-
سنگل نيوڪليس آر اين اي جي ترتيب
سنگل سيل ڪيپچرنگ ۾ اڳڀرائي ۽ انفرادي لائبريري جي تعمير جي ٽيڪنڪ کي گڏ ڪرڻ سان گڏ اعليٰ ذريعي جي ترتيب سان جيني اظهار جي مطالعي جي اجازت ڏئي ٿي سيل جي بنياد تي.اهو پيچيده سيل جي آبادي تي هڪ گہرے ۽ مڪمل نظام جي تجزيي کي قابل بنائي ٿو، جنهن ۾ اهو گهڻو ڪري سڀني سيلن جي اوسط وٺڻ سان انهن جي هيٽروجنيٽي کي ڇڪڻ کان بچائيندو آهي.
تنهن هوندي به، ڪجهه سيلن کي واحد-سيل معطل ڪرڻ لاء مناسب نه آهي، تنهنڪري ٻين نموني تيار ڪرڻ جا طريقا - بافتن مان نيوڪليس ڪڍڻ جي ضرورت آهي، اهو آهي، نيوڪليس سڌو سنئون ٽشوز يا سيل مان ڪڍيو وڃي ٿو ۽ اڪيلو-نيوڪليس معطلي ۾ تيار ڪيو وڃي ٿو. سيل جي ترتيب.
BMK مهيا ڪري ٿي 10× جينوميڪس ChromiumTM تي ٻڌل سنگل سيل RNA ترتيب ڏيڻ جي خدمت.هن خدمت کي وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي مطالعي ۾ بيمارين سان لاڳاپيل مطالعي، جهڙوڪ مدافعتي سيل جي فرق، طومار جي فرق، ٽشو جي ترقي، وغيره.
مقامي ٽرانسڪرپٽ چپ: 10 × جينومڪس
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
ٻوٽن/جانورن جي پوري جينوم جي ترتيب
مڪمل جينوم جي ٻيهر ترتيب، WGS جي نالي سان پڻ مشهور آهي، سڄي جينوم تي عام ۽ نادر ميوٽيشنز کي ظاهر ڪرڻ جي قابل بنائي ٿي، جنهن ۾ سنگل نيوڪليوٽائيڊ پوليمورفيزم (SNP)، انسرشن ڊيليشن (InDel)، ساخت جي تبديلي (SV)، ۽ ڪاپي نمبر ويريشن (CNV) شامل آهن. ).SVs SNPs جي ڀيٽ ۾ مختلف قسم جي بنياد جو هڪ وڏو حصو ٺاهيندا آهن ۽ جينوم تي وڏو اثر آهي، جيڪو جاندارن تي هڪ اهم اثر آهي.ڊگھي پڙھڻ واري ريزڪينسنگ جي اجازت ڏئي ٿي وڌيڪ صحيح سڃاڻپ لاءِ وڏن ٽڪرن ۽ پيچيدگي وارين تبديلين جي ڇاڪاڻ ته ڊگھي پڙھڻ سان ڪروموزومل پار ڪرڻ کي پيچيده علائقن جھڙوڪ ٽينڊم ريپٽس، GC/AT-rich علائقن، ۽ ھائيپر-متغير علائقن کي وڌيڪ آسان بڻائي ٿو.
