-
Single-nucleus RNA අනුක්‍රමණය
තනි සෛල ග්‍රහණය කර ගැනීමේ ප්‍රගතිය සහ තනි පුද්ගල පුස්තකාල ඉදිකිරීමේ තාක්ෂණය ඉහළ-නිලදායිතා අනුපිළිවෙල සමඟ ඒකාබද්ධ වීම සෛලයෙන් සෛල පදනමින් ජාන ප්‍රකාශන අධ්‍යයනයට ඉඩ සලසයි.එය සංකීර්ණ සෛල ජනගහනය පිළිබඳ ගැඹුරු සහ සම්පූර්ණ පද්ධති විශ්ලේෂණයක් සක්‍රීය කරයි, එමඟින් සියලුම සෛලවල සාමාන්‍ය ලබා ගැනීමෙන් ඒවායේ විෂමජාතීත්වය වසං කිරීම බොහෝ දුරට වළක්වයි.
කෙසේ වෙතත්, සමහර සෛල තනි සෛල අත්හිටුවීම බවට පත් කිරීමට සුදුසු නොවේ, එබැවින් වෙනත් නියැදි සකස් කිරීමේ ක්‍රම අවශ්‍ය වේ - පටක වලින් න්‍යෂ්ටිය නිස්සාරණය කිරීම, එනම්, න්‍යෂ්ටිය කෙලින්ම පටක හෝ සෛල වලින් නිස්සාරණය කර තනි-න්‍යෂ්ටික අත්හිටුවීම සඳහා සකස් කරනු ලැබේ. සෛල අනුපිළිවෙල.
BMK 10× Genomics Chromium TM පාදක තනි සෛල RNA අනුක්‍රමික සේවාව සපයයි.ප්‍රතිශක්තිකරණ සෛල විභේදනය, පිළිකා විෂමතාවය, පටක වර්ධනය යනාදී රෝග ආශ්‍රිත අධ්‍යයනයන්හි මෙම සේවාව බහුලව භාවිතා වී ඇත.
අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ චිපය: 10× ජෙනොමික්ස්
වේදිකාව: Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
ශාක/සත්ව සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුක්‍රමණය
සම්පූර්ණ ප්‍රවේණි ප්‍රති-අනුක්‍රමණය, WGS ලෙසද හැඳින්වේ, තනි නියුක්ලියෝටයිඩ බහුරූපතාව (SNP), ඇතුළත් කිරීම් මකාදැමීම (InDel), ව්‍යුහ විචලනය (SV) සහ පිටපත් සංඛ්‍යා විචලනය (CNV) ඇතුළුව සමස්ත ජානයේම පොදු සහ දුර්ලභ විකෘති දෙකම හෙළිදරව් කිරීමට හැකියාව ලැබේ. )SVs SNP වලට වඩා විචල්‍ය පදනමේ විශාල කොටසක් සෑදී ඇති අතර ජීවී ජීවීන් කෙරෙහි සැලකිය යුතු බලපෑමක් ඇති ජෙනෝමය කෙරෙහි වැඩි බලපෑමක් ඇති කරයි.Tandem repeats, GC/AT පොහොසත් කලාප සහ අධි-විචල්‍ය කලාප වැනි සංකීර්ණ ප්‍රදේශ හරහා වර්ණදේහ හරස් කිරීම දිගු කියවීම් පහසු කරන බැවින් දිගු කියවීම් අනුක්‍රමික විශාල කොටස් සහ සංකීර්ණ වෙනස්කම් වඩාත් නිවැරදිව හඳුනා ගැනීමට ඉඩ සලසයි.
