-
PacBio-مڪمل ڊگھائي 16S/18S/ITS امپليڪون ترتيب ڏيڻ
Amplicon (16S/18S/ITS) پليٽ فارم مائڪروبيل تنوع پروجيڪٽ جي تجزيي ۾ سالن جي تجربي سان تيار ڪيو ويو آهي، جنهن ۾ معياري بنيادي تجزيا ۽ ذاتي ٿيل تجزيا شامل آهن: بنيادي تجزيي موجوده مائڪروبيل تحقيق جي مرڪزي ڌارا جي تجزياتي مواد کي ڍڪيندي آهي، تجزيو مواد ڀرپور ۽ جامع آهي، ۽ تجزيو جا نتيجا پروجيڪٽ رپورٽن جي صورت ۾ پيش ڪيا ويا آهن؛ذاتي ڪيل تجزيو جو مواد متنوع آهي.نموني چونڊجي سگھجن ٿا ۽ بنيادي تجزيي جي رپورٽ ۽ تحقيق جي مقصد جي مطابق لچڪدار نموني مقرر ڪري سگھجن ٿيون، ذاتي ضرورتن کي محسوس ڪرڻ لاء.ونڊوز آپريٽنگ سسٽم، سادو ۽ تيز.
-
PacBio-مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪروم (غير حوالي)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform تسلسل واري ڊيٽا کي ان پٽ طور کڻڻ، هي ايپ مڪمل ڊگھي ٽرانسڪرپٽ جي ترتيبن کي سڃاڻڻ جي قابل آهي (بغير اسيمبليء جي).ريفرنس جينوم جي خلاف مڪمل ڊگھي تسلسل جي نقشي کي ترتيب ڏيڻ سان، ٽرانسڪرپٽس کي سڃاتل جينز، ٽرانسڪرپٽس، ڪوڊنگ ريجنز وغيره جي مدد سان بهتر بڻائي سگهجي ٿو. ان صورت ۾، mRNA ساخت جي وڌيڪ صحيح سڃاڻپ، جهڙوڪ متبادل ورهائڻ وغيره، حاصل ڪري سگھجن ٿيون.NGS ٽرانسڪروم جي ترتيب واري ڊيٽا سان گڏيل تجزيو وڌيڪ جامع تشريح ۽ ٽرانسڪرپٽ جي سطح تي اظهار ۾ وڌيڪ صحيح مقدار کي قابل بنائي ٿو، جيڪو گهڻو ڪري فائدو ڏئي ٿو هيٺئين پاسي واري فرق جي اظهار ۽ فنڪشنل تجزيو.
-
اوزار
BMKCloud هڪ معروف بايو انفارميٽڪ پليٽ فارم آهي جيڪو جينومڪ پروگرامن لاءِ ون اسٽاپ حل فراهم ڪري ٿو، جنهن تي مختلف شعبن ۾ تحقيق ڪندڙن پاران وڏي پيماني تي ڀروسو آهي جنهن ۾ طبي، زرعي، ماحولياتي وغيره شامل آهن. , ڪمپيوٽنگ وسيلا، پبلڪ ڊيٽابيس، بايو انفارميٽڪ آن لائين ڪورسز، وغيره. BMKCloud وٽ مختلف اڪثر استعمال ٿيل بايو انفارميٽڪ اوزار آهن جن ۾ جين تشريح، ارتقائي جينياتي اوزار، ncRNA، ڊيٽا جي معيار جو ڪنٽرول، اسيمبلي، ترتيب ڏيڻ، ڊيٽا ڪڍڻ، ميوٽيشنز، شماريات، فگر جنريٽر، sequence. تجزيو، وغيره.
-
ننڍي RNA
ننڍڙا آر اين اي مختصر نان ڪوڊنگ آر اين اي جا قسم آهن جن جي سراسري ڊيگهه 18-30 nt آهي، جنهن ۾ miRNA، siRNA ۽ piRNA شامل آهن.اهي ننڍڙا آر اين اي وڏي پيماني تي مختلف حياتياتي عملن جهڙوڪ mRNA جي زوال، ترجمي جي روڪٿام، heterochromatin ٺهڻ وغيره ۾ ملوث هجڻ جي خبر ڏني وئي آهي. ننڍي RNA جي ترتيب واري تجزيي کي جانورن/ٻوٽن جي ترقي، بيماري، وائرس وغيره جي مطالعي ۾ وڏي پيماني تي لاڳو ڪيو ويو آهي. تسلسل تجزيو پليٽ فارم معياري تجزيو ۽ جديد ڊيٽا مائننگ تي مشتمل آهي.RNA-seq ڊيٽا جي بنياد تي، معياري تجزيو حاصل ڪري سگھي ٿو miRNA جي سڃاڻپ ۽ اڳڪٿي، miRNA ٽارگيٽ جين جي اڳڪٿي، تشريح ۽ اظهار جو تجزيو.ترقي يافته تجزيي کي قابل بنائي ٿو ڪسٽمائيز miRNA ڳولا ۽ ڪڍڻ، وين ڊاگرام نسل، miRNA ۽ ٽارگيٽ جين نيٽ ورڪ بلڊنگ.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS هڪ مڪمل جينوم ٻيهر ترتيب ڏيڻ واري تجزياتي پليٽ فارم آهي، جيڪو بائيو مارڪر ٽيڪنالاجيز ۾ ڀرپور تجربي جي بنياد تي تيار ڪيو ويو آهي.هي آسان استعمال ڪرڻ وارو پليٽ فارم صرف چند بنيادي پيٽرولر کي ترتيب ڏيڻ سان هڪ مربوط تجزيي واري ڪم جي فلو کي جلدي جمع ڪرڻ جي اجازت ڏئي ٿو، جيڪو ڊي اين اي ترتيب ڏيڻ واري ڊيٽا لاءِ ٺهڪي ٿو جيڪو Illumina پليٽ فارم ۽ BGI ترتيب واري پليٽ فارم ٻنهي مان ٺاهيل آهي.هي پليٽ فارم اعلي ڪارڪردگي ڪمپيوٽنگ سرور تي لڳايو ويو آهي، جيڪو تمام محدود وقت ۾ انتهائي موثر ڊيٽا تجزيي کي طاقت ڏئي ٿو.ذاتي ٿيل ڊيٽا مائننگ معياري تجزيي جي بنياد تي دستياب آهي، بشمول ميوٽيڊ جين سوال، پي سي آر پرائمر ڊيزائن، وغيره.
-
mRNA (حوالو)
ٽرانسڪرپوم جينومڪ جينياتي معلومات ۽ حياتياتي ڪم جي پروٽوم جي وچ ۾ ڳنڍيل آهي.ٽرانسپشن جي سطح جو ضابطو سڀ کان اهم ۽ سڀ کان وڏي پيماني تي اڀياس ڪيل تنظيمن جو طريقو آهي.ٽرانسڪرپٽوم جي ترتيب ڪنهن به وقت يا ڪنهن به حالت ۾ ٽرانسڪرپٽ کي ترتيب ڏئي سگهي ٿي، هڪ واحد نيوڪليوٽائيڊ جي صحيح قرارداد سان. اهو متحرڪ طور تي جين ٽرانسڪرپشن جي سطح کي ظاهر ڪري سگهي ٿو، هڪ ئي وقت ۾ نادر ۽ عام ٽرانسڪرپشن جي سڃاڻپ ۽ مقدار جو اندازو لڳائي سگهي ٿو، ۽ ساخت جي معلومات مهيا ڪري ٿو. نموني مخصوص نقل.
هن وقت، ٽرانسڪرپٽوم ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجي کي وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي زراعت، دوائون ۽ ٻين تحقيقي شعبن ۾، جن ۾ جانورن ۽ ٻوٽن جي ترقي جي ضابطي، ماحولياتي موافقت، مدافعتي رابطي، جين لوڪلائيزيشن، نسلن جينياتي ارتقاء ۽ تومور ۽ جينياتي بيماري جي سڃاڻپ شامل آهن.
-
Metagenomics (NGS)
هي تجزياتي پليٽ فارم شاٽگن ميٽگينوميڪ ڊيٽا تجزيي لاءِ ٺهيل آهي سالن جي تجربن جي بنياد تي.اهو مربوط ورڪ فلو تي مشتمل آهي جنهن ۾ مختلف عام طور تي گهربل ميٽاگينومڪس تجزيا شامل آهن جن ۾ ڊيٽا پروسيسنگ، اسپيسيز-ليول اسٽڊيز، جيني فنڪشن-ليول اسٽڊيز، ميٽگينوم بائننگ، وغيره شامل آهن. ان کان علاوه، ڪسٽمائيز ڊيٽا مائننگ ٽولز معياري تجزيي واري ڪم جي فلو تي دستياب آهن، جن ۾ جين ۽ نسل جا سوال شامل آهن. , پيرا ميٽر سيٽنگ, ذاتي شڪل پيدا ڪرڻ, وغيره.
-
LncRNA
ڊگھا نان ڪوڊنگ آر اين ايز (lncRNA) ھڪ قسم جا ٽرانسڪرپٽ آھن جن جي ڊگھائي 200 NT کان وڌيڪ آھي، جيڪي پروٽين کي ڪوڊ ڪرڻ جي قابل نه آھن.جمعي ثبوتن مان معلوم ٿئي ٿو ته اڪثر lncRNAs جي ڪارڪردگيءَ جو تمام گهڻو امڪان آهي.اعليٰ درجي جي ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجيون ۽ بايو انفارميٽڪ تجزياتي اوزار اسان کي lncRNA جي ترتيبن ۽ پوزيشن جي معلومات کي وڌيڪ موثر انداز سان ظاهر ڪرڻ جي طاقت ڏين ٿا ۽ اسان کي اهم ريگيوليٽري ڪمن سان گڏ lncRNAs دريافت ڪرڻ جي هدايت ڪن ٿا.BMKCloud اسان جي گراهڪن کي تيز، قابل اعتماد ۽ لچڪدار lncRNA تجزيو حاصل ڪرڻ لاءِ اسان جي گراهڪن کي lncRNA ترتيب ڏيڻ واري تجزياتي پليٽ فارم مهيا ڪرڻ تي فخر آهي.
-
GWAS
جينوم-وائڊ ايسوسيئيشن اسٽڊي (GWAS) جو مقصد جينياتي مختلف قسمن (جينوٽائپ) کي سڃاڻڻ جو مقصد آهي جيڪو مخصوص خاصيتن (فينوٽائپ) سان لاڳاپيل آهي.GWA مطالعو تحقيق ڪري ٿو جينياتي نشانن کي وڏي تعداد ۾ ماڻهن جي پوري جينوم کي پار ڪري ٿو ۽ آبادي جي سطح تي شمارياتي تجزيي ذريعي جينوٽائپ-فينوٽائپ ايسوسيئيشن جي اڳڪٿي ڪري ٿو.مڪمل-جينوم جي ترتيب ممڪن طور تي سڀني جينياتي مختلف قسمن کي ڳولي سگھي ٿو.فينوٽائپڪ ڊيٽا سان گڏ، GWAS کي پروسيس ڪري سگهجي ٿو فينوٽائپ سان لاڳاپيل SNPs، QTLs ۽ اميدوار جين جي سڃاڻپ ڪرڻ لاء، جيڪو مضبوط طور تي جديد جانورن / ٻوٽن جي نسل کي مضبوط ڪري ٿو.SLAF هڪ خود ترقي يافته آسان جينوم ترتيب ڏيڻ واري حڪمت عملي آهي، جيڪا دريافت ڪري ٿي جينوم وسيع ورهايل نشانن، SNP.اهي SNPs، ماليڪيولر جينياتي نشانن جي طور تي، عمل ڪري سگھجن ٿا انجمن جي مطالعي لاءِ ٽارگيٽ ڪيل خاصيتن سان.اهو هڪ قيمتي اثرائتي حڪمت عملي آهي جنهن جي سڃاڻپ ۾ پيچيده خاصيتن سان لاڳاپيل جينياتي تغيرات.
