جينوم ارتقا
فطرت
ڪميونيڪيشن
جينوم ترتيبون ظاهر ڪن ٿيون عالمي منتشر رستا ۽ تجويز ڪن ٿا ڪنورجنٽ جينياتي موافقت سمنڊ جي گھوڙن جي ارتقا ۾
PacBio |روشني |هاءِ-سي |WGS |جينياتي تنوع |ڊيموگرافڪ تاريخ |جين جو وهڪرو
Pacbio ترتيب ڏيڻ، جينووم ڊي نوو اسيمبلي ۽ تشريح جون خدمتون مهيا ڪيون ويون بائيو مارڪر ٽيڪنالاجيز پاران.
نمايان
1. هڪ اعليٰ معيار جو ڪروموزوم-سطح سامونڊي هارس (Hippocampus erectus) 15.5 Mb جي Contig N50 سان حاصل ڪيو ويو.
2. سڄي دنيا ۾ سامونڊي گھوڙن جي 21 نسلن مان ڪل 358 جينوم تيار ڪيا ويا.
3.Seahorses اوليگوسين جي آخر ۾ ترقي ڪئي ۽ ان کان پوءِ سرڪيم-گلوبل ڪالونائيزيشن رستن جي نشاندهي ڪئي وئي آهي ۽ سامونڊي وهڪرن ۾ تبديل ٿيندڙ متحرڪات ۽ پيليٽيمپوريل سامونڊي رستن جي افتتاح سان ڳنڍيل آهن.
4. جينياتي بنياد بار بار "بوني اسپائنز" جي موافقت واري فينوٽائپ هڪ اهم ترقياتي جين ۾ آزاد متبادل سان ڳنڍيل آهي.
5. سامونڊي وهڪرن ذريعي رافٽنگ خراب منتشر جي لاءِ معاوضو ڏئي ٿي ۽ تيز موافقت نوآبادياتي آبادي کي آسان بڻائي ٿي.
حاصلات
تصوير 1 جينياتي تنوع ۽ 358 سامونڊي گھوڙن جي phylogenetic رشتا
هڪسامونڊي گھوڙن لاءِ جاگرافيائي نموني جا جڳهون جيڪي نمونن سان گڏ 22 ڪروموزومس ۾ 21 سامونڊي گھوڙن جي نيوڪليوٽائيڊ تنوع (π) جي نمونن سان.b پاڙيسري سان ملندڙ وڻ 358 سامونڊي گھوڙن جي جينوم-وائڊ SNPs سان ٺهيل آهن.(a) ۽ شاخ جي پس منظر ۾ (b) ۾ مقام پن علامتون ھڪ ٻئي سان ملندڙ جلندڙ آھن.
تصوير 2 سامونڊي گھوڙن جي ڪالونائيزيشن ۽ ڊيموگرافڪ تاريخ
هڪPhylogenetic وڻ ۽ 21 seahorse نسلن لاء مختلف وقت جو اندازو.برانچ لائن جي ٿلهي آبادي جي ماپ جي اندازي مطابق (Ne) ۽ رنگ مختلف نسلن جي نشاندهي ڪن ٿا.نشانيون I-III اشارو ڪن ٿا ڪيليبريشن پوائنٽس.b-d اڳڪٿي ڪيل ڪالونائيزيشن رستن (رنگين تير) سامونڊي گھوڙن جي ويڪرائي وقت، تقسيم، ويڪرائينس واقعن، ۽ سامونڊي وهڪري (سفيد تير) جي بنياد تي.b Indo-Australian Archipelago 18-23 Ma 18-23 ۾ سامونڊي گھوڙن جي عالمي سطح تي متنوع ۽ منتشر ٿيڻ کان اڳ جينس Hippocampus جي اصليت جو مرڪز (ڳاڙھو نشان) ھو.c Seahorses شروعات ۾ ائٽلانٽڪ وڏي سمنڊ کي کولڻ واري ٽيٿيان سامونڊي رستي ذريعي آباد ڪيو، جيڪو ان جي بند ٿيڻ کان پوءِ (7-13 م جي دوران ٽرمينل واقعو)، هن ٽيٿين نسب کي ان جي هندي سمنڊ جي ڀيڻ نسب کان جدا ڪري ڇڏيو.بعد ۾، عربي سمنڊ ۾ تيزيءَ سان متنوع (پيلو نشان)، سامونڊي گھوڙن جي تنوع جو هڪ ٻيو مرڪز قائم ڪيو.d ائٽلانٽڪ سمنڊ جو ٻيو سامونڊي گھوڙا ڪالونائيزيشن وارو واقعو هندي وڏي سمنڊ مان 5Ma جي باري ۾ ٿيو جيڪو ڏکڻ آفريقا جي ٽپ مان گذرندو ۽ آخر ۾ لڳ ڀڳ 3.6 ايم اي جي اڃا تائين کليل پاناما سمنڊ ذريعي اوڀر پئسفڪ سمنڊ ۾ پهتو.
تصوير 3 جين جي وهڪري ۽ اثر انداز آبادي جي ماپ ۾ وهڪري
هڪڏکڻ ائٽلانٽڪ سمنڊ ۾ رهندڙ نسلن جي وچ ۾ جين جي وهڪري جو پتو لڳايو ويو آهي.جين جي وهڪري کي سفيد لائينن جي ويجهو ڏيکاريو ويو آهي جيئن لڏپلاڻ جي شرح G-PhoCS پاران ڪٽيل آهي.تير جي ٿلهي ۽ هدايت جين جي وهڪري جي شرح ۽ هدايت جي مطابق، ترتيب سان.PSMC پاران اثرائتو آبادي جي ماپ ۾ وهڪري.x محور موجوده وقت کان اڳ سالن ۾ وقت جي نمائندگي ڪري ٿو، جڏهن ته y محور موثر آبادي جي ماپ جي نمائندگي ڪري ٿو.چارٽ منظم ڪيا ويا آهن بنيادي طور تي جغرافيائي ورڇ جي مطابق هر هڪ ذات لاءِ مختلف ورهائڻ وارن علائقن سان.c گذريل 1 ملين سالن دوران سمنڊ جي سطح ۾ تبديلي 33 ميٽرن ۾.پيلي لڪير آخري عالمي وچولي چوٽي کي ظاهر ڪري ٿي جڏهن ته سائي ڇانو آخري برفاني وڌ ۾ وڌ عرصي کي ظاهر ڪري ٿي.
تصوير 4 اسپائن جو ارتقا.
هڪکاٻي، نسل جو وڻ سامونڊي گھوڙن ۾ اسپائن جي آزاد ارتقا کي ڏيکاري ٿو.شاخ جي ڊيگهه هر سائيٽ جي متبادل جي تعداد کي اشارو ڪري ٿي.چار اسپائني سمنڊ جي گھوڙن جون جنسون نيري رنگ ۾ نمايان ٿيل آھن.ٿلهي شاخون بي ايم پي 3 جين لاءِ غير مترادف کان مترادف متبادل (dN/dS) جي اعلي شرحن سان ملن ٿيون.بي ايم پي 3 جين لاءِ ڪيننيڪل ۽ جنرلائزڊ ميڪ ڊونلڊ ۽ ڪريٽمن ٽيسٽ (MKT) ٽن جوڙن واري ڀيڻ جي نسلن لاءِ ڪئي وئي جن ۾ مختلف اسپائني ۽ غير اسپائني خاصيتن سان پس منظر جي رنگن سان نمايان ٿيل آهن، جن جي اهميت جي سطح کي اشارو ڪيو ويو آهي p قدر سان نيري ۽ ڳاڙهي فونٽ سان.ساڄي، بي ايم پي 3 پروٽين ۾ امينو اسيد جي متبادل جو مقابلو، پوليمورفڪ ۽ اسپائني سامونڊي گھوڙن ۾ مقرر ٿيل متبادل، ترتيب سان ڳاڙهي ۽ نيري حلقن سان اشارو ڪيو ويو آهي.b dN/dS قدرن جي ورڇ bmp3 ۾ اسپائني سامونڊي گھوڙن ۾ غير اسپائني نسلن جي مقابلي ۾.bmp3 پاران انڪوڊ ٿيل پروٽين لاءِ ٻيهر تعمير ٿيل phylogenetic وڻ ۾ آزاد ارتقا.هپپوڪيمپس erectus ۾ بي ايم پي 3 جي سيٽو هائبرڊائيزيشن ۾ مڪمل ماؤنٽ.
حوالو
لي سي وغيره.جينوم جي ترتيب عالمي منتشر رستن کي ظاهر ڪن ٿا ۽ سامونڊي ارتقاء ۾ متضاد جينياتي موافقت جو مشورو ڏين ٿا.نيٽ ڪميون.2021 فيبروري 17؛ 12 (1): 1094.
خبرون ۽ نمايان بايو مارڪر ٽيڪنالاجيز سان جديد ڪامياب ڪيسن کي حصيداري ڪرڻ جو مقصد، ناول جي سائنسي ڪاميابين کي پڪڙڻ ۽ مطالعي دوران لاڳو ڪيل نمايان ٽيڪنالاجيون.
پوسٽ ٽائيم: جنوري-06-2022