20. maj je svetovni dan čebel!Čebele so bistvene opraševalke, ki prispevajo k raznolikosti in produktivnosti ekosistemov ter pridelavi živilskih rastlin, ki hranijo ljudi in živali.
Azijska medonosna čebela je pomembna vrsta opraševalcev, ki ima ključno vlogo v kmetijstvu in ekosistemskih storitvah.Osnutek genoma A. cerana je bil leta 2015 objavljen s tehnologijo NGS, ki je bila zelo razdrobljena in brez kromosomskega odra, zaradi česar je bilo treba pridobiti popolnejše in natančnejše sekvence genoma.
Eden izmed uspešnih primerov BMKGENE je skupina raziskovalcev iz Kitajske in Avstralije, ki je objavila novo študijo z naslovom »Kromosomska lestvica genoma azijske medonosne čebele Apis cerana«.V tej študiji predstavljajo visoko zvezen sestav genoma A. cerana na ravni kromosomov z uporabo kombinacije PacBio dolgega branja sekvenc in podatkov Hi-C.Posodobljeni sklop je velik 215,67 Mb s kontigom N50 4,49 Mb, kar predstavlja 212-kratno izboljšavo v primerjavi s prejšnjo različico, ki temelji na Illumini.Novi sklop je imel tudi večjo popolnost, saj je bilo prisotnih 97,6 % BUSCO-jev v primerjavi s samo 86,9 % v prejšnjem sklopu.Raziskovalci so izvedli natančnejšo in celovitejšo genomsko analizo, kot je napovedovanje novih genov in odkrivanje strukturnih variacij, kar ima lahko pomembne posledice za razumevanje biologije in evolucije te vrste.
BMKEGENE ima bogate izkušnje pri visokokakovostnem sestavljanju genoma in se veseli, da vam bomo lahko nudili naše storitve.
Kliknite tukaj za učenjeVeč o tej študiji
Čas objave: 22. maj 2023