مڪمل ٽرانسڪرپمينٽ جي ترتيب - Illumina
خاصيتون
● مڪمل ٽرانسڪرپٽ کي ترتيب ڏيڻ لاءِ ڊبل لائبريري: rRNA ختم ٿيڻ بعد PE150 لائبريري جي تياري ۽ سائيز جي چونڊ بعد ۾ SE50 لائبريري جي تياري
● mRNA، lncRNA، circRNA ۽ miRNA جو مڪمل بايو انفارميٽڪس تجزيو الڳ الڳ بايو انفارميٽڪس رپورٽن ۾
● گڏيل رپورٽ ۾ سڀني RNA اظهار جو گڏيل تجزيو، بشمول ceRNA نيٽ ورڪ جو تجزيو.
سروس فائدا
●ريگيوليٽري نيٽ ورڪن جي کوٽائي جو تجزيو: ceRNA نيٽ ورڪ جو تجزيو mRNA، lncRNA، circRNA ۽ miRNA جي گڏيل ترتيب ۽ هڪ مڪمل بايو انفارميٽڪ ورڪ فلو ذريعي فعال ڪيو ويو آهي.
●جامع تشريح: اسان ڪيترن ئي ڊيٽابيس استعمال ڪريون ٿا فنڪشنل طور تي تشريح ڪرڻ لاءِ مختلف طور تي ايڪسپريس ٿيل جينز (DEGs) ۽ لاڳاپيل افزودگي تجزيي کي انجام ڏيو، سيلولر ۽ ماليڪيولر عملن تي بصيرت مهيا ڪن ٿا جيڪي ٽرانسڪرپٽوم ردعمل جي تحت آهن.
●وسيع ماهر: مختلف ريسرچ ڊومينز ۾ 2000 کان وڌيڪ مڪمل ٽرانسڪرپٽوم پروجيڪٽس کي ڪاميابيءَ سان بند ڪرڻ جي ٽريڪ رڪارڊ سان، اسان جي ٽيم هر پروجيڪٽ لاءِ تجربو جو خزانو آڻيندي آهي.
●سخت معيار ڪنٽرول: اسان سڀني مرحلن تي بنيادي ڪنٽرول پوائنٽس تي عمل ڪندا آهيون، نموني ۽ لائبريري جي تياري کان وٺي ترتيب ڏيڻ ۽ بايو انفارميٽڪس تائين.هي محتاط نگراني مسلسل اعلي معيار جي نتيجن جي پهچائڻ کي يقيني بڻائي ٿي.
● جامع تشريح: اسان ڪيترن ئي ڊيٽابيس استعمال ڪريون ٿا فنڪشنل طور تي تشريح ڪرڻ لاءِ مختلف طور تي ايڪسپريس ٿيل جينز (DEGs) ۽ لاڳاپيل افزودگي تجزيي کي انجام ڏيو، سيلولر ۽ ماليڪيولر عملن تي بصيرت مهيا ڪن ٿا جيڪي ٽرانسڪرپٽوم ردعمل جي تحت آهن.
●پوسٽ-سيلز سپورٽ: اسان جي وابستگي پروجيڪٽ جي مڪمل ٿيڻ کان اڳتي وڌي ٿي 3-مهيني بعد-سيل سروس جي مدت سان.هن وقت دوران، اسان پيش ڪريون ٿا پروجيڪٽ جي پيروي ڪرڻ، مشڪلاتن جي حل ۾ مدد، ۽ سوال ۽ جواب سيشن نتيجن سان لاڳاپيل ڪنهن به سوالن کي حل ڪرڻ لاء
نموني جي گهرج ۽ پهچائڻ
| لائبريري | ترتيب واري حڪمت عملي | سفارش ٿيل ڊيٽا | معيار تي ضابطو |
| آر آر اين اي ختم ٿي وئي | Illumina PE150 | 16 جي بي | Q30≥85% |
| سائز چونڊيو | Illumina SE50 | 10-20M پڙهو |
نموني جي گهرج:
نيوڪليوٽائيڊس:
| اتفاق (ng/μl) | رقم (μg) | پاڪائي | سالميت |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 جيل تي ڏيکاريل محدود يا ڪو پروٽين يا ڊي اين اي آلودگي. | ٻوٽا: RIN≥6.5 جانور: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0؛ محدود يا بي بنياد بلندي |
تجويز ڪيل نموني پهچائڻ
ڪنٽينر:
2 ml سينٽرفيوج ٽيوب (ٽين ورق سفارش نه ڪئي وئي آهي)
نموني ليبلنگ: گروپ + نقل ڪريو مثال طور A1، A2، A3؛B1, B2, B3...
ترسيل:
1. خشڪ برف: نمونن کي بيگز ۾ ڀريل ۽ خشڪ برف ۾ دفن ڪرڻ جي ضرورت آهي.
2.RNAstable ٽيوب: آر اين اي نمونن کي آر اين اي اسٽيبلائيزيشن ٽيوب (مثال طور RNAstable®) ۾ خشڪ ڪري سگھجي ٿو ۽ ڪمري جي حرارت تي موڪلي سگھجي ٿو.
سروس ڪم فلو
تجربو ڊيزائن
نموني پهچائڻ
آر اين اي ڪڍڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
بايو انفارميٽڪس
آر اين اي اظهار جو جائزو
مختلف طور تي ظاهر ڪيل جينس
ceRNA تجزيو
مختلف طور تي ظاهر ڪيل miRNAs ۽ لاڳاپيل RNAs
BMKGene جي مڪمل ٽرانسڪرپٽوم ترتيب ڏيڻ واري خدمتن پاران ڪيل پبليڪيشنز جي تيار ڪيل مجموعن ذريعي تحقيق جي واڌاري جي ڳولا ڪريو.
دائي، Y. وغيره.(2022) 'ڪامن-بيڪ بيماري ۾ mRNAs، lncRNAs ۽ miRNAs جا جامع اظهار پروفائل RNA-sequencing جي سڃاڻپ'، ماليڪيولر اومڪس، 18(2)، پي پي. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
ليو، اين نان وغيره.(2022) 'مکمل ڊگھي ٽرانسڪرومس تجزيي جو Apis cerana جي ٿڌي مزاحمت جو تجزيو چانگبائي جبل ۾ اوور سياري دوران.'، جين، 830، پي پي. 146503-146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
وانگ، ايڪس جي وغيره.(2022) 'Multi-Omics Integration-based Prioritization of Competing Endogenous RNA Regulation Networks in Small Cell Lung Cancer: Molecular Characteristics and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu، P. et al.(2022) 'lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA ايڪسپريشن پروفائلز جو مربوط تجزيو مونگ پھلي ۾ روٽ-نوٽ نيميٽوڊس جي جواب ۾ امڪاني ميڪانيزم ۾ نئين بصيرت کي ظاهر ڪري ٿو'، بي ايم سي جينومڪس، 23(1)، پي پي. 1-12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
يان، Z. et al.(2022) 'سڄي-ٽرانسڪرپٽووم آر اين اي سيڪوئنسنگ ان ماليڪيولر ميکانيزم کي نمايان ڪري ٿو جيڪو پوسٽ هارويسٽ جي معيار جي سار سنڀال سان لاڳاپيل بروڪولي ۾ ريڊ LED شعاع ذريعي'، پوسٽ هارويسٽ بايولوجي اينڊ ٽيڪنالاجي، 188، ص.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