پليٽ فارم: Illumina، PacBio، نانوپور
-
BMKMANU S1000 Spatial Transscriptome
اسپيشل ٽرانسڪرٽوميڪس سائنسي جدت جي اڳيان بيٺو آهي، محققن کي بااختيار بڻائڻ جي لاءِ بااختيار بڻيل جين اظهار جي نمونن کي ٽشوز اندر جڏهن انهن جي فضائي حوالي سان محفوظ ڪيو وڃي.مختلف پليٽ فارمن جي وچ ۾، BMKGene ترقي ڪئي آهي BMKManu S1000 Spatial Transscriptome چپ، فخر ڪنديوڌايل قرارداد5µM جو، ذيلي سيل رينج تائين پهچڻ، ۽ چالو ڪرڻگھڻن سطحي قرارداد سيٽنگون.S1000 چپ، لڳ ڀڳ 2 ملين اسپاٽس جي خصوصيت رکي ٿي، مائيڪرو ويلز کي استعمال ڪري ٿو جيڪي بيڊز سان ڀريل بيڊز سان ڀريل آهن جن کي اسپيشل بارڪوڊ ٿيل ڪيپچر پروبس سان ڀريل آهي.هڪ cDNA لائبريري، مقامي بارڪوڊس سان ڀرپور، S1000 چپ مان تيار ڪئي وئي آهي ۽ بعد ۾ Illumina NovaSeq پليٽ فارم تي ترتيب ڏنل آهي.مقامي طور تي بارڪوڊ ٿيل نمونن ۽ UMIs جو ميلاپ پيدا ڪيل ڊيٽا جي درستگي ۽ خاصيت کي يقيني بڻائي ٿو.BMKManu S1000 چپ جي منفرد وصف ان جي ورهاڱي ۾ جڙيل آهي، ملٽي ليول ريزوليوشن سيٽنگون پيش ڪري ٿي جيڪي مختلف بافتن ۽ تفصيلن جي سطحن تي چڱيءَ ريت ترتيب ڏئي سگھجن ٿيون.هي موافقت چپ کي هڪ شاندار انتخاب جي طور تي رکي ٿو متنوع فضائي ٽرانسڪرپٽوميڪس جي مطالعي لاءِ، يقيني بڻائي ٿو مخصوص فضائي ڪلسترنگ کي گهٽ ۾ گهٽ شور سان.
BMKManu S1000 چپ ۽ ٻيون spatial transscriptomics ٽيڪنالاجيون استعمال ڪندي، محقق سيلز جي فضائي تنظيم ۽ ٽشوز جي اندر ٿيندڙ پيچيده ماليڪيولر لاڳاپن کي بهتر سمجھڻ حاصل ڪري سگھن ٿا، جيڪي مختلف شعبن ۾ حياتياتي عملن جي ھيٺين ميکانيزم ۾ انمول بصيرت مهيا ڪن ٿا. آنڪولوجي، نيورو سائنس، ڊولپمينٽ بائيولاجي، امونالوجي ۽ بوٽنيڪل اسٽڊيز.
پليٽ فارم: BMKManu S1000 چپ ۽ Illumina NovaSeq
-
10x جينومڪس ويزيم اسپيٽيل ٽرانسڪروم
Spatial transscriptomics هڪ جديد ٽيڪنالاجي آهي جيڪا محققن کي اجازت ڏئي ٿي ته انهن جين جي اظهار جي نمونن کي ٽشوز اندر تحقيق ڪري جڏهن انهن جي فضائي حوالي سان محفوظ رهي.ھن ڊومين ۾ ھڪڙو طاقتور پليٽ فارم آھي 10x جينومڪس ويزيم جيڪو ايلومينا جي ترتيب سان گڏ آھي.10X Visium جو اصول هڪ خاص چپ تي رکيل آهي جنهن ۾ هڪ نامزد ڪيل ڪيپچر ايريا آهي جتي ٽشو سيڪشن رکيل آهن.هن قبضي واري علائقي ۾ بارڪوڊ ٿيل اسپاٽ شامل آهن، هر هڪ ٽشو اندر هڪ منفرد مقامي جڳهه سان لاڳاپيل آهي.ٽشو مان پڪڙيل آر اين اي ماليڪيولز کي وري ريورس ٽرانسپشن جي عمل دوران منفرد ماليڪيولر شناخت ڪندڙ (UMIs) سان ليبل ڪيو ويندو آهي.اهي بارڪوڊ ٿيل جڳهيون ۽ UMIs هڪ واحد سيل ريزوليوشن تي جين اظهار جي درست فضائي نقشي ۽ مقدار جي تصديق کي فعال ڪن ٿا.مقامي طور تي بارڪوڊ ٿيل نمونن ۽ UMIs جو ميلاپ پيدا ڪيل ڊيٽا جي درستگي ۽ خاصيت کي يقيني بڻائي ٿو.هن Spatial Transscriptomics ٽيڪنالاجي کي استعمال ڪندي، محقق سيلز جي فضائي تنظيم ۽ ٽشوز جي اندر ٿيندڙ پيچيده ماليڪيولر رابطي جي وڌيڪ ڄاڻ حاصل ڪري سگھن ٿا، ڪيترن ئي شعبن ۾ حياتياتي عملن جي بنيادي ميڪانيزم ۾ انمول بصيرت پيش ڪري ٿو، بشمول آنڪولوجي، نيورو سائنس، ترقياتي حياتيات، امونالوجي. ، ۽ نباتاتي اڀياس.
