● බහුලව අවශ්ය විශ්ලේෂණ අට අඩංගු විස්තීරණ විශ්ලේෂණ පැකේජය
● ප්රතිඵල පිළිබඳ සවිස්තරාත්මක සහ පහසුවෙන් තේරුම් ගත හැකි විග්රහයක් සහිත විශ්ලේෂණයේ ඉහළ විශ්වසනීයත්වය
● හොඳින් සැලසුම් කර ඇති ප්රකාශනයට සූදානම් රූප
● ඉහළ නිපුණතා සහිත ජෛව තොරතුරු කණ්ඩායම විවිධ පුද්ගලීකරණය කළ විශ්ලේෂණ ඉල්ලීම් ඉටු කරයි
● විශ්ලේෂණයේ වැඩි නිරවද්යතාවයක් සහිත කෙටි හැරවුම් කාලය
● සමුච්චිත ප්රකාශිත බලපෑම් සාධකය 900 ට වඩා වැඩි සාර්ථක සිද්ධීන් 90කට වඩා වැඩි අත්දැකීමක්
ඇස්තමේන්තුගත හැරවුම් කාලය | විශේෂ ගණන | විශ්ලේෂණය කරයි |
වැඩ කරන දින 30 යි | 6 - 12 | ජාන පවුල් පොකුරු ජාන පවුලේ ව්යාප්තිය සහ හැකිලීම Phylogenetic ගස් ඉදිකිරීම අපසාරී කාලය ඇස්තමේන්තු (ෆොසිල ක්රමාංකනය අවශ්ය) LTR ඇතුළත් කිරීමේ කාලය (ශාක සඳහා) සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් කිරීම (ශාක සඳහා) වරණීය පීඩනය සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය |
● ජාන පවුල
● Phylogenetics
● අපසරන කාලය
● වරණීය පීඩනය
● සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය
පටක සඳහා
විශේෂ | පටක | මිනුම් | PacBio CCS |
සත්ව | අභ්යන්තර පටක | 0.5 ~ 1 ග්රෑම් | ≥ 3.5g |
මාංශ පේශි පටක | |||
≥ 5.0g | |||
≥ 5.0mL | |||
ක්ෂීරපායී රුධිරය | |||
≥ 0.5mL | |||
කුකුළු මස් / මාළු ලේ | |||
පැල | නැවුම් කොළ | 1 ~ 2 ග්රෑම් | ≥ 5.0g |
පෙති / කඳ | 1 ~ 2 ග්රෑම් | ≥ 10.0g | |
මූල / බීජ | 1 ~ 2 ග්රෑම් | ≥ 20.0g | |
සෛල | සංස්කෘතික සෛලය | - | ≥ 1 x 108 |
සමීපව සම්බන්ධ විශේෂවල ප්රවේණි අනුක්රමික ගොනු(.fasta) සහ විවරණ ගොනු (.gff3)
*මෙහි පෙන්වා ඇති ආදර්ශන ප්රතිඵල සියල්ල Biomarker Technologies සමඟ ප්රකාශිත ජෙනෝම වලින් වේ
1.LTR ඇතුළු කිරීමේ කාලය ඇස්තමේන්තු කිරීම: අනෙකුත් විශේෂ හා සසඳන විට, වයිනිං රයි ජෙනෝමය තුළ LTR-RTs ඇතුළත් කිරීමේ වේලාවන්හි අද්විතීය ද්විමාධ්ය ව්යාප්තියක් රූපයේ දැක්වේ.මෑත කාලීන මුදුන වසර මිලියන 0.5 කට පමණ පෙර දර්ශනය විය.
Li Guang et al.,ස්වභාවික ජාන විද්යාව, 2021
2.චායෝටේ (Sechium edule) මත Phylogeny සහ ජාන පවුල් විශ්ලේෂණය : chayote සහ ජාන පවුලේ අනෙකුත් ආශ්රිත විශේෂ 13 විශ්ලේෂණය කිරීමෙන්, Chayote සර්ප කරවිල (Trichosanthes anguina) සමඟ වඩාත් සමීප සම්බන්ධයක් ඇති බව සොයා ගන්නා ලදී.27-45 Mya දී සර්ප කරවිල වලින් ලබාගත් Chayote සහ 25±4 Mya හි chayote හි සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් (WGD) නිරීක්ෂණය කරන ලදී, එය cucuibitaceae හි තුන්වන WGD සිදුවීම වේ.
Fu A et al.,ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021
3.Synteny විශ්ලේෂණය: පලතුරු වර්ධනයේ දී phytohormones සම්බන්ධ සමහර ජාන චයෝටේ, සර්ප කරවිල සහ ස්කොෂ් වල දක්නට ලැබේ.චයෝට් සහ ස්කොෂ් අතර සහසම්බන්ධය චයෝටේ සහ සර්ප කරවිල අතර ඇති සම්බන්ධතාවයට වඩා තරමක් වැඩි ය.
