-
مڪمل ڊگھائي mRNA تسلسل-نانوپور
آر اين اي تسلسل جامع ٽرانسڪرپٽوم تجزيي لاءِ هڪ انمول اوزار رهيو آهي.بلاشڪ، روايتي مختصر-پڙهندڙ ترتيب هتي ڪيترن ئي اهم ترقي حاصل ڪئي.پر ان جي باوجود، اهو اڪثر ڪري مڪمل ڊگھائي isoform سڃاڻپ، مقدار، PCR تعصب ۾ حدن کي منهن ڏئي ٿو.
نانوپور جي ترتيب پاڻ کي ٻين ترتيب ڏيڻ واري پليٽ فارمن کان الڳ ڪري ٿي، ان ۾ نيوڪليوٽائڊس سڌو سنئون ڊي اين اي سنٿيسس کان سواءِ پڙهيا ويندا آهن ۽ ڏهن ڪلو بيسس تي ڊگهو پڙهڻ پيدا ڪري ٿو.هي مڪمل ڊگھي ٽرانسڪرپٽس کي سڌو سنئون پڙهڻ ۽ آئسفارم سطح جي مطالعي ۾ چئلينج کي منهن ڏيڻ جي صلاحيت ڏئي ٿو.
پليٽ فارم:نانوپور PromethION
لائبريري:cDNA-PCR
-
ڊي نوو مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪرپٽوم تسلسل -PacBio
نئونمڪمل ڊگھي ٽرانسڪرپٽوم ترتيب، پڻ سڃاتو وڃي ٿونئونIso-Seq پڙهڻ جي ڊيگهه ۾ PacBio sequencer جا فائدا وٺي ٿو، جيڪو بغير ڪنهن وقفي جي مڪمل ڊگھي سي ڊي اين اي ماليڪيولز جي ترتيب کي قابل بڻائي ٿو.هي مڪمل طور تي ٽرانسڪرپٽ اسيمبلي جي مرحلن ۾ پيدا ٿيل ڪنهن به غلطي کان بچي ٿو ۽ يونيگين سيٽ کي isoform-level ريزوليوشن سان ٺاهي ٿو.هي يونيگين سيٽ طاقتور جينياتي معلومات مهيا ڪري ٿو جيئن "ريفرنس جينوم" ٽرانسڪرپٽوم سطح تي.ان کان علاوه، ايندڙ نسل جي ترتيب واري ڊيٽا سان گڏ، هي خدمت isoform-level expression جي صحيح مقدار کي اختيار ڪري ٿي.
پليٽ فارم: PacBio Sequel IIلائبريري: SMRT بيل لائبريري -
Eukaryotic mRNA تسلسل-Illumina
mRNA جي ترتيب خاص حالتن جي تحت سيلز مان نقل ڪيل سڀني mRNAs جي پروفائلنگ کي قابل بڻائي ٿي.اها هڪ طاقتور ٽيڪنالاجي آهي ظاهر ڪرڻ لاءِ جين ايڪسپريس پروفائيل، جيني ڍانچي ۽ ماليڪيولر ميکانيزم کي ڪجهه حياتياتي عملن جي.اڄ تائين، ايم آر اين اي جي ترتيب کي وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي بنيادي تحقيق، ڪلينڪل تشخيص، دوا جي ترقي، وغيره.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
غير ريفرنس جي بنياد تي mRNA تسلسل-Illumina
mRNA جي ترتيب ايندڙ نسل جي ترتيب واري ٽيڪنڪ (NGS) کي اپنائڻ لاءِ ميسينجر RNA (mRNA) فارم Eukaryote کي مخصوص دور ۾ پڪڙيندي آهي ته ڪي خاص فنڪشن فعال ٿي رهيا آهن.ورهايل سڀ کان ڊگھي ٽرانسڪرپٽ کي ’يونيگين‘ سڏيو ويو ۽ ايندڙ تجزيي لاءِ حوالن جي ترتيب طور استعمال ڪيو ويو، جيڪو ريفرنس کانسواءِ نسلن جي ماليڪيولر ميکانيزم ۽ ريگيوليٽري نيٽ ورڪ جو مطالعو ڪرڻ جو هڪ مؤثر وسيلو آهي.
