-
PacBio-Transkriptom polne dolžine (nereferenčni)
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) je razvita z dolgoletnimi izkušnjami pri analizi projektov mikrobne raznolikosti, ki vsebuje standardizirano osnovno analizo in personalizirano analizo: osnovna analiza zajema glavno vsebino analize trenutnih raziskav mikrobov, vsebina analize je bogata in izčrpna, rezultati analize pa so predstavljeni v obliki projektnih poročil;Vsebina personalizirane analize je raznolika.Vzorce je mogoče izbrati in parametre prilagodljivo nastaviti glede na osnovno poročilo analize in raziskovalni namen, da se uresničijo prilagojene zahteve.Operacijski sistem Windows, preprost in hiter.
-
PacBio-Transkriptom polne dolžine (nereferenčni)
Ob upoštevanju podatkov o zaporedju izoform Pacific Biosciences (PacBio) kot vhoda lahko ta aplikacija identificira zaporedja prepisov v polni dolžini (brez sestavljanja).S preslikavo zaporedij polne dolžine proti referenčnemu genomu je mogoče transkripte optimizirati z znanimi geni, transkripti, kodirnimi regijami itd. V tem primeru je mogoče doseči natančnejšo identifikacijo struktur mRNA, kot je alternativno spajanje itd.Skupna analiza s podatki zaporedja transkriptomov NGS omogoča obsežnejšo opombo in natančnejšo kvantifikacijo pri izražanju na ravni transkripta, kar v veliki meri koristi diferencialni ekspresiji in funkcionalni analizi na nižji stopnji.
-
Zbirke orodij
BMKCloud je vodilna bioinformatična platforma, ki zagotavlja rešitev na enem mestu za genomske programe, ki ji zelo zaupajo raziskovalci na različnih področjih, vključno z medicinskimi, kmetijskimi, okoljskimi itd. BMKCloud je zavezan zagotavljanju integriranih, zanesljivih in učinkovitih storitev, vključno s platformami in orodji za bioinformatično analizo , računalniški viri, javna baza podatkov, bioinformtični spletni tečaji itd. BMKCloud ima različna pogosto uporabljena bioinformatična orodja, vključno z genskimi opombami, evolucijskimi genetskimi orodji, ncRNA, nadzorom kakovosti podatkov, sestavljanjem, poravnavo, ekstrakcijo podatkov, mutacijami, statistiko, generatorjem figur, zaporedjem analiza itd.
-
majhna RNA
Majhne RNA so vrsta kratke nekodirajoče RNA s povprečno dolžino 18-30 nt, vključno z miRNA, siRNA in piRNA.Poročalo se je, da so te majhne RNA vključene v različne biološke procese, kot so razgradnja mRNA, inhibicija translacije, tvorba heterokromatina itd. Analiza zaporedja majhnih RNA je bila široko uporabljena v študijah o razvoju živali/rastlin, boleznih, virusih itd. platforma za analizo zaporedja je sestavljena iz standardne analize in naprednega rudarjenja podatkov.Na podlagi podatkov RNA-seq lahko standardna analiza doseže identifikacijo in napoved miRNA, napoved ciljnega gena miRNA, anotacijo in analizo ekspresije.Napredna analiza omogoča prilagojeno iskanje in ekstrakcijo miRNA, generiranje Vennovega diagrama, miRNA in izgradnjo ciljne genske mreže.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS je platforma za analizo za ponovno zaporedje celotnega genoma, ki je razvita na podlagi bogatih izkušenj na področju Biomarker Technologies.Ta platforma, ki je enostavna za uporabo, omogoča hitro predložitev integriranega delovnega toka analize, tako da preprosto nastavite nekaj osnovnih parametrov, ki ustrezajo podatkim zaporedja DNK, ustvarjenim s platforme Illumina in platforme za sekvenciranje BGI.Ta platforma je nameščena na visoko zmogljivem računalniškem strežniku, ki omogoča zelo učinkovito analizo podatkov v zelo omejenem času.Personalizirano rudarjenje podatkov je na voljo na podlagi standardne analize, vključno z mutiranimi genskimi poizvedbami, zasnovo primera PCR itd.
-
mRNA (referenca)
Transkriptom je povezava med genomsko genetsko informacijo in proteomom biološke funkcije.Regulacija transkripcijske ravni je najpomembnejši in najbolj raziskan način regulacije organizmov.Zaporedje transkriptomov lahko zaporedje transkriptom kadar koli v času ali pod katerim koli pogojem, z ločljivostjo, natančno na en nukleotid. Lahko dinamično odraža raven transkripcije genov, istočasno identificira in količinsko opredeli redke in normalne transkripte ter zagotovi strukturne informacije o vzorčni specifični prepisi.
Trenutno se tehnologija zaporedja transkriptomov široko uporablja v agronomiji, medicini in na drugih raziskovalnih področjih, vključno z regulacijo razvoja živali in rastlin, prilagajanjem okolja, imunsko interakcijo, lokalizacijo genov, genetsko evolucijo vrst ter odkrivanjem tumorjev in genetskih bolezni.
-
metagenomika (NGS)
Ta platforma za analizo je zasnovana za analizo metagenomskih podatkov s puško na podlagi dolgoletnih izkušenj.Sestavljen je iz integriranega poteka dela, ki vsebuje različne pogosto potrebne metagenomske analize, vključno z obdelavo podatkov, študijami na ravni vrste, študijami na ravni genske funkcije, zbiranjem metagenomov itd. Poleg tega so prilagojena orodja za rudarjenje podatkov na voljo v standardnem delovnem toku analize, vključno z poizvedbo genov in vrst. , nastavitev parametrov, generiranje osebnih figur itd.
-
LncRNA
Dolge nekodirajoče RNA (lncRNA) so vrsta transkriptov z dolžino, daljšo od 200 nt, ki ne morejo kodirati beljakovin.Akumulativni dokazi kažejo, da je večina lncRNA zelo verjetno funkcionalna.Visoko zmogljive tehnologije zaporedja in orodja za bioinformatično analizo nam omogočajo učinkovitejše razkrivanje zaporedij lncRNA in informacij o pozicioniranju ter nas vodijo do odkrivanja lncRNA s ključnimi regulativnimi funkcijami.BMKCloud s ponosom nudi našim strankam platformo za analizo sekvenciranja lncRNA za doseganje hitre, zanesljive in prilagodljive analize lncRNA.
-
GWAS
Študija povezovanja na ravni genoma (GWAS) je namenjena identifikaciji genetskih variant (genotipa), ki so povezane s specifičnimi lastnostmi (fenotipom).Študije GWA raziskujejo genetske označevalce, ki prečkajo celoten genom velikega števila posameznikov in s statistično analizo na populacijski ravni napovedujejo povezave genotip-fenotip.Ponovno zaporedje celotnega genoma lahko potencialno odkrije vse genetske različice.V povezavi s fenotipskimi podatki se lahko GWAS obdela za identifikacijo SNP, QTL in kandidatnih genov, povezanih s fenotipom, kar močno podpira sodobno vzrejo živali/rastlin.SLAF je samorazvita poenostavljena strategija zaporedja genoma, ki odkriva porazdeljene markerje po celotnem genomu, SNP.Te SNP, kot molekularne genetske markerje, je mogoče obdelati za študije povezav s ciljnimi lastnostmi.To je stroškovno učinkovita strategija pri ugotavljanju kompleksnih lastnosti, povezanih z genetskimi variacijami.
-
Nanopore Celotna transkriptomika
Kompleksne in spremenljive alternativne izoforme v organizmih so pomembni genetski mehanizmi za uravnavanje genske ekspresije in raznolikosti beljakovin.Natančna identifikacija struktur transkriptov je osnova za poglobljeno preučevanje vzorcev regulacije genske ekspresije.Platforma za sekvenciranje Nanopore je uspešno pripeljala transkriptomsko študijo na raven izoform.Ta platforma za analizo je zasnovana za analizo podatkov RNA-Seq, ustvarjenih na platformi Nanopore na podlagi referenčnega genoma, s čimer se dosežejo kvalitativne in kvantitativne analize tako na ravni genov kot na ravni transkriptov.
