BMKCloud Log in
条形 banner-03

Produkty

Sekvenovanie DNA/RNA – Nanopore Sequencer

ONT sekvenovanie je technológia sekvenovania elektrických signálov v reálnom čase s jednou molekulou založená na nanopóroch, princíp sekvenovania každej platformy je rovnaký.Dvojvláknová DNA/RNA sa naviaže na nanoporézny proteín uložený v biofilme a odvíja sa pod vedením motorického proteínu, pôsobením rozdielu napätia z oboch strán biofilmu, vlákna DNA/RNA prejdú proteínom nanopórového kanála v určitom čase. sadzba.V dôsledku rozdielov v chemických vlastnostiach rôznych báz na reťazci DNA/RNA, keď jedna báza alebo molekula DNA prechádza cez nanopórový kanál, spôsobí zmenu rôznych elektrických signálov.Detegovaním a korešpondenciou s týmito signálmi je možné vypočítať zodpovedajúce typy báz a dokončiť detekciu sekvencie v reálnom čase.


Podrobnosti o službe

Demo výsledok

Funkcie podrobností o službe

Plošina

Veľkosť knižnice

Teoretický výťažok údajov (na bunku)

Jednozákladná presnosť

Aplikácie

Nanopore

8 kb, 10 kb, 20 kb, ultralong, cDNA-PCR

70-90 Gb/bunka

85 – 92 %

Volanie SV, De novo, Sekvenovanie v plnej dĺžke, Iso-Seq, Génová anotácia, Detekcia metylácie DNA

Výhody služby

● Viac ako 5 rokov skúseností na platforme sekvenovania PacBio s tisíckami uzavretých projektov s rôznymi druhmi.
● BMKGENE je oficiálnym partnerom Oxford Nanopore s dvojitou platformou RNA/DNA certifikácie.
● Existujú mainstreamové modely sekvencerov s kompletnou výbavou a dostatočnou priepustnosťou sekvenovania.
● Na základe platformy Nanopore bolo publikovaných viac ako 10 výskumov Denovo na zvieratách a rastlinách v medzinárodne uznávaných časopisoch.

Vzorové požiadavky


Typ vzorky

Suma

Koncentrácia (Qubit ®)

Objem

Čistota

Iní

Genomická DNA

Závisí od požiadavky na údaje

 ≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Jasný pík pri 260 nm, žiadne kontaminácie

Koncentráciu je potrebné merať pomocou Qubit a Qubit/Nanopore ≤ 2

Celková RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5;žiadne kontaminácie

Hodnota RIN ≥7,5

 

Pracovný postup služby

príprava vzorky

príprava vzorky

Príprava knižnice

Výstavba knižnice

Sekvenovanie

Sekvenovanie

Analýza dát

Analýza dát

Vzorová kontrola kvality

Dodanie projektu


  • Predchádzajúce:
  • Ďalšie:

  • Hodnotenie kvality údajov vzorky DNA

    Tabuľka 1. Štatistika čistých údajov.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26,37

    1,121,736

    25,90

    28 014

    15,764

    23 090

    143 181

    9

    Hodnotenie kvality údajov vzorky RNA

    Tabuľka 1. Štatistika čistých údajov.

    Názov súboru

    ClientID

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    MeanLength

    Maximálna dĺžka

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Obrázok 1. Rozloženie dĺžky čítania

    A3

    Obrázok 2. Rozdelenie skóre kvality čistých údajov

    A4

    Obrázok 3. Rozdelenie skóre dĺžky a kvality čistých údajov

    A5

    dostat ponuku

    Tu napíšte svoju správu a pošlite nám ju

    Pošlite nám svoju správu: