ජෙනෝම් පරිණාමය
ස්වභාවය
සන්නිවේදන
ජෙනෝම අනුපිළිවෙල ගෝලීය විසරණ මාර්ග හෙළි කරන අතර මුහුදු අශ්ව පරිණාමයේ අභිසාරී ජාන අනුවර්තන යෝජනා කරයි
PacBio |ඉලුමිනා |Hi-C |WGS |ජාන විවිධත්වය |ජනවිකාස ඉතිහාසය |ජාන ප්රවාහය
Pacbio අනුක්‍රමණය, genome de novo එකලස් කිරීම සහ විවරණ සේවා සපයන ලද්දේ Biomarker Technologies විසිනි.
ඉස්මතු කිරීම්
1.15.5 Mb ක contig N50 සහිත උසස් තත්ත්වයේ වර්ණදේහ මට්ටමේ මුහුදු අශ්වයෙකු (Hippocampus erectus) ලබා ගන්නා ලදී.
2.ලොව පුරා මුහුදු අශ්ව විශේෂ 21 කින් ජෙනෝම 358 ක් ප්‍රතිනිර්මාණය කරන ලදී.
3.මුහුදු අශ්වයන් ඔලිගොසීන් යුගයේ අගභාගයේදී පරිණාමය වූ අතර ඉන් පසු වට-ගෝලීය ජනපදකරණ මාර්ග හඳුනාගෙන සාගර ධාරා සහ පැලියෝටම්පෝරල් මුහුදු මාර්ග විවරයන්හි ගතිකතාවයන් වෙනස් කිරීමට සම්බන්ධ කර ඇත.
4. පුනරාවර්තන "අස්ථි කශේරුකා" අනුවර්තන ෆීනෝටයිප් වල ජානමය පදනම ප්‍රධාන සංවර්ධන ජානයක ස්වාධීන ආදේශන වලට සම්බන්ධ වේ.
5. සාගර ධාරා හරහා ඔරු පැදීම දුර්වල විසුරුම සඳහා වන්දි ලබා දෙන අතර වේගයෙන් අනුවර්තනය වීම නව වාසස්ථාන ජනපදකරණයට පහසුකම් සපයයි
ජයග්රහණ
Fig. 1 මුහුදු අශ්ව නිදර්ශක 358 ක ජාන විවිධත්වය සහ ෆයිලොජෙනටික් සම්බන්ධතා
ඒවර්ණදේහ 22ක් හරහා මුහුදු අශ්ව විශේෂ 21ක නියුක්ලියෝටයිඩ විවිධත්වයේ (π) රටා සහිත නියැදි මුහුදු අශ්වයන් සඳහා භූගෝලීය නියැදීම් ස්ථාන.b මුහුදු අශ්වයන් 358 කින් යුත් ජෙනෝමය-පුළුල් SNP වලින් ඉදිකරන ලද අසල්වැසි ගස.(a) හි ස්ථාන පින් සංකේත සහ (b) හි ශාඛා පසුබිම එකිනෙකට අනුරූප වේ.
Fig. 2 මුහුදු අශ්වයන්ගේ ජනපදකරණය සහ ජනවිකාස ඉතිහාසය
ඒමුහුදු අශ්ව විශේෂ 21ක් සඳහා ෆයිලොජෙනටික් ගස සහ අපසරන කාලය ඇස්තමේන්තු කර ඇත.ශාඛා රේඛා ඝනකම ජනගහන ප්රමාණයේ ඇස්තමේන්තුවලට (Ne) අනුරූප වන අතර වර්ණ විවිධ පෙළපත් පෙන්නුම් කරයි.I-III සංකේත ක්‍රමාංකන ලක්ෂ්‍ය දක්වයි.b-d අපසරන කාලය, ව්‍යාප්තිය, විකාශන සිදුවීම් සහ සාගර ධාරා (සුදු ඊතල) මත පදනම්ව මුහුදු අශ්වයන්ගේ ජනපදකරණ මාර්ග (වර්ණ ඊතල) පුරෝකථනය කරන ලදී.b ඉන්දු-ඕස්ට්‍රේලියානු දූපත් සමූහය Ma 18-23 මුහුදු අශ්වයන් විවිධාංගීකරණය වී ගෝලීයව විසිරී යාමට පෙර හිපොකැම්පස් ගණයේ මූලාරම්භයේ (රතු සලකුණු කිරීම) මධ්‍යස්ථානය විය.c මුහුදු අශ්වයන් මුලදී අත්ලාන්තික් සාගරයේ ජනාවාස ඇති කළේ ටෙත්යන් මුහුදු මාර්ගය විවෘත කිරීම හරහා වන අතර, එය වසා දැමීමෙන් පසුව (මා 7-13 අතර පර්යන්ත සිදුවීම), මෙම ටෙත්යන් පරම්පරාව ඉන්දියන් සාගරයේ සහෝදර පරම්පරාවෙන් වෙන් කරන ලදී.දෙවැන්න, පසුව අරාබි මුහුදේ වේගයෙන් විවිධාංගීකරණය වී (කහ සලකුණු කිරීම), මුහුදු අශ්වයන් විවිධාංගීකරණය කිරීමේ දෙවන මධ්‍යස්ථානයක් ස්ථාපිත කළේය.d අත්ලාන්තික් සාගරයේ දෙවන මුහුදු අශ්ව ජනපදකරණ සිදුවීමක් ඉන්දියානු සාගරයේ සිට 5Ma පමණ දකුණු අප්‍රිකානු තුඩය පසුකර අවසානයේ ආසන්න වශයෙන් 3.6 Ma තවමත් විවෘත පැනමා මුහුදු මාර්ගය හරහා නැගෙනහිර පැසිෆික් සාගරයට ළඟා විය.
