BMKGENE poskytla služby sekvenovania transkriptómov v plnej dĺžke pomocou technológií PacBio a ONT pre štúdiu s názvom „Porovnávacia analýza metód sekvenovania PacBio a ONT RNA na identifikáciu jedu Nemopilema Nomurai“, ktorá bola publikovaná v časopise Genomics.Cieľom štúdie bolo porovnať účinnosť metód sekvenovania PacBio a ONT RNA pri identifikácii jedu medúzy druhu Nemopilema nomurai.
Zistenia štúdie naznačujú, že ONT vo všeobecnosti produkoval vyššiu kvalitu nespracovaných údajov v transkriptómovej analýze, zatiaľ čo PacBio generoval dlhšie dĺžky čítania.Zistilo sa, že PacBio je lepší pri identifikácii kódujúcich sekvencií a nekódujúcej RNA s dlhým reťazcom, zatiaľ čo ONT bol nákladovo efektívnejší na predpovedanie alternatívnych zostrihových udalostí, jednoduchých opakovaní sekvencií a transkripčných faktorov.
Táto štúdia má významné dôsledky pre budúce technológie sekvenovania v morských medúzach a zdôrazňuje silu analýzy transkriptómu v plnej dĺžke pri objavovaní potenciálnych terapeutických cieľov pre dermatitídu medúz.
Kliknitetusa dozviete viac o tomto článku.
Čas odoslania: 20. decembra 2023