වේදිකාව: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 අවකාශීය පිටපත
අවකාශීය පිටපත් විද්යාව විද්‍යාත්මක නවෝත්පාදනයේ ඉදිරියෙන්ම සිටින අතර, ඒවායේ අවකාශීය සන්දර්භය ආරක්ෂා කර ගනිමින් පටක තුළ ඇති සංකීර්ණ ජාන ප්‍රකාශන රටා ගැන සොයා බැලීමට පර්යේෂකයන් බල ගන්වයි.විවිධ වේදිකා මධ්‍යයේ, BMKGene විසින් පුරසාරම් දොඩමින් BMKManu S1000 අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ චිපය නිපදවා ඇත.වැඩිදියුණු කළ විභේදනය5µM, උපසෛලීය පරාසය කරා ළඟා වෙමින්, සහ සක්‍රීය කරයිබහු මට්ටමේ විභේදන සැකසුම්.S1000 චිපය, දළ වශයෙන් ලක්ෂ 20ක පමණ ලප සහිත, අවකාශමය වශයෙන් තීරු කේත සහිත ග්‍රහණ පරීක්ෂණවලින් පටවන ලද පබළු සහිත ස්තර සහිත මයික්‍රොවේල් භාවිතා කරයි.අවකාශීය තීරු කේත වලින් පොහොසත් cDNA පුස්තකාලයක් S1000 චිපයෙන් සකස් කර පසුව Illumina NovaSeq වේදිකාවේ අනුපිළිවෙලට සකස් කර ඇත.අවකාශීය තීරු කේත සහිත සාම්පල සහ UMI වල සංයෝජනය ජනනය කරන ලද දත්තවල නිරවද්‍යතාවය සහ නිශ්චිතභාවය සහතික කරයි.BMKManu S1000 චිපයේ අද්විතීය ගුණාංගය එහි බහුකාර්‍යතාව තුළ පවතින අතර, විවිධ පටකවලට සහ විස්තර මට්ටම්වලට සියුම් ලෙස සුසර කළ හැකි බහු මට්ටමේ විභේදන සැකසුම් ඉදිරිපත් කරයි.මෙම අනුවර්තනය වීමේ හැකියාව චිපය විවිධ අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ අධ්‍යයනයන් සඳහා විශිෂ්ට තේරීමක් ලෙස ස්ථානගත කරයි, අවම ශබ්දයක් සහිත නිරවද්‍ය අවකාශීය පොකුරු කිරීම සහතික කරයි.
BMKManu S1000 චිප් සහ අනෙකුත් අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ තාක්ෂණයන් භාවිතා කරමින්, පර්යේෂකයන්ට සෛලවල අවකාශීය සංවිධානය සහ පටක තුළ සිදුවන සංකීර්ණ අණුක අන්තර්ක්‍රියා පිළිබඳ වඩා හොඳ අවබෝධයක් ලබා ගත හැකි අතර, පුළුල් පරාසයක ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන්ට යටින් පවතින යාන්ත්‍රණයන් පිළිබඳ අගනා අවබෝධයක් ලබා දේ. ඔන්කොලොජි, ස්නායු විද්යාව, සංවර්ධන ජීව විද්යාව, ප්රතිශක්ති විද්යාව සහ උද්භිද අධ්යයන.
වේදිකාව: BMKManu S1000 චිප් සහ Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium අවකාශීය පිටපත් කිරීම
අවකාශීය පිටපත් කිරීම යනු පර්යේෂකයන්ට ඒවායේ අවකාශීය සන්දර්භය ආරක්ෂා කරමින් පටක තුළ ජාන ප්‍රකාශන රටා විමර්ශනය කිරීමට ඉඩ සලසන අති නවීන තාක්‍ෂණයකි.මෙම වසමේ එක් ප්‍රබල වේදිකාවක් වන්නේ 10x Genomics Visium සහ Illumina අනුපිළිවෙලයි.10X Visium හි මූලධර්මය පටක කොටස් තැන්පත් කර ඇති නම් කරන ලද ග්‍රහණ ප්‍රදේශයක් සහිත විශේෂිත චිපයක් මත පිහිටා ඇත.මෙම ග්‍රහණ ප්‍රදේශයේ තීරු කේත සහිත ලප අඩංගු වන අතර, ඒ සෑම එකක්ම පටක තුළ ඇති අද්විතීය අවකාශීය ස්ථානයකට අනුරූප වේ.පටක වලින් අල්ලා ගන්නා ලද RNA අණු පසුව ප්‍රතිලෝම පිටපත් කිරීමේ ක්‍රියාවලියේදී අද්විතීය අණුක හඳුනාගැනීම් (UMIs) සමඟ ලේබල් කරනු ලැබේ.මෙම තීරු කේත සහිත ලප සහ UMI මගින් නිශ්චිත අවකාශීය සිතියම්ගත කිරීම සහ තනි සෛල විභේදනයකදී ජාන ප්‍රකාශනය ප්‍රමාණ කිරීම සක්‍රීය කරයි.අවකාශීය තීරු කේත සහිත සාම්පල සහ UMI වල සංයෝජනය ජනනය කරන ලද දත්තවල නිරවද්‍යතාවය සහ නිශ්චිතභාවය සහතික කරයි.මෙම අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ තාක්ෂණය භාවිතා කිරීමෙන්, පර්යේෂකයන්ට සෛලවල අවකාශීය සංවිධානය සහ පටක තුළ සිදුවන සංකීර්ණ අණුක අන්තර්ක්‍රියා පිළිබඳ ගැඹුරු අවබෝධයක් ලබා ගත හැකි අතර, ඔන්කොලොජි, ස්නායු විද්යාව, සංවර්ධන ජීව විද්යාව, ප්රතිශක්ති විද්යාව ඇතුළු විවිධ ක්ෂේත්‍රවල ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන්ට යටින් පවතින යාන්ත්‍රණයන් පිළිබඳ අගනා අවබෝධයක් ලබා දිය හැකිය. , සහ උද්භිද අධ්යයන.
