium dokazuje, da ne dosega le visoke ločljivosti za karakterizacijo finih struktur mišjih možganov, temveč omogoča tudi integracijo več diapozitivov tkiva, ki so posamično analizirani v večjega.
Z napredkom tehnologij prostorskega transkriptoma bo naša metoda imela veliko uporabnost pri identifikaciji domen in rekonstrukciji atlasa genske ekspresije.
Kliknitetukajče želite izvedeti več o tej študiji.
Čas objave: 20. oktober 2023