پليٽ فارم: 10X جينومڪس ويزيم ۽ Illumina NovaSeq
-
مڪمل ڊگھائي mRNA تسلسل-نانوپور
جڏهن ته NGS جي بنياد تي mRNA جي ترتيب جين اظهار جي مقدار جي لاءِ هڪ ورسٽائل اوزار جي طور تي ڪم ڪري ٿي، مختصر پڙهڻ تي ان جو انحصار ان جي اثرائتي کي محدود ڪري ٿو پيچيده ٽرانسڪرمڪ تجزين ۾.ٻئي طرف نانوپور جي ترتيب، ڊگهي پڙهڻ واري ٽيڪنالاجي کي ملازمت ڏئي ٿي، مڪمل ڊگھي mRNA ٽرانسپشن جي ترتيب کي چالو ڪري ٿي.هي طريقو متبادل ورهائڻ، جين فيوزن، پولي-ايڊينيليشن، ۽ mRNA isoforms جي مقدار جي تفصيل جي هڪ جامع ڳولا کي آسان بڻائي ٿو.
نانوپور تسلسل نانوپور سنگل ماليڪيول ريئل ٽائيم برقي سگنلن تي ڀاڙي ٿو.موٽر پروٽينن جي رهنمائي سان، ڊبل-اسٽرينڊ ڊي اين اي بائيوفلم ۾ شامل ٿيل نانوپور پروٽينن سان جڙيل آهي، اڻڄاتل آهي جيئن اهو وولٹیج جي فرق هيٺ نانوپور چينل مان گذري ٿو.ڊي اين اي اسٽرينڊ تي مختلف بيسز مان پيدا ٿيندڙ مخصوص برقي سگنلن کي اصل وقت ۾ معلوم ڪيو ويو آهي ۽ درجه بندي ڪئي وئي آهي، صحيح ۽ مسلسل نيوڪليوٽائيڊ تسلسل کي آسان بڻائي ٿي.هي جديد طريقو مختصر پڙهڻ جي حدن کي ختم ڪري ٿو ۽ پيچيده جينوميڪ تجزيي لاءِ هڪ متحرڪ پليٽ فارم مهيا ڪري ٿو، جنهن ۾ پيچيده ٽرانسڪرٽوميڪ اڀياس شامل آهن.
پليٽ فارم: Nanopore Promethion P48
-
مڪمل ڊگھائي mRNA تسلسل -PacBio
جڏهن ته NGS جي بنياد تي mRNA تسلسل جين اظهار جي مقدار کي طئي ڪرڻ لاءِ هڪ ورهين وارو اوزار آهي، ان جو انحصار مختصر پڙهڻ تي ان جي استعمال کي محدود ڪري ٿو پيچيده ٽرانسڪرٽومڪ تجزين ۾.ٻئي طرف PacBio تسلسل (Iso-Seq)، ڊگھي-پڙھيل ٽيڪنالاجي کي ملازمت ڏئي ٿو، مڪمل ڊگھي mRNA ٽرانسڪرپشن جي ترتيب کي چالو ڪري ٿو.هي طريقو متبادل ورهائڻ، جين فيوزن ۽ پولي-ايڊنيليشن جي هڪ جامع ڳولا کي آسان بڻائي ٿو، جيتوڻيڪ اهو جين جي اظهار جي مقدار لاءِ بنيادي انتخاب نه آهي، ڇاڪاڻ ته گهربل ڊيٽا جي وڏي مقدار جي ڪري.
PacBio ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجي سنگل ماليڪيول، ريئل ٽائيم (SMRT) تسلسل تي ڀاڙي ٿي، مڪمل ڊگھي mRNA ٽرانسڪرپشن کي پڪڙڻ ۾ هڪ الڳ فائدو فراهم ڪري ٿي.ھن جديد طريقي ۾ صفر موڊ ويگ گائيڊز (ZMWs) جو استعمال شامل آھي، مائيڪرو ٺاھيل کوھ جيڪي ترتيب ڏيڻ دوران ڊي اين اي پوليمريز سرگرمي جي حقيقي وقت جي مشاهدي کي فعال ڪن ٿا.انهن ZMWs جي اندر، PacBio جي ڊي اين اي پوليمريز ڊي اين اي جي هڪ مڪمل اسٽرينڊ کي ٺهڪندڙ بڻائي ٿي، ڊگهي پڙهڻي پيدا ڪري ٿي جيڪا پوري mRNA ٽرانسڪرپٽس تي مشتمل آهي.PacBio آپريشن سرڪيولر ڪنسنسس سيڪوئنسنگ (CCS) موڊ ۾ هڪ ئي ماليڪيول کي بار بار ترتيب ڏيڻ سان درستگي کي وڌائي ٿو.ٺاهيل هائي فائي ريڊز ۾ NGS جي مقابلي ۾ هڪ درستگي آهي، وڌيڪ پيچيده ٽرانسڪرپٽومي خاصيتن جي هڪ جامع ۽ قابل اعتماد تجزيي ۾ مدد ڪندي.پليٽ فارم: PacBio Sequel II
-
Eukaryotic mRNA تسلسل-Illumina
mRNA تسلسل خاص حالتن جي تحت سيلز اندر سڀني mRNA ٽرانسڪرپٽس جي جامع پروفائلنگ کي طاقت ڏئي ٿو.هي جديد ٽيڪنالاجي هڪ طاقتور اوزار جي طور تي ڪم ڪري ٿي، مختلف جينياتي عملن سان لاڳاپيل پيچيده جين اظهار جي پروفائلز، جين جي جوڙجڪ، ۽ ماليڪيول ميڪانيزم کي ظاهر ڪندي.بنيادي تحقيق، ڪلينڪل تشخيص، ۽ دوا جي ترقي ۾ وڏي پيماني تي منظور ڪيو ويو آهي، ايم آر اين جي ترتيب سيلولر متحرڪ ۽ جينياتي ضابطن جي پيچيدگين ۾ بصيرت پيش ڪري ٿي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq X
-
غير حوالي سان ٻڌل mRNA تسلسل-Illumina
mRNA تسلسل خاص حالتن جي تحت سيلز اندر سڀني mRNA ٽرانسڪرپٽس جي جامع پروفائلنگ کي طاقت ڏئي ٿو.هي جديد ٽيڪنالاجي هڪ طاقتور اوزار جي طور تي ڪم ڪري ٿي، مختلف جينياتي عملن سان لاڳاپيل پيچيده جين اظهار جي پروفائلز، جين جي جوڙجڪ، ۽ ماليڪيول ميڪانيزم کي ظاهر ڪندي.بنيادي تحقيق، ڪلينڪل تشخيص، ۽ دوا جي ترقي ۾ وڏي پيماني تي منظور ڪيو ويو آهي، ايم آر اين جي ترتيب سيلولر متحرڪ ۽ جينياتي ضابطن جي پيچيدگين ۾ بصيرت پيش ڪري ٿي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq X
-
ڊگھو غير ڪوڊنگ تسلسل-Illumina
ڊگھا نان ڪوڊنگ RNAs (lncRNAs) 200 نيوڪليوٽائڊس کان ڊگھا RNAs آھن جيڪي گھٽ ۾ گھٽ ڪوڊنگ جي صلاحيت رکن ٿا ۽ نان ڪوڊنگ RNA اندر اهم عنصر آھن.نيوڪلئس ۽ سائٽوپلازم ۾ مليا، اهي آر اين ايز ايپيگينيٽڪ، ٽرانسڪرپشن ۽ پوسٽ ٽرانسڪرپشنل ريگيوليشن ۾ اهم ڪردار ادا ڪن ٿا، سيلولر ۽ ماليڪيولر عملن کي شڪل ڏيڻ ۾ انهن جي اهميت کي واضح ڪن ٿا.LncRNA تسلسل سيل جي فرق، اونٽوجنيسس، ۽ انساني بيمارين ۾ هڪ طاقتور اوزار آهي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq
-
ننڍو آر اين اي سيڪوئنسنگ- ايلومينا
ننڍڙا RNA (sRNA) ماليڪيول، عام طور تي 200 نيوڪليوٽائڊس کان گھٽ ڊگھي ۾، شامل آھن microRNAs (miRNAs)، ننڍا مداخلت ڪندڙ RNAs (siRNAs)، ۽ piwi-interacting RNAs (piRNAs).انهن مان، miRNAs، تقريبن 20-24 نيوڪليوٽائڊس ڊگھا، خاص طور تي قابل ذڪر آهن انهن جي اهم ريگيوليٽري ڪردار لاءِ مختلف سيلولر عملن ۾.ٽشو-مخصوص ۽ اسٽيج-مخصوص اظهار جي نمونن سان، miRNAs مختلف نسلن ۾ اعليٰ تحفظ جي نمائش ڪن ٿا.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq
-
circRNA تسلسل-Illumina
سرڪيولر آر اين اي سيڪوئنسنگ (circRNA-seq) سرڪيولر آر اين ايز جو پروفائل ۽ تجزيو ڪرڻ آهي، آر اين اي ماليڪيولز جو هڪ طبقو جيڪو بند ٿيل لوپ ٺاهيندو آهي ان جي ڪري غير قانوني ورهائڻ واري واقعن جي ڪري، انهن آر اين اي کي وڌايل استحڪام فراهم ڪري ٿي.جڏهن ته ڪجهه circRNAs کي microRNA اسپنجز طور ڪم ڪندي ڏيکاريو ويو آهي، microRNAs کي الڳ ڪرڻ ۽ انهن کي انهن جي ٽارگيٽ mRNAs کي ريگيوليشن ڪرڻ کان روڪيو ويو آهي، ٻيون circRNA شايد پروٽينن سان لهه وچڙ ۾ اچن، جين جي اظهار کي تبديل ڪن، يا سيلولر عملن ۾ ڪردار ادا ڪن.circRNA ايڪسپريشن جو تجزيو انهن ماليڪيولز جي ريگيوليٽري ڪردار ۽ مختلف سيلولر عملن، ترقي جي مرحلن، ۽ بيمارين جي حالتن ۾ انهن جي اهميت جي باري ۾ بصيرت مهيا ڪري ٿو، جيني اظهار جي حوالي سان آر اين اي ريگيوليشن جي پيچيدگي کي وڌيڪ سمجهڻ ۾ مدد ڪري ٿو.
-
مڪمل ٽرانسڪرپمينٽ جي ترتيب - Illumina
مڪمل ٽرانسڪرپٽوم تسلسل مختلف آر اين اي ماليڪيولز جي پروفائيلنگ لاءِ هڪ جامع طريقو پيش ڪري ٿو، جنهن ۾ ٻنهي ڪوڊنگ (mRNA) ۽ نان ڪوڊنگ RNAs (lncRNA، circRNA، ۽ miRNA) شامل آهن.هي ٽيڪنڪ هڪ ڏنل وقت تي مخصوص سيلز جي مڪمل ٽرانسڪرپٽ کي قبضو ڪري ٿي، سيلولر عملن جي مجموعي سمجھڻ جي اجازت ڏئي ٿي."مجموعي آر اين اي تسلسل" جي طور تي پڻ سڃاتل آهي، ان جو مقصد ٽرانسڪروم سطح تي پيچيده ريگيوليٽري نيٽ ورڪن کي ظاهر ڪرڻ آهي، ان جي کوٽائي جي تجزيي کي چالو ڪرڻ جهڙوڪ مقابلو ڪندڙ آر اين اي (سي آر اين اي) ۽ گڏيل آر اين اي تجزيو.اهو شروعاتي قدم جي نشاندهي ڪري ٿو فنڪشنل خاصيت جي طرف، خاص طور تي ريگيوليٽري نيٽ ورڪن کي ڪڍڻ ۾ جنهن ۾ circRNA-miRNA-mRNA-based ceRNA تعامل شامل آهن.
