-
ක්‍රොමැටින් ප්‍රතිශක්තිකරණ අනුපිළිවෙල (ChIP-seq)
ChIP-Seq මගින් histone වෙනස් කිරීම, පිටපත් කිරීමේ සාධක සහ අනෙකුත් DNA ආශ්‍රිත ප්‍රෝටීන සඳහා DNA ඉලක්කවල ප්‍රවේණි-පුළුල් පැතිකඩක් සපයයි.එය නිශ්චිත ප්‍රෝටීන්-ඩීඑන්ඒ සංකීර්ණ ප්‍රතිසාධනය කිරීම සඳහා ක්‍රොමැටින් ප්‍රතිශක්තිකරණ වර්ෂාපතනයේ (ChIP) වරණීයත්වය ඒකාබද්ධ කරයි, ප්‍රතිසාධනය කරන ලද DNA වල ඉහළ-නිලධාරී අනුක්‍රමණය සඳහා ඊළඟ පරම්පරාවේ අනුක්‍රමයේ (NGS) බලය සමඟ.මීට අමතරව, ප්‍රෝටීන්-ඩීඑන්ඒ සංකීර්ණ සජීවී සෛල වලින් ප්‍රතිසාධනය කර ඇති නිසා, බන්ධන ස්ථාන විවිධ සෛල වර්ග සහ පටක වල හෝ විවිධ තත්ව යටතේ සංසන්දනය කළ හැක.යෙදුම් පිටපත් කිරීමේ නියාමනයේ සිට සංවර්ධන මාර්ග දක්වා රෝග යාන්ත්‍රණ සහ ඉන් ඔබ්බට විහිදේ.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
Metagenomic අනුපිළිවෙල -NGS
Metagenome යනු පාරිසරික මෙටජෙනෝමය, මානව මෙටජෙනෝමය වැනි මිශ්‍ර ජීවීන්ගේ ප්‍රජාවක සම්පූර්ණ ජානමය ද්‍රව්‍ය එකතුවකි. එහි වගා කළ හැකි සහ වගා කළ නොහැකි ක්ෂුද්‍ර ජීවීන්ගේ ජෙනෝම අඩංගු වේ.Metagenomic sequencing යනු පාරිසරික සාම්පල වලින් ලබාගත් මිශ්‍ර ප්‍රවේණික ද්‍රව්‍ය විශ්ලේෂණය කිරීමට භාවිතා කරන අණුක මෙවලමකි, එය විශේෂ විවිධත්වය සහ බහුලත්වය, ජනගහන ව්‍යුහය, phylogenetic සම්බන්ධතාවය, ක්‍රියාකාරී ජාන සහ පාරිසරික සාධක සමඟ සහසම්බන්ධතා ජාලය පිළිබඳ සවිස්තරාත්මක තොරතුරු සපයයි.
වේදිකාව:Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
Metagenomic Sequencing-නැනෝපෝර්
Metagenomics යනු පාරිසරික සාම්පල වලින් ලබාගත් මිශ්‍ර ප්‍රවේණික ද්‍රව්‍ය විශ්ලේෂණය කිරීමට භාවිතා කරන අණුක මෙවලමකි, එය විශේෂ විවිධත්වය සහ බහුලත්වය, ජනගහන ව්‍යුහය, ෆයිලොජෙනටික් සම්බන්ධතාවය, ක්‍රියාකාරී ජාන සහ පාරිසරික සාධක සමඟ සහසම්බන්ධතා ජාලය යනාදිය පිළිබඳ සවිස්තරාත්මක තොරතුරු සපයයි. නැනෝපෝර් අනුක්‍රමික වේදිකා මෑතකදී හඳුන්වා දී ඇත. metagenomic අධ්‍යයනයට.කියවීමේ දිගෙහි එහි කැපී පෙනෙන කාර්ය සාධනය බොහෝ දුරට පහළ ප්‍රවාහ මෙටජෙනොමික් විශ්ලේෂණය, විශේෂයෙන් මෙටජෙනොම් එකලස් කිරීම වැඩි දියුණු කළේය.කියවීමේ දිග ප්‍රයෝජන ගනිමින්, නැනෝපෝර් මත පදනම් වූ මෙටජෙනොමික් අධ්‍යයනයට වෙඩි-තුවක්කු මෙටජෙනොමික්ස් හා සසඳන විට වඩා අඛණ්ඩ එකලස් කිරීමට හැකි වේ.Nanopore-පාදක metagenomics ක්ෂුද්‍රජීවීන්ගෙන් සම්පූර්ණ සහ සංවෘත බැක්ටීරියා ජෙනෝම සාර්ථකව ජනනය කළ බව ප්‍රකාශයට පත් කර ඇත (Moss, EL, et. al,ස්වභාවික ජෛව තාක්ෂණය, 2020)
වේදිකාව:Nanopore PromethION P48
-
සම්පූර්ණ ජෙනෝම බයිසල්ෆයිට් අනුක්‍රමණය
සයිටොසීන් (5-mC) හි පස්වන ස්ථානයේ DNA මෙතිලේෂන් ජාන ප්‍රකාශනය සහ සෛල ක්‍රියාකාරිත්වය කෙරෙහි මූලික බලපෑමක් ඇති කරයි.අසාමාන්‍ය මෙතිලේෂන් රටා පිළිකා වැනි තත්වයන් සහ රෝග කිහිපයක් සමඟ සම්බන්ධ වී ඇත.WGBS තනි පාදක විභේදනයකදී ජෙනෝමය-පුළුල් මෙතිල්කරණය අධ්‍යයනය කිරීමේ රන් ප්‍රමිතිය බවට පත්ව ඇත.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
ඉහළ ප්‍රරෝහණ අනුක්‍රමණය (ATAC-seq) සමඟ Transposase-ප්‍රවේශ විය හැකි ක්‍රොමැටින් සඳහා විශ්ලේෂණය
ATAC-seq යනු ජාන ප්‍රකාශනයේ ගෝලීය එපිජෙනටික් පාලනය සඳහා වැදගත් වන ජාන-පුළුල් ක්‍රොමැටින් ප්‍රවේශ්‍යතාව විශ්ලේෂණය කිරීම සඳහා වන ඉහළ-නිලදායිතා අනුක්‍රමික ක්‍රමයකි.අනුක්‍රමික ඇඩප්ටර අධි ක්‍රියාකාරී Tn5 ට්‍රාන්ස්පෝසේස් මගින් විවෘත ක්‍රොමැටින් ප්‍රදේශ වලට ඇතුල් කරනු ලැබේ.PCR විස්තාරණය කිරීමෙන් පසුව, අනුක්‍රමික පුස්තකාලයක් ඉදිකරනු ලැබේ.සියලුම විවෘත ක්‍රොමැටින් ප්‍රදේශ නිශ්චිත අවකාශ-කාල කොන්දේසියක් යටතේ ලබා ගත හැක, පිටපත් කිරීමේ සාධකයක බන්ධන අඩවි වලට පමණක් සීමා නොවී, හෝ යම් හිස්ටෝන් වෙනස් කළ කලාපයක්.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
අධි සංරක්‍ෂිත සහ අධි-විචල්‍ය කලාප යන දෙකම අඩංගු 16S සහ 18S rRNA හි උප ඒකකය ප්‍රොකැරියෝටික් සහ යුකැරියෝටික් ජීවීන් හඳුනාගැනීම සඳහා පරිපූර්ණ අණුක ඇඟිලි සලකුණකි.අනුපිළිවෙලින් ප්‍රයෝජන ගනිමින්, මෙම ඇම්ප්ලිකෝන සංරක්ෂණය කරන ලද කොටස් මත පදනම්ව ඉලක්ක කළ හැකි අතර, ක්ෂුද්‍රජීවී විවිධත්ව විශ්ලේෂණය, වර්ගීකරණය, ෆයිලොජනි ආදිය ආවරණය කරන අධ්‍යයනයන්ට දායක වන ක්ෂුද්‍රජීවී හඳුනාගැනීම සඳහා අධි-විචල්‍ය කලාප සම්පූර්ණයෙන්ම සංලක්ෂිත කළ හැකිය. තනි අණු තත්‍ය කාලීන (SMRT ) PacBio වේදිකාවේ අනුපිළිවෙලින් සම්පූර්ණ දිග ඇම්ප්ලිකන් (ආසන්න වශයෙන් 1.5 Kb) ආවරණය කළ හැකි ඉතා නිවැරදි දිගු කියවීම් ලබා ගැනීමට හැකියාව ලැබේ.ප්‍රවේණික ක්ෂේත්‍රය පිළිබඳ පුළුල් දැක්ම බැක්ටීරියා හෝ දිලීර ප්‍රජාව තුළ විශේෂ විවරණයේ විභේදනය බෙහෙවින් වැඩි දියුණු කළේය.
වේදිකාව:PacBio අනුක්‍රමික II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS ඇම්ප්ලිකොන් අනුක්‍රමය මඟින් ක්ෂුද්‍රජීවී ප්‍රජාවක් තුළ ෆයිලොජනි, වර්ගීකරණය සහ විශේෂ බහුලත්වය හෙළිදරව් කිරීම අරමුණු කරගනු ලබන්නේ, අතිශයින් සංවාද කළ සහ අධි විචල්‍ය කොටස් අඩංගු වන ගෘහ පාලන ජාන සලකුණු වල PCR නිෂ්පාදන විමර්ශනය කිරීමෙනි.Woeses et al,(1977) විසින් මෙම පරිපූර්ණ අණුක ඇඟිලි සලකුණු හඳුන්වාදීම හුදකලා-නිදහස් ක්ෂුද්‍ර ජීවී පැතිකඩ සවිබල ගන්වයි.16S (බැක්ටීරියා), 18S (දිලීර) සහ අභ්‍යන්තර පිටපත් කරන ලද ස්පේසර් (ITS, දිලීර) අනුපිළිවෙලින් බහුල විශේෂ මෙන්ම දුර්ලභ සහ හඳුනා නොගත් විශේෂ හඳුනා ගැනීමට ඉඩ සලසයි.මෙම තාක්ෂණය මිනිස් මුඛය, බඩවැල්, මළ මූත්‍රා යනාදී විවිධ පරිසරවල අවකල්‍ය ක්ෂුද්‍රජීවී සංයුතිය හඳුනා ගැනීම සඳහා බහුලව භාවිතා වන සහ ප්‍රධාන මෙවලමක් බවට පත්ව ඇත.
වේදිකාව:Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
බැක්ටීරියා සහ දිලීර සම්පූර්ණ ජෙනෝමය නැවත අනුක්‍රමණය කිරීම
බැක්ටීරියා සහ දිලීර සම්පූර්ණ ජෙනෝම නැවත අනුක්‍රමණය යනු දන්නා බැක්ටීරියා සහ දිලීර වල ජෙනෝම සම්පූර්ණ කිරීමට මෙන්ම බහු ජෙනෝම සංසන්දනය කිරීමට හෝ නව ජීවීන්ගේ ජෙනෝම සිතියම්ගත කිරීමට තීරණාත්මක මෙවලමකි.නිවැරදි විමර්ශන ජෙනෝම ජනනය කිරීම සඳහා, ක්ෂුද්‍රජීවී හඳුනාගැනීම් සහ අනෙකුත් සංසන්දනාත්මක ජෙනෝම අධ්‍යයනයන් සිදු කිරීම සඳහා බැක්ටීරියා සහ දිලීර වල සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුක්‍රමණය කිරීම ඉතා වැදගත් වේ.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
PacBio-සම්පූර්ණ දිග 16S/18S/ITS ඇම්ප්ලිකන් අනුක්‍රමණය
Amplicon (16S/18S/ITS) වේදිකාව සංවර්ධනය කර ඇත්තේ ක්ෂුද්‍රජීවී විවිධත්ව ව්යාපෘති විශ්ලේෂණයේ වසර ගණනාවක පළපුරුද්ද සමඟින්, එහි ප්‍රමිතිගත මූලික විශ්ලේෂණය සහ පුද්ගලාරෝපිත විශ්ලේෂණය අඩංගු වේ: මූලික විශ්ලේෂණය වත්මන් ක්ෂුද්‍රජීවී පර්යේෂණවල ප්‍රධාන ධාරාවේ විශ්ලේෂණ අන්තර්ගතය ආවරණය කරයි, විශ්ලේෂණ අන්තර්ගතය පොහොසත් සහ විස්තීර්ණ වේ. සහ විශ්ලේෂණ ප්රතිඵල ව්යාපෘති වාර්තා ආකාරයෙන් ඉදිරිපත් කරනු ලැබේ;පුද්ගලාරෝපිත විශ්ලේෂණයේ අන්තර්ගතය විවිධාකාර වේ.පුද්ගලාරෝපිත අවශ්‍යතා සාක්ෂාත් කර ගැනීම සඳහා මූලික විශ්ලේෂණ වාර්තාව සහ පර්යේෂණ අරමුණ අනුව නියැදි තෝරා ගත හැකි අතර පරාමිති නම්‍යශීලීව සැකසිය හැක.වින්ඩෝස් මෙහෙයුම් පද්ධතිය, සරල සහ වේගවත්.
