BMKCloud Log in
条形 banner-03

Správy

Celodĺžkové transkriptómové sekvenovanie založené na nanopóroch

Sekvenovanie nanoporov sa odlišuje od iných sekvenčných platforiem tým, že nukleotidy sa čítajú priamo bez syntézy DNA a generujú dlhé čítania v desiatkach kilobáz.To umožňuje priame čítanie prepisov v plnej dĺžke a riešenie problémov v transkriptomických štúdiách.

√ Nízka odchýlka špecifická pre sekvenciu

√ Odčítanie cDNA v plnej dĺžke na štúdie génovej štruktúry

√ Menej údajov potrebných na pokrytie rovnakého počtu prepisov

√ Identifikácia viacerých izoforiem na gén

√ Kvantifikácia expresie na úrovni izoforiem

nanopóry-1

Typický bioinformatický kanál

Celá dĺžka-trans-bix-1024x254

Najnovšie úspešné prípady s technológiami Biomarker

1. Porovnávacie analýzy transkriptómov plnej dĺžky odhaľujú dynamiku vývoja kmeňa Gnetum luofuense

Časopis: Frontiers in Genetics

Zverejnené: marec 2021

Kľúčové slová: MinION |Alternatívne spájanie |APA |lncRNA |Rozdielne vyjadrené transkripty

Prečítajte si celý text

2. Jednosmerný pohyb malých RNA z výhonkov ku koreňom v medzidruhových heterograftoch

Časopis: Nature Plants

Zverejnené: január 2021

Kľúčové slová: Nanopore |Illumina |detekcia mobilnej mRNA v plnej dĺžke

3. Kompletná transkriptómová analýza koreňov špargle odhaľuje molekulárny mechanizmus tolerancie soli vyvolanej arbuskulárnymi mykoríznymi hubami

Časopis: Environmentálna a experimentálna botanika

Zverejnené: január 2021

Kľúčové slová: MinION |Rozdielne vyjadrené prepisy |Transkripčné faktory |Alternatívne spájanie

4. Fyziologické charakteristické zmeny a úplný transkriptóm koreňov a listov ruže (Rosa chinensis) v reakcii na stres zo sucha

Časopis: Fyziológia rastlín a buniek

Zverejnené: október 2020

Kľúčové slová: PromethION |Rozdielne vyjadrené prepisy |Funkčná predpoveď |Zostrihané izoformy |TF a lncRNA

5. Analýza a komplexné porovnanie PacBio a nanopórového sekvenovania RNA transkriptómu Arabidopsis

Časopis: Plant Method

Zverejnené: apríl 2020

Kľúčové slová: GridION |PromethION |PacBio pokračovanie |Illumina NovaSeq |Zarovnanie genómu |Identifikácia prepisu |Alternatívne spájanie |SSR |LncRNA |Kvantifikácia izoforiem

Novinky a najvýznamnejšie udalosti sa zameriava na zdieľanie najnovších úspešných prípadov s Biomarker Technologies, zachytávanie nových vedeckých úspechov, ako aj významných techník použitých počas štúdie.


Čas odoslania: Jan-08-2022

Pošlite nám svoju správu: