-
Proteomika
Proteomika zahŕňa aplikácie technológií na kvantifikáciu celkového obsahu proteínov v bunke, tkanive alebo organizme.Technológie založené na proteomike sa využívajú v rôznych kapacitách pre rôzne výskumné nastavenia, ako je detekcia rôznych diagnostických markerov, kandidátov na výrobu vakcín, pochopenie mechanizmov patogenity, zmena vzorcov expresie v reakcii na rôzne signály a interpretácia funkčných proteínových dráh pri rôznych ochoreniach.V súčasnosti sa kvantitatívne proteomické technológie delia najmä na kvantitatívne stratégie TMT, Label Free a DIA.
-
Metabolomika
Metabolóm je koncovým následným produktom genómu a pozostáva z celkového komplementu všetkých molekúl s nízkou molekulovou hmotnosťou (metabolitov) v bunke, tkanive alebo organizme.Metabolomika sa zameriava na meranie širokej šírky malých molekúl v kontexte fyziologických stimulov alebo chorobných stavov.Metabolomické metodológie spadajú do dvoch odlišných skupín: necielená metabolomika, zamýšľaná komplexná analýza všetkých merateľných analytov vo vzorke vrátane chemických neznámych látok pomocou GC-MS/LC-MS, a cielená metabolomika, meranie definovaných skupín chemicky charakterizovaných a biochemicky anotované metabolity.
-
Hromadná segregačná analýza
Hromadná segregantná analýza (BSA) je technika používaná na rýchlu identifikáciu genetických markerov spojených s fenotypom.Hlavný pracovný postup BSA zahŕňa výber dvoch skupín jednotlivcov s extrémne protichodnými fenotypmi, spojenie DNA všetkých jednotlivcov, aby vytvorili dve veľké časti DNA, identifikáciu rozdielnych sekvencií medzi dvoma skupinami.Táto technika sa vo veľkej miere využíva pri identifikácii genetických markerov silne spojených s cielenými génmi v genómoch rastlín/zvierat.
-
Sekvenovanie DNA/RNA – Nanopore Sequencer
ONT sekvenovanie je technológia sekvenovania elektrických signálov v reálnom čase s jednou molekulou založená na nanopóroch, princíp sekvenovania každej platformy je rovnaký.Dvojvláknová DNA/RNA sa naviaže na nanoporézny proteín uložený v biofilme a odvíja sa pod vedením motorického proteínu, pôsobením rozdielu napätia z oboch strán biofilmu, vlákna DNA/RNA prejdú proteínom nanopórového kanála v určitom čase. sadzba.V dôsledku rozdielov v chemických vlastnostiach rôznych báz na reťazci DNA/RNA, keď jedna báza alebo molekula DNA prechádza cez nanopórový kanál, spôsobí zmenu rôznych elektrických signálov.Detegovaním a korešpondenciou s týmito signálmi je možné vypočítať zodpovedajúce typy báz a dokončiť detekciu sekvencie v reálnom čase.
-
Sekvenovanie DNA/RNA -PacBio Sequencer
Sekvenčná platforma PacBio je platforma na dlhé čítanie, ktorá je známa aj ako jedna z technológií sekvenovania tretej generácie (TGS).Základná technológia, jedna molekula v reálnom čase (SMRT), umožňuje generovanie čítaní s dĺžkou desiatok kilogramov.Na základe „Sekvenovania podľa syntézy“ je rozlíšenie jedného nukleotidu dosiahnuté vlnovodom v nulovom režime (ZMW), kde je osvetlený iba obmedzený objem na dne (miesto syntézy molekúl).Okrem toho sekvenovanie SMRT do značnej miery zabraňuje sekvenčne špecifickému skresleniu v systéme NGS v tom, že väčšina krokov amplifikácie PCR sa v procese konštrukcie knižnice nevyžaduje.
Platforma: Sequel II, Revio