-
PacBio-සම්පූර්ණ-දිග පිටපත (යොමු නොවන)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform අනුක්‍රමික දත්ත ආදානය ලෙස ගනිමින්, මෙම යෙදුමට පූර්ණ-දිග පිටපත් අනුපිළිවෙල (එකලස් කිරීමකින් තොරව) හඳුනා ගැනීමට හැකි වේ.යොමු ජෙනෝමයට එරෙහිව පූර්ණ-දිග අනුක්‍රම සිතියම්ගත කිරීමෙන්, දන්නා ජාන, පිටපත්, කේතීකරණ කලාප යනාදිය මඟින් පිටපත් ප්‍රශස්ත කළ හැක. මෙම අවස්ථාවෙහිදී, විකල්ප බෙදීම වැනි mRNA ව්‍යුහයන් වඩාත් නිවැරදිව හඳුනා ගැනීම සාක්ෂාත් කරගත හැකිය.NGS පිටපත් කිරීමේ අනුක්‍රමික දත්ත සමඟ ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණය, පිටපත් මට්ටමින් ප්‍රකාශනයේ වඩාත් සවිස්තරාත්මක විවරණයක් සහ වඩාත් නිවැරදි ප්‍රමාණකරණයක් සක්‍රීය කරයි, එය බොහෝ දුරට පහළ ප්‍රවාහ අවකල ප්‍රකාශනයට සහ ක්‍රියාකාරී විශ්ලේෂණයට ප්‍රතිලාභ ලබා දෙයි.
-
අඩු කළ නියෝජන Bisulfite අනුපිළිවෙල (RRBS)
DNA මෙතිලේෂන් පර්යේෂණ සෑම විටම රෝග පර්යේෂණවල උණුසුම් මාතෘකාවක් වී ඇති අතර, ජාන ප්‍රකාශනය සහ ෆීනෝ-ටයිපික් ගති ලක්ෂණ සමඟ සමීපව සම්බන්ධ වේ.RRBS යනු DNA මෙතිලේෂන් පර්යේෂණ සඳහා නිවැරදි, කාර්යක්ෂම සහ ආර්ථිකමය ක්‍රමයකි.ප්‍රවර්ධක සහ CpG දූපත් ප්‍රදේශ enzymatic cleavage (Msp I) මගින් පොහොසත් කිරීම, Bisulfite අනුපිළිවෙල සමඟ ඒකාබද්ධව, ඉහළ විභේදන DNA මෙතිලේෂන් හඳුනාගැනීමක් සපයයි.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
Prokaryotic mRNA අනුපිළිවෙල
mRNA අනුක්‍රමණය නිශ්චිත කොන්දේසි යටතේ සෛල තුළ ඇති සියලුම mRNA පිටපත්වල විස්තීර්ණ පැතිකඩ සවිබල ගන්වයි.මෙම අති නවීන තාක්ෂණය විවිධ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන් හා සම්බන්ධ සංකීර්ණ ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ, ජාන ව්‍යුහයන් සහ අණුක යාන්ත්‍රණ එළිදක්වන ප්‍රබල මෙවලමක් ලෙස සේවය කරයි.මූලික පර්යේෂණ, සායනික රෝග විනිශ්චය සහ ඖෂධ සංවර්ධනය තුළ පුළුල් ලෙස භාවිතා කර ඇති, mRNA අනුක්‍රමණය සෛලීය ගතිකත්වයේ සහ ජාන නියාමනයේ සංකීර්ණතා පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙයි.අපගේ ප්‍රොකරියෝටික් mRNA නියැදි සැකසීම rRNA ක්ෂය වීම සහ දිශානුගත පුස්තකාලය සකස් කිරීම සම්බන්ධ ප්‍රොකැරියෝටික් පිටපත් සඳහා සකස් කර ඇත.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq X
