-
Zaporedje imunoprecipitacije kromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq zagotavlja profiliranje tarč DNK na celotnem genomu za modifikacijo histona, transkripcijske faktorje in druge beljakovine, povezane z DNK.Združuje selektivnost imunoprecipitacije kromatina (ChIP) za obnovitev specifičnih kompleksov protein-DNA z močjo sekvenciranja naslednje generacije (NGS) za visoko zmogljivo sekvenciranje pridobljene DNK.Poleg tega, ker se kompleksi protein-DNA pridobivajo iz živih celic, je mogoče vezavna mesta primerjati v različnih vrstah celic in tkivih ali pod različnimi pogoji.Aplikacije segajo od regulacije transkripcije do razvojnih poti do mehanizmov bolezni in več.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Bisulfitno sekvenciranje celotnega genoma
Metilacija DNK na petem mestu v citozinu (5-mC) ima temeljni vpliv na izražanje genov in celično aktivnost.Nenormalni vzorci metilacije so bili povezani z več stanji in boleznimi, kot je rak.WGBS je postal zlati standard za preučevanje metilacije v celotnem genomu pri ločljivosti ene baze.
Platforma: Illumina NovaSeq6000
-
Test za kromatin, dostopen za transpozazo, z visoko zmogljivim sekvenciranjem (ATAC-seq)
ATAC-seq je visoko zmogljiva metoda sekvenciranja za analizo dostopnosti kromatina v celotnem genomu, ki je pomembna za globalni epigenetski nadzor genske ekspresije.Adapterji za sekvenciranje so vstavljeni v odprta področja kromatina s hiperaktivno transpozazo Tn5.Po pomnoževanju PCR se zgradi knjižnica zaporedja.Vse odprte kromatinske regije je mogoče pridobiti pod določenimi prostorsko-časovnimi pogoji, ne le omejenimi na vezavna mesta transkripcijskega faktorja ali določeno histonsko modificirano regijo.
-
Zaporedje bisulfitov z zmanjšano zastopanostjo (RRBS)
Raziskave metilacije DNK so bile vedno vroča tema v raziskavah bolezni in so tesno povezane z izražanjem genov in fenotipskimi lastnostmi.RRBS je natančna, učinkovita in ekonomična metoda za raziskave metilacije DNK.Obogatitev regij promotorja in otoka CpG z encimskim cepljenjem (Msp I) v kombinaciji z bisulfitnim sekvenciranjem zagotavlja visoko ločljivost odkrivanja metilacije DNA.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
