فنگل جينوم
سروس فائدا
● مختلف تحقيقي مقصدن لاءِ دستياب ڪيترن ئي ترتيب وار حڪمت عمليون
● 10,000 کان وڌيڪ پيني-مڪمل جينوم گڏ ڪرڻ سان گڏ فنگس جينوم اسيمبليءَ ۾ تمام گهڻو تجربو.
● پيشه ورانه بعد ۾ وڪرو ٽيڪنيڪل سپورٽ ٽيم وڌيڪ مخصوص تحقيق جي ضرورتن کي پورو ڪندي.
خدمت جي وضاحت
| خدمت | تسلسل واري حڪمت عملي | معيار جي ضمانت | اندازي مطابق گھمڻ جو وقت |
| فنگل ٺيڪ نقشو | Illumina 50X + نانوپور 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 ڪم ڏينهن |
| PacBio HiFi 30X | |||
| فنگل پيني-مڪمل نقشو | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | ڪروموزوم اينڪرنگ تناسب>90٪ | 45 ڪم ڏينهن |
بايو انفارميٽڪس تجزيا
● خام ڊيٽا معيار ڪنٽرول
● جينوم اسيمبلي
● جينوم جزو جو تجزيو
● جيني فنڪشن تشريح
● تقابلي جينومڪ تجزيو
نموني جي گهرج ۽ پهچائڻ
نموني جي گهرج:
لاءِڊي اين اي ڪڍڻ:
| نموني جو قسم | رقم | توجهه | پاڪائي |
| ڊي اين اي ڪڍڻ | > 1.2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280 = 1.6-2.5 |
ٽشو نموني لاء:
| نموني جو قسم | تجويز ڪيل نموني علاج | نموني اسٽوريج ۽ پهچائڻ |
| Unicellular Fungus | خوردبيني جي هيٺان خمير جو مشاهدو ڪريو ۽ انهن کي انهن جي تيزيءَ واري مرحلي ۾ گڏ ڪريو ڪلچر (تقريبن 3-4.5e9 سيلز تي مشتمل) کي 1.5 يا 2 مليل ايپينڊورف ۾ منتقل ڪريو.(برف تي رکو) بيڪٽيريا گڏ ڪرڻ لاءِ ٽيوب کي 1 منٽ لاءِ 14000 گرام تي سينٽرفيوج ڪريو ۽ احتياط سان سپرنيٽنٽ کي هٽايو ٽيوب کي سيل ڪريو ۽ بيڪٽيريا کي مائع نائٽروجن ۾ گھٽ ۾ گھٽ 1-3 ڪلاڪ لاء منجمد ڪريو.ٽيوب کي -80 ℃ فرج ۾ ذخيرو ڪريو. | نموني کي 3-4 ڪلاڪن لاء مائع نائٽروجن ۾ منجمد ڪريو ۽ مائع نائيٽروجن يا -80 درجا ڊگھي مدت تائين محفوظ ڪريو.خشڪ برف سان نموني جي ترسيل گهربل آهي. |
| ميڪرو فنگس | فعال طور تي وڌندڙ مرحلن ۾ ٽشو سفارش ڪئي وئي آهي. اينٽوٽوڪسن کان پاڪ پاڻي سان ٽشو کي ڌوئي، پوءِ 70 سيڪڙو ايٿونل. Cryo-tubes ۾ نموني محفوظ ڪريو. |
سروس ڪم فلو
نموني پهچائڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
1. سرڪوس ڊراگرام فنگل جينوميڪ اجزاء تي
2. Comparative genomics analysis: Phylogenetic tree
