-
Полноразмерное секвенирование мРНК-Nanopore
Секвенирование РНК было бесценным инструментом для всестороннего анализа транскриптома.Несомненно, традиционная секвенирование с коротким чтением достигла здесь многих важных результатов.Тем не менее, он часто сталкивается с ограничениями в идентификации полноразмерных изоформ, количественном определении, смещении ПЦР.
Секвенирование с нанопорами отличается от других платформ секвенирования тем, что нуклеотиды считываются напрямую без синтеза ДНК и генерируются длинные считывания в десятки тысяч пар оснований.Это позволяет напрямую считывать полноразмерные транскрипты и решать проблемы в исследованиях на уровне изоформ.
Платформа：Нанопор Прометион
Библиотека:кДНК-ПЦР
-
Полноразмерное секвенирование транскриптома de novo — PacBio
De novoполноразмерное секвенирование транскриптома, также известное какDe novoIso-Seq использует преимущества секвенатора PacBio в отношении длины считывания, что позволяет секвенировать полноразмерные молекулы кДНК без каких-либо разрывов.Это полностью исключает любые ошибки, возникающие на этапах сборки транскриптов, и создает наборы унигенов с разрешением на уровне изоформ.Этот набор унигенов предоставляет мощную генетическую информацию в виде «эталонного генома» на уровне транскриптома.Кроме того, в сочетании с данными секвенирования следующего поколения эта услуга позволяет проводить точную количественную оценку экспрессии на уровне изоформ.
Платформа: PacBio Sequel IIБиблиотека: библиотека SMRT bell -
Секвенирование эукариотической мРНК-Illumina
Секвенирование мРНК позволяет профилировать все мРНК, транскрибированные из клеток в определенных условиях.Это мощная технология для выявления профиля экспрессии генов, структур генов и молекулярных механизмов определенных биологических процессов.На сегодняшний день секвенирование мРНК широко используется в фундаментальных исследованиях, клинической диагностике, разработке лекарств и т. д.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Секвенирование мРНК без эталона — Illumina
Секвенирование мРНК использует метод секвенирования следующего поколения (NGS) для захвата информационной РНК (мРНК) эукариот в определенный период, когда активируются некоторые специальные функции.Самый длинный сплайсированный транскрипт был назван «Unigene» и использовался в качестве эталонной последовательности для последующего анализа, что является эффективным средством изучения молекулярного механизма и регуляторной сети видов без эталона.
После сборки данных транскриптома и функциональной аннотации унигена
(1) Будут выполнены анализ SNP, анализ SSR, предсказание CDS и структура гена.
(2) Будет проведена количественная оценка экспрессии унигена в каждом образце.
(3) Дифференциально выраженные унигены между образцами (или группами) будут обнаружены на основе экспрессии унигенов.
(4) Будет проведена кластеризация, функциональная аннотация и анализ обогащения дифференциально экспрессирующихся генов.
-
Длинное секвенирование без кодирования — Illumina
Длинные некодирующие РНК (днРНК) — тип молекул РНК длиной более 200 н., которые характеризуются крайне низким кодирующим потенциалом.LncRNA, как ключевой член некодирующих РНК, в основном находится в ядре и плазме.Развитие технологии секвенирования и биоинформатики позволяет идентифицировать многочисленные новые днРНК и связывать их с биологическими функциями.Накопленные данные свидетельствуют о том, что lncRNA широко вовлечена в эпигенетическую регуляцию, регуляцию транскрипции и посттранскрипционную регуляцию.
-
Секвенирование малых РНК-Illumina
Малая РНК относится к классу некодирующих молекул РНК, которые обычно имеют длину менее 200 нуклеотидов, включая микроРНК (миРНК), малые интерференционные РНК (миРНК) и piwi-взаимодействующие РНК (пиРНК).
МикроРНК (миРНК) представляет собой класс эндогенных малых РНК длиной около 20-24 нуклеотидов, которые играют множество важных регуляторных ролей в клетках.миРНК, участвующие во многих жизненных процессах, обнаруживают тканеспецифическую и стадийную экспрессию и высоко консервативны у разных видов.
-
секвенирование циркРНК-Illumina
Полное секвенирование транскриптома предназначено для профилирования всех типов молекул РНК, включая кодирующие (мРНК) и некодирующие РНК (включая днРНК, циркРНК и микроРНК), которые транскрибируются определенными клетками в определенное время.Полное секвенирование транскриптома, также известное как «полное секвенирование РНК», направлено на выявление всеобъемлющих регуляторных сетей на уровне транскриптома.Используя преимущества технологии NGS, последовательности целых продуктов транскриптома доступны для анализа цеРНК и совместного анализа РНК, что обеспечивает первый шаг к функциональной характеристике.Выявление регуляторной сети кРНК на основе циркРНК-миРНК-мРНК.
-
Полное секвенирование транскриптома — Illumina
Полное секвенирование транскриптома предназначено для профилирования всех типов молекул РНК, включая кодирующие (мРНК) и некодирующие РНК (включая днРНК, циркРНК и микроРНК), которые транскрибируются определенными клетками в определенное время.Полное секвенирование транскриптома, также известное как «полное секвенирование РНК», направлено на выявление всеобъемлющих регуляторных сетей на уровне транскриптома.Используя преимущества технологии NGS, последовательности целых продуктов транскриптома доступны для анализа цеРНК и совместного анализа РНК, что обеспечивает первый шаг к функциональной характеристике.Выявление регуляторной сети кРНК на основе циркРНК-миРНК-мРНК.
-
Секвенирование прокариотической РНК
Секвенирование прокариотической РНК использует секвенирование следующего поколения (NGS) для выявления присутствия и количества РНК в данный момент путем анализа изменяющегося клеточного транскриптома.Секвенирование прокариотической РНК нашей компании специально предназначено для прокариот с эталонными геномами, предоставляя вам профилирование транскриптома, анализ структуры генов и т. д. Он широко применяется в фундаментальных научных исследованиях, исследованиях и разработках лекарств и т. д.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Секвенирование метатранскриптома
Секвенирование метатранскриптома идентифицирует экспрессию генов микробов (как эукариот, так и прокариот) в естественной среде (например, в почве, воде, море, фекалиях и кишечнике). В частности, эти услуги позволяют получить профилирование экспрессии целых генов сложных микробных сообществ, таксономический анализ видов, анализ функционального обогащения по-разному выраженных генов и многое другое.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