-
نانوپور مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪرومڪس
جاندارن ۾ پيچيده ۽ متغير متبادل isoforms جين جي اظهار ۽ پروٽين جي تنوع کي منظم ڪرڻ لاءِ اهم جينياتي ميڪانيزم آهن.ٽرانسڪرپٽ ڍانچي جي صحيح سڃاڻپ جين ايڪسپريس ريگيوليشن جي نمونن جي گهري مطالعي جو بنياد آهي.نانوپور جي ترتيب واري پليٽ فارم کي ڪاميابيءَ سان ٽرانسڪرٽومڪ اسٽڊي کي isoform-level تائين پهچايو آهي.هي تجزياتي پليٽ فارم تيار ڪيو ويو آهي RNA-Seq ڊيٽا جو تجزيو ڪرڻ لاءِ نانوپور پليٽ فارم تي تيار ڪيل ريفرنس جينوم جي بنياد تي، جيڪو حاصل ڪري ٿو معيار ۽ مقداري تجزيو ٻنهي جين ليول ۽ ٽرانسڪرپٽس جي سطح ۾.
-
سرڪ-آر اين اي
سرڪيولر RNA(circRNA) هڪ قسم جو نان ڪوڊنگ RNA آهي، جيڪي تازو مليا آهن جيڪي ريگيوليٽري نيٽ ورڪن ۾ اهم ڪردار ادا ڪن ٿا جيڪي ترقي ڪرڻ، ماحولياتي مزاحمت وغيره ۾ شامل آهن. لڪير RNA ماليڪيولن کان الڳ، مثال طور mRNA، lncRNA، 3′ ۽ 5′. circRNA جون پڇاڙيون پاڻ ۾ ملائي هڪ گول ڍانچي ٺاهينديون آهن، جيڪي انهن کي Exonuclease جي هضم ٿيڻ کان بچائينديون آهن ۽ اڪثر لڪير RNA کان وڌيڪ مستحڪم هونديون آهن.CircRNA کي جين جي اظهار کي منظم ڪرڻ ۾ مختلف ڪم مليا آهن.CircRNA ceRNA طور ڪم ڪري سگھي ٿو، جيڪو miRNA کي مقابلي سان پابند ڪري ٿو، جيڪو miRNA اسپنج طور سڃاتو وڃي ٿو.CircRNA تسلسل تجزيي پليٽ فارم circRNA جي جوڙجڪ ۽ اظهار جي تجزيي، ٽارگيٽ جي اڳڪٿي ۽ گڏيل تجزيي کي ٻين قسمن جي آر اين اي ماليڪيولز سان طاقت ڏئي ٿو.
-
بي ايس اي
بلڪ ٿيل سيگريگينٽ تجزيي پليٽ فارم تي مشتمل آهي هڪ قدم معياري تجزيي ۽ ترقي يافته تجزيي سان ڪسٽمائيز پيٽرولر سيٽنگ.BSA هڪ ٽيڪنڪ آهي جيڪو فوري طور تي فينوٽائپ سان لاڳاپيل جينياتي نشانن جي سڃاڻپ ڪرڻ لاء استعمال ڪيو ويو آهي.BSA جي مکيه ورڪ فلو تي مشتمل آهي: 1. انتهائي مخالف فينو ٽائپس سان ماڻهن جي ٻن گروپن کي چونڊڻ؛2. DNA، RNA يا SLAF-seq (Developed by Biomarker) کي گڏ ڪرڻ لاءِ سڀني فردن جي ڊي اين اي جا ٻه ٽڪرا ٺاهڻ؛3. حوالن جينوم جي خلاف يا وچ ۾ فرق جي ترتيبن جي نشاندهي ڪرڻ، 4. ED ۽ SNP-index algorithm پاران اميدوار سان ڳنڍيل علائقن جي اڳڪٿي ڪرڻ؛5. اميدوارن جي علائقن ۾ جينز تي فنڪشنل تجزيو ۽ افزودگي وغيره. ڊيٽا ۾ وڌيڪ ترقي يافته مائننگ بشمول جينياتي مارڪر اسڪريننگ ۽ پرائمر ڊيزائن پڻ موجود آهن.
