●Platformy:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten a BGI-DNB-T7
●Režimy sekvenovania:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kontrola kvality knižníc pred sekvenovaním
●Doručovanie sekvenčných údajov a kontrola kvality:doručenie správy o kontrole kvality a nespracovaných údajov vo formáte fastq po demultiplexovaní a filtrovaní čítaní Q30.
●Všestrannosť služieb sekvenovania:zákazník si môže zvoliť postupnosť podľa pruhu, prietokovej bunky alebo množstva údajov.
●Všestrannosť platforiem:Knižnice DNB je možné preniesť na platformy Illumina
●Rozsiahle skúsenosti so sekvenčnou platformou Illumina:s tisíckami uzavretých projektov s rôznymi druhmi.
●Doručenie správy o sekvenčnej kontrole kvality:s metrikami kvality, presnosťou údajov a celkovým výkonom projektu sekvenovania.
●Vyspelý proces sekvenovania:s krátkou dobou obratu.
●Prísna kontrola kvality: Implementujeme prísne požiadavky na kontrolu kvality, aby sme zaručili poskytovanie trvalo vysokokvalitných výsledkov.
Množstvo údajov (X) | Koncentrácia (qPCR/nM) | Objem |
X ≤ 50 Gb | > 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | > 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | > 4 nM | ≥ 20 μl |
Plošina | Koncentrácia (qPCR/nM) | Objem |
HiSeq X Ten | > 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | > 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | > 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | > 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | > 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Okrem koncentrácie a celkového množstva je potrebný aj vhodný vzor vrcholu.
Správa o kvalite knižnice sa poskytuje pred sekvenovaním, posúdením množstva knižnice a fragmentácie.
Tabuľka 1. Štatistika údajov o sekvenovaní.
ID vzorky | BMKID | Surové čítanie | Nespracované údaje (bp) | Čisté čítania (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Obrázok 1. Distribúcia kvality pozdĺž meraní v každej vzorke
Obrázok 2. Základná distribúcia obsahu
Obrázok 3. Distribúcia čítaného obsahu v sekvenčných dátach