BMKCloud Log in
条形banner-03

Продукты

Секвенирование одноядерной РНК

Достижения в области захвата отдельных клеток и техники создания индивидуальных библиотек в сочетании с высокопроизводительным секвенированием позволяют изучать экспрессию генов на поклеточной основе.Это позволяет проводить более глубокий и полный системный анализ сложных популяций клеток, при этом в значительной степени избегая маскировки их гетерогенности путем взятия среднего значения всех клеток.

Однако некоторые клетки непригодны для приготовления одноклеточной суспензии, поэтому необходимы другие методы подготовки проб – экстракция ядра из тканей, то есть ядро ​​непосредственно извлекается из тканей или клеток и готовится в одноядерную суспензию для одноядерной суспензии. секвенирование клеток.

BMK предоставляет 10-кратную услугу секвенирования одноклеточной РНК на основе Genomics Chromium™.Эта услуга широко использовалась в исследованиях, связанных с заболеваниями, такими как дифференцировка иммунных клеток, гетерогенность опухолей, развитие тканей и т. д.

Чип пространственного транскриптома: 10× Геномика

Платформа: Платформа Illumina NovaSeq


Детали услуги

Биоинформатика

Демонстрационные результаты

Технический принцип

Изоляция ядер достигается с помощью 10× Genomics ChromiumTM, который представляет собой восьмиканальную микрофлюидную систему с двойными пересечениями.В этой системе шарики геля со штрих-кодами и праймером, ферментами и одним ядром инкапсулируются в каплю масла размером нанолитр, образуя гель-шарики в эмульсии (GEM).После формирования GEM в каждом GEM происходит лизис клеток и высвобождение штрих-кодов.мРНК подвергаются обратной транскрипции в молекулы кДНК со штрих-кодами 10× и UMI, которые в дальнейшем подлежат созданию стандартной библиотеки секвенирования.

wps_doc_0
wps_doc_1

Ткань не подходит для приготовления суспензии отдельных клеток.

Клетка/Ткань

Причина

Несвежая замороженная ткань

Невозможно получить свежие или давно сохраненные организации

Мышечная клетка, мегакариоцит, жировая…

Диаметр ячейки слишком велик для входа в инструмент.

Печень…

Слишком хрупкий, чтобы сломаться, неспособен различить отдельные клетки.

Нейронная клетка, Мозг…

Более чувствителен, легко подвержен стрессу, изменит результаты секвенирования.

Поджелудочная железа, щитовидная железа…

Богат эндогенными ферментами, влияющими на выработку суспензии отдельных клеток.

Одноядерное против одноклеточного

Одноядерный

Одноклеточный

Неограниченный диаметр ячейки

Диаметр клеток: 10-40 мкм.

Материалом может быть замороженная ткань.

Материал должен быть свежей тканью.

Низкий стресс замороженных клеток

Лечение ферментами может вызвать реакцию клеточного стресса

Никакие эритроциты не нужно удалять

Эритроциты необходимо удалить

Ядерное выражение выражает биоинформацию

Вся клетка выражает биоинформацию

Технические характеристики услуги

Библиотека

Стратегия секвенирования

Объем данных

Образцы требований

Салфетка

10 × одноядерная библиотека Genomics

10x Геномика - Illumina PE150

Примерно 100 000 чтений на ячейку.100-200 Гб

Номер ячейки: > 2 × 105

Концентрация клеток.при 700–1200 клеток/мкл

≥ 200 мг

Для получения более подробной информации о руководстве по подготовке проб и рабочем процессе обслуживания, пожалуйста, свяжитесь с

Рабочий процесс обслуживания

Образец контроля качества

Дизайн эксперимента

доставка образца

Доставка образца

ядерная.подвеска

Изоляция ядер

Подготовка библиотеки

Строительство библиотеки

Последовательность действий

Последовательность действий

Анализ данных

Анализ данных

Послепродажное обслуживание

Послепродажное обслуживание


  • Предыдущий:
  • Следующий:

  • wps_doc_9

    1. Точечная кластеризация

    wps_doc_10

    2. Тепловая карта кластеризации изобилия маркерных выражений

    wps_doc_113. Распределение гена-мейкера в разных кластерах.

    wps_doc_12

    4. Анализ траектории клеток/псевдовремя

    wps_doc_13

     

     

    получить ценовое предложение

    Напишите здесь свое сообщение и отправьте его нам

    Отправьте нам сообщение: