-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq هسٽون ترميم، ٽرانسپشن فيڪٽرز، ۽ ٻين ڊي اين اي سان لاڳاپيل پروٽينن لاءِ ڊي اين اي مقصدن جي جينوم-وائڊ پروفائلنگ مهيا ڪري ٿو.اهو مخصوص پروٽين-ڊي اين اي ڪمپليڪسز کي بحال ڪرڻ لاءِ ڪروميٽين اميونو-پريپٽيٽيشن (ChIP) جي چونڊ کي گڏ ڪري ٿو، وصولي ٿيل ڊي اين اي جي اعليٰ طريقي سان ترتيب ڏيڻ لاءِ ايندڙ نسل جي ترتيب (NGS) جي طاقت سان.اضافي طور تي، ڇاڪاڻ ته پروٽين-ڊي اين اي ڪمپليڪس جاندار سيلز مان هٿ ڪيا ويا آهن، پابند سائيٽن کي مختلف سيل جي قسمن ۽ بافتن ۾، يا مختلف حالتن ۾ مقابلو ڪري سگهجي ٿو.ايپليڪيشنن جي حد تائين ٽرانسپشن جي ضابطي کان وٺي ترقياتي رستن تائين بيماري جي ميڪانيزم ۽ ان کان ٻاهر.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
Metagenomic تسلسل - NGS
Metagenome مان مراد جاندارن جي مخلوط برادري جي ڪل جينياتي مواد جو مجموعو آهي، جهڙوڪ ماحولياتي ميٽاگينوم، انساني ميٽاگينوم، وغيره. ان ۾ پوکڻ جي قابل ۽ غير پوکيل جاندارن جي جينوم شامل آهن.Metagenomic sequencing هڪ ماليڪيولر اوزار آهي جيڪو ماحولياتي نموني مان نڪتل مخلوط جينومڪ مواد جو تجزيو ڪرڻ لاءِ استعمال ڪيو ويندو آهي، جيڪو تفصيلي معلومات مهيا ڪري ٿو نسلن جي تنوع ۽ ڪثرت، آبادي جي جوڙجڪ، فيلوجينيٽڪ رشتي، فنڪشنل جينز ۽ ماحولياتي عنصرن سان رابطي واري نيٽ ورڪ ۾.
پليٽ فارم:Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
Metagenomic تسلسل-نانوپور
Metagenomics هڪ ماليڪيولر اوزار آهي جيڪو ماحولياتي نموني مان نڪتل مخلوط جينومڪ مواد جو تجزيو ڪرڻ لاءِ استعمال ڪيو ويندو آهي، جيڪو تفصيلي معلومات مهيا ڪري ٿو نسلن جي تنوع ۽ گهڻائي، آبادي جي جوڙجڪ، فيلوجينيٽڪ لاڳاپن، فنڪشنل جينز ۽ ماحولياتي عنصرن سان رابطي واري نيٽ ورڪ وغيره. نانوپور ترتيب ڏيڻ واري پليٽ فارم تازو متعارف ڪرايو آهي. metagenomic اڀياس لاء.پڙهڻ جي ڊيگهه ۾ ان جي شاندار ڪارڪردگي وڏي پيماني تي وڌايو ويو هيٺيون وهڪرو ميٽاجينومڪ تجزيي، خاص طور تي ميٽگينوم اسيمبلي.پڙهڻ جي ڊگھائي جا فائدا کڻڻ، نانوپور جي بنياد تي ميٽيگينومڪ مطالعو شاٽ گن ميٽاگينومڪس جي مقابلي ۾ وڌيڪ مسلسل اسيمبلي حاصل ڪرڻ جي قابل آهي.اهو شايع ڪيو ويو آهي ته نانوپور جي بنياد تي ميٽاگينومڪس ڪاميابيء سان مڪمل ۽ بند ٿيل بيڪٽيريا جينوم مائڪروبيومس (Moss، EL، et. al.فطرت جي بايوٽيڪ، 2020)
پليٽ فارم:نانوپور PromethION P48
-
پوري جينوم بيسلفائٽ جي ترتيب
ڊي اين ميٿيليشن پنجين پوزيشن تي سائٽوسين (5-mC) ۾ جين اظهار ۽ سيلولر سرگرمي تي بنيادي اثر آهي.غير معمولي ميٿيليشن نمونن ڪيترن ئي حالتن ۽ بيمارين سان لاڳاپيل آهن، جهڙوڪ ڪينسر.WGBS واحد بيس ريزوليوشن تي جينوم-وائڊ ميٿيليشن جي مطالعي لاءِ سون جو معيار بڻجي چڪو آهي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
Transposase-Accessible Chromatin لاءِ Assay with High Throughput Sequencing (ATAC-seq)
ATAC-seq جينوم-وائڊ ڪروميٽين جي رسائي جي تجزيي لاءِ هڪ اعليٰ ذريعي جي ترتيب وارو طريقو آهي، جيڪو جين اظهار جي عالمي ايپيگينيٽڪ ڪنٽرول لاءِ اهم آهي.Sequencing adapters داخل ڪيا ويا آھن کليل ڪروميٽين علائقن ۾ hyperactive Tn5 transposase ذريعي.PCR وڌائڻ کان پوء، ھڪڙي ترتيب واري لائبريري تعمير ڪئي وئي آھي.سڀئي کليل ڪروميٽين علائقا حاصل ڪري سگھجن ٿا هڪ مخصوص خلائي وقت جي حالت ۾، نه صرف ٽرانسپشن فيڪٽر جي پابند سائيٽن تائين محدود، يا هڪ مخصوص هسٽون تبديل ٿيل علائقي تائين.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S ۽ 18S rRNA تي سبيونٽ ٻنهي انتهائي محفوظ ۽ هائپر-متغير علائقن تي مشتمل آهي پروڪريوٽڪ ۽ يوڪريوٽڪ آرگنزمز جي سڃاڻپ لاءِ هڪ ڀرپور ماليڪيولر فنگر پرنٽ آهي.ترتيب ڏيڻ جو فائدو وٺندي، انهن amplicons کي محفوظ حصن جي بنياد تي نشانو بڻائي سگهجي ٿو ۽ هائپر-متغير علائقن کي مڪمل طور تي خاص ڪري سگهجي ٿو مائڪروبيل سڃاڻپ لاءِ جيڪي مطالعي ۾ حصو وٺندڙ مائڪروبيل تنوع جي تجزيي، ٽيڪنامي، فائيلوجني وغيره. سنگل ماليڪيول ريئل ٽائيم (SMRT) ) PacBio پليٽ فارم جي ترتيب انتهائي درست ڊگھي ريڊز حاصل ڪرڻ جي قابل بنائي ٿي، جيڪا پوري ڊگھائي ايمپليڪن (تقريبن 1.5 Kb) کي ڍڪي سگھي ٿي.جينياتي فيلڊ جي وسيع نظر کي بيڪٽيريا يا فنگي ڪميونٽي ۾ نسلن جي تشريح ۾ قرارداد کي تمام گهڻو وڌايو.
پليٽ فارم:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing جو مقصد آھي phylogeny, taxonomy, and species experience in a microbial community ۾ تحقيق ڪندي PCR پروڊڪٽس جي گھر جي سنڀاليندڙ جينياتي نشانن جي جن ۾ تمام گھڻيون ڳالھيون ۽ ھائيپر ويريبل حصا شامل آھن.Woeses et al، (1977) پاران انهن مڪمل ماليڪيولر فنگر پرنٽ جو تعارف اڪيلائي کان آزاد مائڪروبيوم پروفائلنگ کي طاقت ڏئي ٿو.16S (بيڪٽيريا)، 18S (فنگ) ۽ اندروني ٽرانسڪرپٽ اسپيسر (ITS، فنگس) جي تسلسل کي ٻنھي وڏين نسلن سان گڏوگڏ نادر ۽ اڻ ڄاتل جنس جي سڃاڻپ جي اجازت ڏئي ٿي.هي ٽيڪنالاجي هڪ وڏي پيماني تي لاڳو ٿيل ۽ اهم اوزار بڻجي چڪي آهي مختلف ماحول ۾ فرق جي مائڪروبيل ساخت جي سڃاڻپ ڪرڻ ۾، جهڙوڪ انساني وات، آنڊن، مٽي وغيره.
پليٽ فارم:Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
بيڪٽيريا ۽ فنگل سڄو جينوم ٻيهر ترتيب ڏيڻ
بيڪٽيريا ۽ فنگل پوري جينوم جي ٻيهر ترتيب ڏيڻ هڪ اهم اوزار آهي معلوم ٿيل بيڪٽيريا ۽ فنگس جي جينوم کي مڪمل ڪرڻ لاءِ، انهي سان گڏ ڪيترن ئي جينوم جو مقابلو ڪرڻ يا نئين جاندارن جي جينوم کي نقشي ڪرڻ لاءِ.اهو تمام ضروري آهي ته بيڪٽيريا ۽ فنگي جي سڄي جينوم کي ترتيب ڏيڻ لاء صحيح حوالو جينوم پيدا ڪرڻ لاء، مائڪروبيل جي سڃاڻپ ڪرڻ ۽ ٻين تقابلي جينوم مطالعي ڪرڻ لاء.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
PacBio-مڪمل ڊگھائي 16S/18S/ITS امپليڪون ترتيب ڏيڻ
Amplicon (16S/18S/ITS) پليٽ فارم مائڪروبيل تنوع پروجيڪٽ جي تجزيي ۾ سالن جي تجربي سان تيار ڪيو ويو آهي، جنهن ۾ معياري بنيادي تجزيا ۽ ذاتي ٿيل تجزيا شامل آهن: بنيادي تجزيي موجوده مائڪروبيل تحقيق جي مرڪزي ڌارا جي تجزياتي مواد کي ڍڪيندي آهي، تجزيو مواد ڀرپور ۽ جامع آهي، ۽ تجزيو جا نتيجا پروجيڪٽ رپورٽن جي صورت ۾ پيش ڪيا ويا آهن؛ذاتي ڪيل تجزيو جو مواد متنوع آهي.نموني چونڊجي سگھجن ٿا ۽ بنيادي تجزيي جي رپورٽ ۽ تحقيق جي مقصد جي مطابق لچڪدار نموني مقرر ڪري سگھجن ٿيون، ذاتي ضرورتن کي محسوس ڪرڻ لاء.ونڊوز آپريٽنگ سسٽم، سادو ۽ تيز.
-
PacBio-مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪروم (غير حوالي)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform تسلسل واري ڊيٽا کي ان پٽ طور کڻڻ، هي ايپ مڪمل ڊگھي ٽرانسڪرپٽ جي ترتيبن کي سڃاڻڻ جي قابل آهي (بغير اسيمبليء جي).ريفرنس جينوم جي خلاف مڪمل ڊگھي تسلسل جي نقشي کي ترتيب ڏيڻ سان، ٽرانسڪرپٽس کي سڃاتل جينز، ٽرانسڪرپٽس، ڪوڊنگ ريجنز وغيره جي مدد سان بهتر بڻائي سگهجي ٿو. ان صورت ۾، mRNA ساخت جي وڌيڪ صحيح سڃاڻپ، جهڙوڪ متبادل ورهائڻ وغيره، حاصل ڪري سگھجن ٿيون.NGS ٽرانسڪروم جي ترتيب واري ڊيٽا سان گڏيل تجزيو وڌيڪ جامع تشريح ۽ ٽرانسڪرپٽ جي سطح تي اظهار ۾ وڌيڪ صحيح مقدار کي قابل بنائي ٿو، جيڪو گهڻو ڪري فائدو ڏئي ٿو هيٺئين پاسي واري فرق جي اظهار ۽ فنڪشنل تجزيو.
-
گھٽ ٿيل نمائندگي بيسلفائٽ تسلسل (RRBS)
ڊي اين اي ميٿيليشن تحقيق هميشه بيماري جي تحقيق ۾ هڪ گرم موضوع رهيو آهي، ۽ ويجهي سان لاڳاپيل آهي جين جي اظهار ۽ فينو ٽائپڪ خاصيتن سان.آر آر بي ايس ڊي اين اي ميٿيليشن ريسرچ لاءِ هڪ درست، ڪارائتو ۽ اقتصادي طريقو آهي.پروموٽر ۽ CpG ٻيٽ جي علائقن کي اينزيميٽڪ ڪليويج (Msp I) ذريعي افزودگي، Bisulfite جي ترتيب سان گڏ، اعليٰ ريزوليوشن ڊي اين اي ميٿيليشن جي سڃاڻپ مهيا ڪري ٿي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
Prokaryotic mRNA تسلسل
mRNA تسلسل خاص حالتن جي تحت سيلز اندر سڀني mRNA ٽرانسڪرپٽس جي جامع پروفائلنگ کي طاقت ڏئي ٿو.هي جديد ٽيڪنالاجي هڪ طاقتور اوزار جي طور تي ڪم ڪري ٿي، مختلف جينياتي عملن سان لاڳاپيل پيچيده جين اظهار جي پروفائلز، جين جي جوڙجڪ، ۽ ماليڪيول ميڪانيزم کي ظاهر ڪندي.بنيادي تحقيق، ڪلينڪل تشخيص، ۽ دوا جي ترقي ۾ وڏي پيماني تي منظور ڪيو ويو آهي، ايم آر اين جي ترتيب سيلولر متحرڪ ۽ جينياتي ضابطن جي پيچيدگين ۾ بصيرت پيش ڪري ٿي.اسان جي پروڪريوٽڪ ايم آر اين اي نموني پروسيسنگ پروڪريوٽڪ ٽرانسڪرومس لاءِ تيار ڪئي وئي آهي، جنهن ۾ rRNA جي گھٽتائي ۽ هدايت واري لائبريري جي تياري شامل آهي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq X
