وڏي پيماني تي جينو ٽائپنگ، خاص طور تي وڏي پئماني تي آبادي تي، جينياتي ايسوسيئيشن جي مطالعي ۾ هڪ بنيادي قدم آهي، جيڪو فنڪشنل جين جي دريافت، ارتقائي تجزيي وغيره لاء جينياتي بنياد فراهم ڪري ٿو. مڪمل جينوم جي ٻيهر ترتيب جي بدران، گهٽ نمائندگي جينوم ترتيب (RRGS) ) متعارف ڪرايو ويو آهي ترتيب ڏيڻ جي قيمت کي گھٽائڻ لاءِ في نمونو، جڏهن ته جينياتي مارڪر دريافت تي مناسب ڪارڪردگي برقرار رکڻ.اهو عام طور تي ڏنل سائيز جي حد اندر پابندي واري ٽڪري کي ڪڍڻ سان حاصل ڪيو ويندو آهي، جنهن جو نالو ڏنو ويو آهي گھٽ نمائندگي لائبريري (RRL).Specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) وڏي آباديءَ جي ڊي نوو SNP دريافت ۽ SNP جينوٽائپنگ لاءِ هڪ خود ترقي يافته حڪمت عملي آهي.
ٽيڪنيڪل ڪم فلو
SLAF بمقابله موجوده RRL طريقا
SLAF جا فائدا
اعلي جينياتي مارڪر دريافت جي ڪارڪردگي- اعليٰ طريقي سان ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجي سان گڏ، SLAF-Seq مختلف تحقيقي منصوبن جي درخواست کي پورو ڪرڻ لاءِ پوري جينوم ۾ دريافت ڪيل سوين هزارين ٽيگ حاصل ڪري سگهي ٿو، يا ته اسان جي حوالي سان يا ان کان سواءِ.
ڪسٽمائيز ۽ لچڪدار تجرباتي ڊيزائن- مختلف تحقيقي مقصد يا نسلن لاءِ، مختلف اينزيميٽڪ هضمي حڪمت عمليون موجود آهن جن ۾ سنگل اينزائم، ڊبل اينزائم ۽ ملٽي اينزائم هضم شامل آهن.هضم جي حڪمت عملي سليڪو ۾ اڳ ۾ تشخيص ڪئي ويندي هڪ بهترين اينزيم ڊيزائن کي يقيني بڻائڻ لاء.
enzymatic هضم ۾ اعلي ڪارڪردگي- اڳ ۾ ٺهيل اينزيميٽڪ هضم ڪروموزوم تي وڌيڪ برابر ورهايل SLAFs مهيا ڪري ٿي.ٽڪرا گڏ ڪرڻ جي ڪارڪردگي 95 سيڪڙو کان وڌيڪ حاصل ڪري سگھي ٿي.
بار بار تسلسل کان پاسو ڪريو- SLAF-Seq ڊيٽا ۾ ورجائيندڙ تسلسل جو سيڪڙو 5٪ کان گهٽجي ويو آهي، خاص طور تي انهن نسلن ۾ جن ۾ بار بار عناصر جي اعلي سطح آهي، جهڙوڪ ڪڻڪ، مڪئي وغيره.
خود ترقي يافته بايو انفارميٽ ورڪ فلو- BMK هڪ مربوط بايو انفارميٽڪ ورڪ فلو تيار ڪيو آهي جيڪو SLAF-Seq ٽيڪنالاجي تي لاڳو ٿئي ٿو ته جيئن حتمي پيداوار جي اعتبار ۽ درستگي کي يقيني بڻائي سگهجي.
SLAF جي درخواست
جينياتي رابطي جو نقشو
اعلي کثافت جينياتي نقشي جي تعمير ۽ لوسي ڪنٽرولنگ گلن جي قسم جي نشانين جي سڃاڻپ ڪرسنٿيمم ۾ (Chrysanthemum x morifolium Ramat.)
جرنل: باغباني ريسرچ شايع ٿيل: 2020.7
GWAS
جينوم-وائڊ ايسوسيئيشن ۽ لنڪج ميپنگ استعمال ڪندي سويابين جي ٻج ۾ isofavone مواد سان لاڳاپيل اميدوار جين جي سڃاڻپ
جرنل: پلانٽ جرنل شايع ٿيل: 2020.08
ارتقائي جينياتي
آدمشماري جينوميڪ تجزيي ۽ ڊي نوو اسيمبليءَ ظاهر ڪري ٿي ويڊي چانورن جي اصليت کي هڪ ارتقائي راند طور
جرنل: ماليڪيولر پلانٽ شايع ٿيل: 2019.5
بلڪ ٿيل سيگريگينٽ تجزيو (BSA)
GmST1، جيڪو هڪ سلفوٽرانسفريس کي انڪوڊ ڪري ٿو، سويابين موزيڪ وائرس جي مزاحمت کي تسليم ڪري ٿو G2 ۽ G3
جرنل: ٻوٽو، سيل ۽ ماحول شايع ٿيل: 2021.04
حوالو
سن ايڪس، ليو ڊي، ژانگ ايڪس، وغيره.SLAF-Seq: وڏي پيماني تي ڊي نوو SNP جي دريافت ۽ جينوٽائپنگ جو هڪ موثر طريقو اعلي-ذريعي ترتيب استعمال ڪندي [J].پلس ون، 2013، 8(3):e58700
گيت X، Xu Y، Gao K، et al.اعلي کثافت جينياتي نقشي جي تعمير ۽ لوسي ڪنٽرولنگ گلن جي قسم جي نشانين جي سڃاڻپ ڪرسنٿيمم ۾ (Chrysanthemum × morifolium Ramat.).Hortic Res.2020؛ 7:108.
وو ڊي، لي ڊي، زاؤ ايڪس، وغيره.جينوم-وائڊ ايسوسيئيشن ۽ لنڪج ميپنگ استعمال ڪندي سويابين جي ٻج ۾ isoflavone مواد سان لاڳاپيل اميدوار جين جي سڃاڻپ.پلانٽ جي. 2020؛104 (4): 950-963.
سن ج، ما ڊي، تانگ ايل، وغيره.آدمشماري جينومڪ تجزيي ۽ ڊي نوو اسيمبلي ظاهر ڪري ٿي ويدي چانورن جي اصليت هڪ ارتقائي راند جي طور تي.مول پلانٽ.2019؛ 12 (5): 632-647.مول پلانٽ.2018;11 (11): 1360-1376.
Zhao X، Jing Y، Luo Z، et al.GmST1، جيڪو هڪ سلفوٽرانسفريس کي انڪوڊ ڪري ٿو، سويابين موزيڪ وائرس جي مزاحمت کي تسليم ڪري ٿو G2 ۽ G3.پلانٽ سيل ماحول.2021؛ 10.1111/پي سي.14066
پوسٽ جو وقت: جنوري-04-2022