වේදිකාව: 10X Genomics Visium සහ Illumina NovaSeq
-
සම්පූර්ණ දිග mRNA අනුක්‍රමණය-නැනෝපෝර්
NGS මත පදනම් වූ mRNA අනුක්‍රමණය ජාන ප්‍රකාශන ප්‍රමාණකරණය සඳහා බහුකාර්ය මෙවලමක් ලෙස ක්‍රියා කරන අතර, කෙටි කියවීම් මත රඳා පැවතීම සංකීර්ණ පිටපත් කිරීමේ විශ්ලේෂණයන්හි එහි කාර්යක්ෂමතාව සීමා කරයි.අනෙක් අතට, නැනෝපෝර් අනුක්‍රමණය දිගු-කියවන තාක්ෂණය භාවිතා කරයි, පූර්ණ-දිග mRNA පිටපත් අනුක්‍රමණය කිරීම සක්‍රීය කරයි.මෙම ප්‍රවේශය විකල්ප බෙදීම්, ජාන විලයනය, බහු-ඇඩෙනයිලීකරණය සහ mRNA සමස්ථානික ප්‍රමාණනය කිරීම පිළිබඳ පුළුල් ගවේෂණයකට පහසුකම් සපයයි.
නැනෝපෝර් අනුපිළිවෙල නැනෝපෝර් තනි අණු තත්‍ය කාලීන විද්‍යුත් සංඥා මත රඳා පවතී.මෝටර් ප්‍රෝටීන මගින් මෙහෙයවනු ලබන ද්විත්ව නූල් DNA ජෛව පටලයක තැන්පත් කර ඇති නැනෝපෝර් ප්‍රෝටීන සමඟ බන්ධනය වන අතර වෝල්ටීයතා වෙනසක් යටතේ නැනෝපෝර නාලිකාව හරහා ගමන් කරන විට ලිහිල් වේ.DNA නූල් මත විවිධ භෂ්ම මගින් ජනනය වන සුවිශේෂී විද්‍යුත් සංඥා හඳුනාගෙන තත්‍ය කාලීනව වර්ගීකරණය කර, නිවැරදි සහ අඛණ්ඩ නියුක්ලියෝටයිඩ අනුක්‍රමණයට පහසුකම් සපයයි.මෙම නව්‍ය ප්‍රවේශය කෙටි කියවීමේ සීමාවන් අභිබවා යන අතර සංකීර්ණ ප්‍රවේණික විශ්ලේෂණය සඳහා ගතික වේදිකාවක් සපයයි, සංකීර්ණ පිටපත් කිරීමේ අධ්යයන ඇතුළත් වේ.
වේදිකාව: Nanopore Promethion P48
-
සම්පූර්ණ දිග mRNA අනුක්‍රමණය -PacBio
NGS මත පදනම් වූ mRNA අනුක්‍රමණය ජාන ප්‍රකාශනය ප්‍රමාණනය කිරීම සඳහා බහුකාර්ය මෙවලමක් වන අතර, කෙටි කියවීම් මත රඳා පැවතීම සංකීර්ණ පිටපත් කිරීමේ විශ්ලේෂණයන්හි එහි භාවිතය සීමා කරයි.PacBio අනුක්‍රමණය (Iso-Seq), අනෙක් අතට, දිගු-කියවන තාක්ෂණය භාවිතා කරයි, පූර්ණ-දිග mRNA පිටපත් අනුක්‍රමණය කිරීම සක්‍රීය කරයි.මෙම ප්‍රවේශය, අවශ්‍ය වන ඉහළ දත්ත ප්‍රමාණය හේතුවෙන්, ජාන ප්‍රකාශන ප්‍රමාණකරණය සඳහා මූලික තේරීම නොවන නමුත්, විකල්ප බෙදීම්, ජාන විලයනය සහ බහු-ඇඩෙනයිලේෂන් පිළිබඳ පුළුල් ගවේෂණයකට පහසුකම් සපයයි.