ٽرانسڪرپٽوم ڊيٽا اسيمبلي ۽ يونيگين فنڪشنل تشريح کان پوء
(1) SNP تجزيو، SSR تجزيو، سي ڊي ايس جي اڳڪٿي ۽ جين جي جوڙجڪ اڳڀرائي ڪئي ويندي.
(2) هر نموني ۾ يونيگين اظهار جي مقدار کي انجام ڏنو ويندو.
(3) نمونن (يا گروپن) جي وچ ۾ مختلف طور تي ظاهر ڪيل يونيجن کي دريافت ڪيو ويندو يونيجن اظهار جي بنياد تي
(4) ڪلسٽرنگ، فنڪشنل تشريح ۽ مختلف طور تي ظاهر ڪيل يونيجنز جي افزودگي جو تجزيو ڪيو ويندو.
-
ڊگھو غير ڪوڊنگ تسلسل-Illumina
لانگ نان ڪوڊنگ RNAs (lncRNAs) آر اين اي ماليڪيولز جو ھڪڙو قسم آھي جنھن جي ڊگھائي 200 nt کان وڌيڪ ھوندي آھي، جن جي خاصيت انتهائي گھٽ ڪوڊنگ جي صلاحيت آھي.LncRNA، غير ڪوڊنگ آر اين ايز ۾ هڪ اهم ميمبر جي طور تي، خاص طور تي نيوڪليس ۽ پلازما ۾ مليا آهن.ٽيڪنالوجي ۽ بايو انفارميٽڪس کي ترتيب ڏيڻ ۾ ترقي ڪيترن ئي ناولن lncRNAs جي سڃاڻپ کي قابل بڻائي ٿي ۽ انهن کي حياتياتي ڪمن سان لاڳاپيل ڪري ٿو.مجموعي ثبوتن مان معلوم ٿئي ٿو ته lncRNA وڏي پيماني تي ايپيگينيٽڪ ريگيوليشن، ٽرانسڪرپشن ريگيوليشن ۽ پوسٽ ٽرانسپشن ريگيوليشن ۾ شامل آهي.
-
ننڍو آر اين اي سيڪوئنسنگ- ايلومينا
ننڍو آر اين اي غير ڪوڊنگ آر اين اي ماليڪيولز جي هڪ طبقي ڏانهن اشارو ڪري ٿو جيڪي عام طور تي 200 اينٽ کان گهٽ ڊگھائي ۾ هوندا آهن، جن ۾ مائڪرو آر اين اي (مي آر اين اي)، ننڍو مداخلت آر اين اي (سي آر اين اي)، ۽ پيوي سان رابطي واري آر اين اي (پي آر اين اي) شامل آهن.
مائڪ آر اين اي (miRNA) هڪ ڪلاس جو هڪ ننڍڙو آر اين اي آهي جنهن جي ڊيگهه اٽڪل 20-24 اينٽ آهي، جيڪا سيلز ۾ مختلف اهم ريگيوليٽري ڪردار ادا ڪري ٿي.miRNA ڪيترن ئي زندگيءَ جي عملن ۾ شامل آهي جيڪي ظاهر ڪن ٿا ٽشو - مخصوص ۽ اسٽيج - مخصوص اظهار ۽ مختلف نسلن ۾ انتهائي محفوظ.
