ක්ෂුද්ර ජීවී පරිසර විද්යාව
කෘෂිකාර්මික තීව්‍රතාවය ක්ෂුද්‍රජීවී ජාල සංකීර්ණත්වය සහ මූලයන් තුළ ඇති කීස්ටෝන් ටැක්සා බහුලත්වය අඩු කරයි
සම්පූර්ණ දිග ඇම්ප්ලිකන් අනුක්‍රමණය (ITS) |PacBio HIFI
ඉස්මතු කිරීම්
Aදුර්වල පෝෂක භාවිතය කාර්යක්ෂමතාව, භූගත ජලය eutrofiation, පසෙහි ගුණාත්මක භාවය පිරිහීම, යනාදිය ඇතුළු එහි අහිතකර පාරිසරික බලපෑම් හේතුවෙන් කෘෂිකාර්මික තීව්‍රතාවය වඩ වඩාත් ගැටලුකාරී වී ඇත. හානිය අවම කිරීම සඳහා වගා නොකළ සහ කාබනික වගාව ඇතුළු විකල්ප ගොවිතැන් ක්‍රම බහුලව භාවිතා කර ඇත.ක්ෂුද්‍රජීවී ප්‍රජාව කෘෂි පරිසර පද්ධතියේ ඵලදායිතාව සහ තිරසාර බව සඳහා අත්‍යවශ්‍ය කාර්යභාරයක් ඉටු කරයි.කෙසේ වෙතත්, විවිධ ගොවිතැන් ක්‍රම මූල ක්ෂුද්‍රජීවයට බලපාන්නේ කෙසේද යන්න තරමක් අපැහැදිලි ය.
පර්යේෂණාත්මක නිර්මාණය
අත්හදා බැලීම්
Sතෙල් සහ මූල (ඩීඑන්ඒ) සාම්පල කෘෂිකාර්මික ගොවිබිම් 60කින් තිරිඟු කෙත්වලින් (20 බැගින්)
Grouping: 1. සම්මුතිය (බිඹුරු සමග);2. සම්මුතිය (නොවැඩ කිරීම);3. කාබනික ගොවිබිම්
Sසමීකරණ උපාය: පූර්ණ-දිග ඇම්ප්ලිකන් අනුක්‍රමණය (ITS)
Primers: ITS1F-ITS4 (සම්පූර්ණ ITS කලාපයම ඉලක්ක කරගනිමින් ~630 bp)
Sසමීකරණ වේදිකාව: PacBio RS II
ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය
ප්රතිපල
On සාමාන්‍යයෙන් එක් අඩවියකට OTU 357 ක් හඳුනාගෙන ඇති අතර සියලුම අඩවි 60 න් 837 OTU.මූල දිලීර ප්‍රජාවන්ගේ ඇල්ෆා විවිධත්වය ගොවිතැන් ක්‍රම තුනක් අතර සැලකිය යුතු වෙනසක් නොපෙන්වයි.කෙසේ වෙතත්, බීටා විවිධත්ව විශ්ලේෂණයේදී, මූල දිලීර ප්‍රජා ව්‍යුහය මත ගොවිතැන් ක්‍රමයේ ප්‍රබල බලපෑමක් පෙන්නුම් කරමින්, එකිනෙකට වෙනස් පොකුරු තුනක් පිහිටුවා ඇත.
රූප සටහන 1. ඇල්ෆා විවිධත්වය (ෂැනන් දර්ශකය සහ ප්‍රජා සංයුතිය ) සහ බීටා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය (ප්රධාන ඛණ්ඩාංකවල කැනොනිකල් විශ්ලේෂණය) මූල දිලීර ප්‍රජාවන් මත
Ten Keystone Taxa නිර්වචනය කරන ලද්දේ ගොවිතැන් ක්‍රම තුනක් හරහා සමස්ත දිලීර ප්‍රජාවන්ගේ ජාලය පදනම් කරගෙන ය: ඉහළම මට්ටම, ඉහළම සමීප මධ්‍යස්ථභාවය සහ අඩුම මධ්‍යස්ථභාවය සහිත ඉහළම නෝඩ් 10 තෝරා ගන්නා ලදී.ඉන් හතක් mycorrhizal නියෝගවලට අයත් විය.