Fu A et al.,ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021
4.ජාන පවුල් විශ්ලේෂණය: G.thurberi සහ G.davidsonii ජෙනෝමවල ජාන පවුල් ව්යාප්තිය සහ හැකිලීම පිළිබඳ KEGG සුපෝෂණය මගින් ස්ටෙරොයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණය සහ බ්රැසිනොස්ටෙරොයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණය ආශ්රිත ජාන පුළුල් වී ඇති බව පෙන්නුම් කරයි.
Yang Z et al.,BMC ජීව විද්යාව, 2021
5.සම්පූර්ණ ප්රවේණි අනුපිටපත් විශ්ලේෂණය: 4DTV සහ Ks බෙදාහැරීමේ විශ්ලේෂණය සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් කිරීමේ සිදුවීම පෙන්වයි.අනුපිටපත් සිදුවීම් පෙන්නුම් කරන අන්තර් විශේෂවල මුදුන්.අන්තර් විශේෂවල උච්ච විශේෂ සිදුවීම් පෙන්වයි.විශ්ලේෂණයෙන් පෙන්නුම් කළේ සමීපව සම්බන්ධ අනෙකුත් විශේෂ තුන සමඟ සසඳන විට, O. europaea වඩාත් මෑතක දී මහා පරිමාණ ජාන අනුපිටපත් කිරීමකට ලක් වූ බවයි.
රාඕ ජී සහ අල්.ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021
BMK නඩුව
කටු නැති රෝස: තෙතමනය අනුවර්තනයට සම්බන්ධ ජානමය තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය
ප්රකාශිත: ජාතික විද්යා සමාලෝචනය, 2021
අනුපිළිවෙල උපාය:
'බසිගේකටු නැති(ආර්.විචුරයිනන්) ජෙනෝමය:
ආසන්න වශයෙන්.93 X PacBio + දළ වශයෙන්.90 X Nanopore + 267 X Illumina
ප්රධාන ප්රතිඵල
1.උසස් තත්ත්වයේ R.wichuraiana ජෙනෝමය තනන ලද්දේ දිගු-කියවන අනුක්රමික ක්රමවේදයන් භාවිතයෙන් වන අතර එමඟින් 530.07 Mb එකලස් කිරීමක් ලබා දෙයි (ඇස්තමේන්තුගත ජෙනෝම ප්රමාණය ප්රවාහ සයිටෝමිතිය මගින් 525.9 Mb සහ ජාන සමීක්ෂණය මගින් 525.5 Mb පමණ විය). Heterozygosity3% පමණ විය.BUSCO ඇස්තමේන්තුගත ලකුණු 93.9% කි."Old blush" (haploOB) සමඟ සසඳන විට, මෙම ජෙනෝමයේ ගුණාත්මක භාවය සහ සම්පූර්ණත්වය පාදක තනි-පාදක නිරවද්යතාවය සහ LTR එකලස් කිරීමේ දර්ශකය (LAI=20.03) මගින් තහවුරු කරන ලදී.R.wichuraiana ජෙනෝමයේ ප්රෝටීන් කේතීකරණ ජාන 32,674 ක් අඩංගු වේ.
2.Multi-omics ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණය, සංසන්දනාත්මක ජෙනොමික්ස්, ට්රාන්ස්ක්රිප්ටොමික්ස්, ප්රවේණික ජනගහනය පිළිබඳ QTL විශ්ලේෂණය, R. wichuraiana සහ Rosa chinensis අතර තීරණාත්මක විශේෂණය හෙළිදරව් කරන ලදී.එසේම, QTL හි අදාළ ජානවල ප්රකාශන විචලනය කඳේ කටු රටා සමඟ සම්බන්ධ වීමට ඉඩ ඇත.
Basye;s Thornless සහ Rosa chinensis අතර සංසන්දනාත්මක ප්රවේණි විද්යාව විශ්ලේෂණය, සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය, ජාන පවුල් පොකුර, ප්රසාරණය සහ හැකිලීම විශ්ලේෂණය, රෝස මල් වල තීරණාත්මක ගති ලක්ෂණ වලට සම්බන්ධ විශාල වෙනස්කම් රාශියක් අනාවරණය කර ඇත.NAC සහ FAR1/FRS ජාන පවුලේ අද්විතීය ව්යාප්තිය කළු ලප වලට ප්රතිරෝධය සමඟ සම්බන්ධ වීමට බොහෝ දුරට ඉඩ තිබුණි.
BT සහ haploOB ජාන අතර සංසන්දනාත්මක ජාන විද්යා විශ්ලේෂණය.
ෂොං, එම්., සහ අල්."කුරුලෑ රහිත රෝස: තෙතමනය අනුවර්තනයට සම්බන්ධ ජානමය තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය"ජාතික විද්යා සමාලෝචනය, 2021;, nwab092.