BMKGENE poskytla služby sekvenovania priestorového transkriptómu pre štúdiu „STEEL umožňuje vymedzovanie časopriestorových transkriptomických dát s vysokým rozlíšením“, ktorá bola publikovaná v Briefings in Bioinformatics.
Táto štúdia navrhla bez dozoru a mnohoraký algoritmus založený na učení, priestorový transkriptóm bunkového zhlukovania typE (STEEL), ktorý identifikuje domény z priestorového transkriptómu zhlukovaním guľôčok vykazujúcich vysoko podobné profily génovej expresie a blízku priestorovú vzdialenosť na spôsob grafov.
Komplexné hodnotenie STEEL na priestorových transkriptomických súboroch údajov z platformy 10X Visium ukazuje, že nielenže dosahuje vysoké rozlíšenie na charakterizáciu jemných štruktúr mozgu myši, ale umožňuje aj integráciu viacerých tkanivových preparátov individuálne analyzovaných do väčšieho.
S pokrokom v technológiách priestorového transkriptómu bude mať naša metóda veľkú použiteľnosť pri identifikácii domén a rekonštrukcii atlasu génovej expresie.
Kliknitetuaby ste sa o tejto štúdii dozvedeli viac.
Čas odoslania: 20. októbra 2023