PacBio අනුක්‍රමික තාක්ෂණය තනි-අණු, තත්‍ය-කාලීන (SMRT) අනුක්‍රමණය මත රඳා පවතින අතර, පූර්ණ-දිග mRNA පිටපත් ග්‍රහණය කර ගැනීමේ දී සුවිශේෂී වාසියක් සපයයි.මෙම නව්‍ය ප්‍රවේශයට ශුන්‍ය මාදිලියේ තරංග මාර්ගෝපදේශ (ZMWs), අනුක්‍රමණය කිරීමේදී DNA පොලිමරේස් ක්‍රියාකාරකම් තත්‍ය කාලීනව නිරීක්ෂණය කිරීමට හැකි ක්ෂුද්‍ර රෙදිපිළි ළිං භාවිතය ඇතුළත් වේ.මෙම ZMWs තුළ, PacBio's DNA පොලිමරේස් DNA අනුපූරක පොටක් සංස්ලේෂණය කරයි, සම්පූර්ණ mRNA පිටපත් පුරා විහිදෙන දිගු කියවීම් ජනනය කරයි.චක්‍රලේඛ එකඟතා අනුපිළිවෙලෙහි (CCS) PacBio ක්‍රියාකාරිත්වය එකම අණුව නැවත නැවත අනුපිළිවෙලින් අනුපිළිවෙලින් නිරවද්‍යතාවය වැඩි කරයි.උත්පාදනය කරන ලද HiFi කියවීම් NGS හා සැසඳිය හැකි නිරවද්‍යතාවයක් ඇති අතර, සංකීර්ණ පිටපත් කිරීමේ විශේෂාංග පිළිබඳ විස්තීර්ණ සහ විශ්වාසනීය විශ්ලේෂණයකට තවදුරටත් දායක වේ.වේදිකාව: PacBio Sequel II
-
යුකැරියෝටික් mRNA අනුක්‍රමණය-ඉලුමිනා
mRNA අනුක්‍රමණය නිශ්චිත කොන්දේසි යටතේ සෛල තුළ ඇති සියලුම mRNA පිටපත්වල විස්තීර්ණ පැතිකඩ සවිබල ගන්වයි.මෙම අති නවීන තාක්ෂණය විවිධ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන් හා සම්බන්ධ සංකීර්ණ ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ, ජාන ව්‍යුහයන් සහ අණුක යාන්ත්‍රණ එළිදක්වන ප්‍රබල මෙවලමක් ලෙස සේවය කරයි.මූලික පර්යේෂණ, සායනික රෝග විනිශ්චය සහ ඖෂධ සංවර්ධනය තුළ පුළුල් ලෙස භාවිතා කර ඇති, mRNA අනුක්‍රමණය සෛලීය ගතිකත්වයේ සහ ජාන නියාමනයේ සංකීර්ණතා පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙයි.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq X
-
යොමු නොවන mRNA අනුක්‍රමණය-Illumina
mRNA අනුක්‍රමණය නිශ්චිත කොන්දේසි යටතේ සෛල තුළ ඇති සියලුම mRNA පිටපත්වල විස්තීර්ණ පැතිකඩ සවිබල ගන්වයි.මෙම අති නවීන තාක්ෂණය විවිධ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන් හා සම්බන්ධ සංකීර්ණ ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ, ජාන ව්‍යුහයන් සහ අණුක යාන්ත්‍රණ එළිදක්වන ප්‍රබල මෙවලමක් ලෙස සේවය කරයි.මූලික පර්යේෂණ, සායනික රෝග විනිශ්චය සහ ඖෂධ සංවර්ධනය තුළ පුළුල් ලෙස භාවිතා කර ඇති, mRNA අනුක්‍රමණය සෛලීය ගතිකත්වයේ සහ ජාන නියාමනයේ සංකීර්ණතා පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙයි.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq X
-
දිගු කේත-නොවන අනුපිළිවෙල-ඉලුමිනා
දිගු කේතීකරණය නොවන RNA (lncRNAs) යනු අවම කේතීකරණ විභවයක් ඇති නියුක්ලියෝටයිඩ 200 ට වඩා දිගු RNA වන අතර කේතීකරණය නොවන RNA තුළ ප්‍රධාන මූලද්‍රව්‍ය වේ.න්‍යෂ්ටිය සහ සයිටොප්ලාස්මයේ දක්නට ලැබෙන, මෙම RNAs සෛලීය සහ අණුක ක්‍රියාවලීන් හැඩගැස්වීමේදී ඒවායේ වැදගත්කම අවධාරනය කරමින්, එපිජෙනටික්, ට්‍රාන්ස්ක්‍රිප්ෂනල් සහ පශ්චාත් පිටපත් කිරීමේ නියාමනය සඳහා තීරණාත්මක කාර්යභාරයක් ඉටු කරයි.LncRNA අනුක්‍රමණය යනු සෛල අවකලනය, ඔන්ටොජෙනිසිස් සහ මානව රෝග සඳහා ප්‍රබල මෙවලමකි.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq
-
කුඩා RNA අනුක්‍රමණය - Illumina
කුඩා RNA (sRNA) අණු, සාමාන්‍යයෙන් නියුක්ලියෝටයිඩ 200 ට අඩු දිග, microRNAs (miRNAs), කුඩා බාධා කරන RNAs (siRNAs) සහ piwi-interacting RNAs (piRNAs) ඇතුළත් වේ.මේවා අතර, නියුක්ලියෝටයිඩ 20-24ක් පමණ දිග miRNAs, විවිධ සෛලීය ක්‍රියාවලීන්හි ඒවායේ ප්‍රධාන නියාමන භූමිකාවන් සඳහා විශේෂයෙන් කැපී පෙනේ.පටක-විශේෂිත සහ අදියර-විශේෂිත ප්‍රකාශන රටා සමඟ, miRNAs විවිධ විශේෂයන් හරහා ඉහළ සංරක්ෂණයක් ප්‍රදර්ශනය කරයි.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq
-
circRNA අනුක්‍රමණය - Illumina
චක්‍ර RNA අනුක්‍රමණය (circRNA-seq) යනු කැනොනිකල් නොවන බෙදීම් සිදුවීම් හේතුවෙන් සංවෘත ලූප සාදන RNA අණු කාණ්ඩයක් වන වෘත්තාකාර RNA වර්ග පැතිකඩ සහ විශ්ලේෂණය කිරීම, මෙම RNA වලට වැඩි ස්ථායීතාවයක් ලබා දීමයි.සමහර circRNAs microRNA ස්පොන්ජ් ලෙස ක්‍රියා කරන බව පෙන්වා දී ඇති අතර, microRNA අනුක්‍රමණය කිරීම සහ ඒවායේ ඉලක්ක mRNA නියාමනය කිරීමෙන් වළක්වයි, අනෙකුත් circRNAs ප්‍රෝටීන සමඟ අන්තර් ක්‍රියා කිරීමට, ජාන ප්‍රකාශනය වෙනස් කිරීමට හෝ සෛලීය ක්‍රියාවලීන්හි භූමිකාවන් ඇති කිරීමට හැකිය.circRNA ප්‍රකාශන විශ්ලේෂණය මෙම අණු වල නියාමන භූමිකාවන් සහ විවිධ සෛලීය ක්‍රියාවලීන්, සංවර්ධන අවධීන් සහ රෝග තත්වයන් තුළ ඒවායේ වැදගත්කම පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙයි, ජාන ප්‍රකාශනයේ සන්දර්භය තුළ RNA නියාමනයේ සංකීර්ණත්වය පිළිබඳ ගැඹුරු අවබෝධයක් සඳහා දායක වේ.
-
සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල - Illumina
සම්පූර්ණ පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල විවිධ RNA අණු පැතිකඩ කිරීම සඳහා පුළුල් ප්‍රවේශයක් ලබා දෙයි, කේතනය (mRNA) සහ කේතීකරණය නොවන RNA (lncRNA, circRNA සහ miRNA) යන දෙකම ඇතුළත් වේ.මෙම තාක්ෂණය යම් අවස්ථාවක දී නිශ්චිත සෛලවල සම්පූර්ණ පිටපත ග්‍රහණය කර ගන්නා අතර, සෛලීය ක්‍රියාවලීන් පිළිබඳ පරිපූර්ණ අවබෝධයක් ලබා ගැනීමට ඉඩ සලසයි.“සම්පූර්ණ ආර්එන්ඒ අනුක්‍රමණය” ලෙසද හැඳින්වෙන එය, ට්‍රාන්ස්ක්‍රිප්ටෝම් මට්ටමින් සංකීර්ණ නියාමන ජාලයන් එළිදැක්වීම අරමුණු කරයි, තරඟකාරී ආවේණික RNA (ceRNA) සහ ඒකාබද්ධ RNA විශ්ලේෂණය වැනි ගැඹුරු විශ්ලේෂණයන් සක්‍රීය කරයි.විශේෂයෙන්ම circRNA-miRNA-mRNA-පාදක ceRNA අන්තර්ක්‍රියා සම්බන්ධ නියාමන ජාලයන් හෙළිදරව් කිරීමේදී, ක්‍රියාකාරී ගුනාංගීකරනය කරා ආරම්භක පියවර මෙය සනිටුහන් කරයි.