Fig. 3 ජාන ප්රවාහය සහ ඵලදායී ජනගහන ප්රමාණයේ උච්චාවචනයන්
ඒදකුණු අත්ලාන්තික් සාගරයේ වාසය කරන විශේෂ අතර ජාන ප්රවාහය අනාවරණය විය.G-PhoCS මගින් අඩු කරන ලද සංක්‍රමණ අනුපාතය ලෙස ජාන ප්රවාහය සුදු රේඛා අසල පෙන්වයි.ඊතලවල ඝණකම සහ දිශාව පිළිවෙලින් ජාන ප්රවාහයේ අනුපාත සහ දිශාවට අනුරූප වේ.b PSMC මගින් ඵලදායී ජනගහන ප්රමාණයේ උච්චාවචනයන්.x අක්ෂය වර්තමානයට පෙර වසරවල කාලය නියෝජනය කරන අතර y අක්ෂය ඵලදායී ජනගහන ප්‍රමාණය නියෝජනය කරයි.ප්‍රස්ථාර ප්‍රධාන වශයෙන් විවිධ ව්‍යාප්ති ප්‍රදේශ සහිත එක් එක් විශේෂ සඳහා භූගෝලීය ව්‍යාප්තිය අනුව සංවිධානය කර ඇත.c පසුගිය වසර මිලියන 1 තුළ මුහුදු මට්ටම මීටර 33 කින් වෙනස් විය.කහ ඉර අවසාන ගෝලීය අන්තර් ග්ලැසියර උච්චය පෙන්නුම් කරන අතර සයන් සෙවන අවසාන ග්ලැසියර උපරිම කාල පරිච්ඡේදය දක්වයි.
රූපය 4 කොඳු ඇට පෙළේ පරිණාමය.
ඒවමේ, මුහුදු අශ්වයන්ගේ කොඳු ඇට පෙළේ ස්වාධීන පරිණාමය පෙන්නුම් කරන විශේෂ ගස.ශාඛාවේ දිග අඩවියකට ආදේශන ගණන දක්වයි.කටු සහිත මුහුදු අශ්ව විශේෂ හතරක් නිල් පැහැයෙන් උද්දීපනය කර ඇත.ඝන ශාඛා bmp3 ජාන සඳහා සමාන නොවන-පරිමාණ ආදේශක (dN/dS) ඉහළ අනුපාතවලට අනුරූප වේ.Bmp3 ජාන සඳහා කැනොනිකල් සහ සාමාන්‍යකරණය කරන ලද McDonald and Kreitman පරීක්ෂණය (MKT) පසුබිම් වර්ණ මගින් උද්දීපනය කරන ලද අපසාරී කටු සහ කටු නොවන ලක්ෂණ සහිත යුගල වශයෙන් සහෝදර විශේෂ තුනක් සඳහා සිදු කරන ලද අතර, ඒවායේ වැදගත්කම මට්ටම් පිළිවෙලින් නිල් සහ රතු අකුරු සහිත p අගය මගින් පෙන්නුම් කරන ලදී.නිවැරදි, bmp3 ප්‍රෝටීන් වල ඇමයිනෝ අම්ල ආදේශන සංසන්දනය කිරීම, කටු සහිත මුහුදු අශ්වයන් තුළ බහුරූපී සහ ස්ථාවර ආදේශන පිළිවෙලින් රතු සහ නිල් කවයන් සමඟ දැක්වේ.b කටු නොවන විශේෂවලට සාපේක්ෂව කටු සහිත මුහුදු අශ්වයන් තුළ bmp3 හි dN/dS අගයන් බෙදා හැරීම.c bmp3 මගින් කේතනය කරන ලද ප්‍රෝටීන සඳහා ප්‍රතිනිර්මාණය කරන ලද ෆයිලොජෙනටික් ගසෙහි ස්වාධීන පරිණාමය.d හිපොකැම්පස් ඉරෙක්ටස් හි bmp3 හි ස්ථානීය දෙමුහුන්කරණයේ සම්පූර්ණ කන්ද.
යොමුව
Li C et al.ජෙනෝම අනුපිළිවෙල ගෝලීය විසරණ මාර්ග හෙළි කරන අතර මුහුදු අශ්ව පරිණාමයේ අභිසාරී ජාන අනුවර්තනයන් යෝජනා කරයි.නැට් කොමියුනිස්ට්.2021 පෙබරවාරි 17;12(1):1094.
පුවත් සහ විශේෂ අවස්ථා Biomarker Technologies සමඟ නවතම සාර්ථක සිද්ධීන් බෙදාගැනීම, නව විද්‍යාත්මක ජයග්රහණ මෙන්ම අධ්‍යයනයේදී යොදාගත් ප්‍රමුඛ තාක්ෂණික ක්‍රම ග්‍රහණය කර ගැනීම අරමුණු කරයි.
පසු කාලය: ජනවාරි-06-2022