-
circRNA تسلسل-Illumina
مڪمل ٽرانسڪرپٽوم سيڪوئنسنگ آر اين اي ماليڪيولز جي سڀني قسمن جي پروفائيل لاءِ ٺهيل آهي، جنهن ۾ ڪوڊنگ (mRNA) ۽ نان ڪوڊنگ RNAs (بشمول lncRNA، circRNA ۽ miRNA) شامل آهن جيڪي مخصوص سيلز طرفان هڪ خاص وقت تي نقل ٿيل آهن.مڪمل ٽرانسڪرپٽوم تسلسل، جنهن کي ”مجموعي آر اين اي سيڪوئنسنگ“ جي نالي سان پڻ سڃاتو وڃي ٿو، ان جو مقصد ٽرانسڪرپوم سطح تي جامع ريگيوليٽري نيٽ ورڪ کي ظاهر ڪرڻ آهي.NGS ٽيڪنالاجي جو فائدو وٺندي، پوري ٽرانسڪرپٽوم پروڊڪٽس جون ترتيبون ceRNA تجزيي ۽ گڏيل RNA تجزيي لاءِ موجود آهن، جيڪي فنڪشنل خاصيت جي طرف پهريون قدم مهيا ڪن ٿيون.circRNA-miRNA-mRNA جي بنياد تي ceRNA جي ريگيوليٽري نيٽورڪ کي ظاهر ڪرڻ.
-
مڪمل ٽرانسڪرپمينٽ جي ترتيب - Illumina
مڪمل ٽرانسڪرپٽوم سيڪوئنسنگ آر اين اي ماليڪيولز جي سڀني قسمن جي پروفائيل لاءِ ٺهيل آهي، جنهن ۾ ڪوڊنگ (mRNA) ۽ نان ڪوڊنگ RNAs (بشمول lncRNA، circRNA ۽ miRNA) شامل آهن جيڪي مخصوص سيلز طرفان هڪ خاص وقت تي نقل ٿيل آهن.مڪمل ٽرانسڪرپٽوم تسلسل، جنهن کي ”مجموعي آر اين اي سيڪوئنسنگ“ جي نالي سان پڻ سڃاتو وڃي ٿو، ان جو مقصد ٽرانسڪرپوم سطح تي جامع ريگيوليٽري نيٽ ورڪ کي ظاهر ڪرڻ آهي.NGS ٽيڪنالاجي جو فائدو وٺندي، پوري ٽرانسڪرپٽوم پروڊڪٽس جون ترتيبون ceRNA تجزيي ۽ گڏيل RNA تجزيي لاءِ موجود آهن، جيڪي فنڪشنل خاصيت جي طرف پهريون قدم مهيا ڪن ٿيون.circRNA-miRNA-mRNA جي بنياد تي ceRNA جي ريگيوليٽري نيٽورڪ کي ظاهر ڪرڻ.
-
Prokaryotic RNA تسلسل
Prokaryotic RNA sequencing ايندڙ نسل جي تسلسل (NGS) کي استعمال ڪري ٿي، هڪ ڏنل وقت ۾ RNA جي موجودگي ۽ مقدار کي ظاهر ڪرڻ لاءِ، بدلجندڙ سيلولر ٽرانسڪروم جو تجزيو ڪندي.اسان جي ڪمپني جي پروڪاريوٽڪ آر اين اي جي ترتيب، خاص طور تي پروڪاريوٽس جو مقصد ريفرنس جينومس سان، توهان کي ٽرانسڪرپٽووم پروفائلنگ، جين جي جوڙجڪ جو تجزيو، وغيره مهيا ڪرڻ آهي. اهو وڏي پيماني تي بنيادي سائنس جي تحقيق، دوا جي تحقيق ۽ ترقي، ۽ وڌيڪ تي لاڳو ڪيو ويو آهي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranscriptome تسلسل
Metatranscriptome sequencing مائرن جي جين اظهار جي نشاندهي ڪري ٿو (ٻنهي eukaryotes ۽ prokaryotes) قدرتي ماحولن ۾ (يعني مٽي، پاڻي، سمنڊ، ٿلهي ۽ گٽ.) خاص طور تي، هي خدمتون توهان کي حاصل ڪرڻ جي اجازت ڏئي ٿي مڪمل جين ايڪسپريس پروفائيلنگ جي پيچيده مائڪروبيل ڪميونٽيز، ٽئڪسونوميڪيشن. نسلن جو، مختلف طور تي ظاهر ڪيل جين جو فنڪشنل افزودگي جو تجزيو، ۽ وڌيڪ.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq 6000