රූපය 2. ගොවිතැන් පද්ධති තුනක මූල දිලීර ප්‍රජාවන් පිළිබඳ සමස්ත ජාලය
Fසන්නද්ධ-පද්ධති විශේෂිත ජාලයන් නොඉඳුල් සහ සාම්ප්‍රදායික ජාලයට වඩා දෙගුණයක් වැඩි දාර සහ සම්බන්ධිත නෝඩ් සහිත කාබනික ජාලයේ සැලකිය යුතු ඉහළ සම්බන්ධතාවයක් පෙන්නුම් කරයි.එපමනක් නොව, කාබනික ගොවිතැන් ජාලය අනෙකුත් ඒවාට සාපේක්ෂව බොහෝ ප්රධාන ගල් ටැක්සා (දියමන්ති) රඳවා තබා ඇති අතර, එහි සංකීර්ණත්වය සහ සම්බන්ධතාවයට සහාය විය.
රූපය 3. ගොවිතැන් පද්ධතියට විශේෂිත මූල දිලීර ජාල
Aකෘෂිකාර්මික තීව්‍රතාවය සහ මූල දිලීර ජාල සම්බන්ධතාවය අතර ප්‍රබල සෘණාත්මක සම්බන්ධයක් නිරීක්ෂණය විය.අහඹු වනාන්තර විශ්ලේෂණය මගින් Keystone Taxa හි ප්රධාන ධාවක අනාවරණය විය: පාංශු පොස්පරස්, තොග ඝනත්වය, pH සහ mycorrhizal යටත් විජිතකරණය.
රූපය 4. කෘෂිකාර්මික තීව්‍රතාවය සහ ගොවිතැන් පද්ධති තුනක් (A සහ B) හරහා ජාල සම්බන්ධතාවය;අහඹු වනාන්තර විශ්ලේෂණය (C) සහ කෘෂිකාර්මික තීව්‍රතාවය සහ AMF ජනපදකරණය (D) අතර සම්බන්ධතාවය
තාක්ෂණ
සම්පූර්ණ දිග ඇම්ප්ලිකන් අනුපිළිවෙල
A"තුන්වන පරම්පරාවේ අනුපිළිවෙල" වේදිකාවට පැමිණීම, ඉලක්කගත කලාපවල සීමාවන් සහ de novo එකලස් කිරීමේදී ඇති වූ කරදර ජයගෙන ඇත.පැසිෆික් ජෛව විද්යාව (PacBio) විසින් අනුක්‍රමික කියවීම කිලෝබේස් දස ගණනක් දක්වා සාර්ථකව දීර්ඝ කර ඇත, එමඟින් බැක්ටීරියා තුළ 16s rRNA (1,000 bp-1,500 bp) හෝ 18S rRNA (1,500 bp-2,000 bp) සහ ITS000 bp පූර්ණ-දිග කියවීම් ලබා ගැනීමට අපට ඉඩ සලසයි. යුකැරියෝටික් වල කලාප (400 bp-900 bp).ප්‍රවේණික ක්ෂේත්‍රය පිළිබඳ පුළුල් දැක්ම විශේෂ විවරණ සහ ක්‍රියාකාරී ජානවල විභේදනය බෙහෙවින් වැඩි දියුණු කළේය.පාදක නිරවද්‍යතාවය පිළිබඳ දිගුකාලීන ගැටළුව PacBio CCS ස්වයං-නිවැරදි කිරීම මගින් විසඳා ඇති අතර, එය 99% කට වඩා කියවීමේ නිරවද්‍යතාවයකින් HIFI කියවීම් ජනනය කරයි.
OTU විවරණයේ කාර්ය සාධනය
Tදිගු කියවීම් සහ ඉහළ කාර්යසාධනය යන දෙකෙහිම වාසි ලබා ගනිමින්, විවරණයේ නිරවද්‍යතාවය නාටකාකාර ලෙස වැඩි කළ හැකි අතර ක්ෂුද්‍රජීවී හඳුනාගැනීමේදී “විශේෂ මට්ටමේ” විභේදනයක් ලබා ගත හැකිය.
යොමුව
බැනර්ජි, සමීරන් සහ වෙනත් අය."කෘෂිකාර්මික තීව්‍රතාවය ක්ෂුද්‍රජීවී ජාල සංකීර්ණත්වය සහ මූලයන් තුළ ඇති කීස්ටෝන් ටැක්සා බහුලත්වය අඩු කරයි."ISME සඟරාව (2019).
තාක්ෂණය සහ විශේෂ අවස්ථා විවිධ reseach ක්ෂේත්‍රවල විවිධ අධි-ක්‍රියාකාරී අනුක්‍රමික තාක්ෂණයන් මෙන්ම පර්යේෂණාත්මක සැලසුම් සහ දත්ත කැණීමේ දීප්තිමත් අදහස් බෙදාගැනීම අරමුණු කරයි.
පසු කාලය: ජනවාරි-08-2022