-
Метатранскриптомное секвенирование
Метатранскриптомное секвенирование идентифицирует экспрессию генов микробов (как эукариотов, так и прокариотов) в естественной среде (т. е. почве, воде, море, фекалиях и кишечнике). В частности, эта услуга позволяет получить полное профилирование экспрессии генов сложных микробных сообществ, таксономический анализ. видов, анализ функционального обогащения генов с различной экспрессией и многое другое.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Грибной геном
Biomarker Technologies обеспечивает исследование генома, точный геном и полный геном грибов в зависимости от конкретной цели исследования.Секвенирование генома, сборка и функциональная аннотация могут быть достигнуты путем объединения секвенирования следующего поколения и секвенирования третьего поколения для достижения сборки генома высокого уровня.Технология Hi-C также может быть использована для облегчения сборки генома на уровне хромосом.
Платформа:ПакБио Продолжение II
Нанопор ПрометИОН P48
Платформа Illumina NovaSeq
-
Наборы инструментов
BMKCloud — это ведущая биоинформатическая платформа, предоставляющая универсальное решение для геномных программ, которой широко доверяют исследователи в различных областях, включая медицину, сельское хозяйство, экологию и т. д. BMKCloud стремится предоставлять интегрированные, надежные и эффективные услуги, включая платформы и инструменты биоинформатического анализа. , вычислительные ресурсы, общедоступная база данных, биоинформационные онлайн-курсы и т. д. BMKCloud имеет различные часто используемые биоинформационные инструменты, включая аннотацию генов, инструменты эволюционной генетики, нкРНК, контроль качества данных, сборку, выравнивание, извлечение данных, мутации, статистику, генератор фигур, последовательность. анализ и т.д.
-
Полный геном бактерий
Biomarker Technologies предоставляет услуги секвенирования для построения полного генома бактерий с нулевым пробелом.Основной рабочий процесс построения полного генома бактерий включает секвенирование третьего поколения, сборку, функциональную аннотацию и расширенный биоинформатический анализ для достижения конкретных исследовательских целей.Более полное профилирование генома бактерий позволит выявить фундаментальные механизмы, лежащие в основе их биологических процессов, что также может стать ценным источником информации для геномных исследований высших эукариотических видов.
Платформа:Nanopore PromethION P48 + платформа Illumina NovaSeq
ПакБио Продолжение II
-
малая РНК
Малые РНК представляют собой тип коротких некодирующих РНК со средней длиной 18-30 нт, включая микроРНК, миРНК и пиРНК.Сообщалось, что эти малые РНК участвуют в различных биологических процессах, таких как деградация мРНК, ингибирование трансляции, образование гетерохроматина и т. д. Анализ секвенирования малых РНК широко применяется в исследованиях развития животных/растений, болезней, вирусов и т. д. Малые РНК Платформа анализа секвенирования состоит из стандартного анализа и расширенного интеллектуального анализа данных.На основе данных секвенирования РНК стандартный анализ может обеспечить идентификацию и прогнозирование микроРНК, прогнозирование целевого гена микроРНК, аннотацию и анализ экспрессии.Расширенный анализ позволяет настраивать поиск и извлечение микроРНК, генерировать диаграммы Венна, создавать микроРНК и целевые генные сети.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS — это платформа для анализа повторного секвенирования всего генома, разработанная на основе богатого опыта в области биомаркерных технологий.Эта простая в использовании платформа позволяет быстро выполнить интегрированный рабочий процесс анализа, просто установив несколько основных параметров, которые подходят для данных секвенирования ДНК, генерируемых как с платформы Illumina, так и с платформы секвенирования BGI.Эта платформа развернута на высокопроизводительном вычислительном сервере, что обеспечивает высокоэффективный анализ данных за очень ограниченное время.Персонализированный анализ данных доступен на основе стандартного анализа, включая запрос мутировавшего гена, разработку праймера для ПЦР и т. д.
-
мРНК (ссылка)
Транскриптом — это связь между геномной генетической информацией и протеомом биологической функции.Регуляция уровня транскрипции является наиболее важным и наиболее широко изученным способом регуляции организмов.Секвенирование транскриптома позволяет секвенировать транскриптом в любой момент времени и при любых условиях с точностью до одного нуклеотида. Оно может динамически отражать уровень транскрипции генов, одновременно идентифицировать и количественно определять редкие и нормальные транскрипты, а также предоставлять структурную информацию о образцы конкретных транскриптов.
В настоящее время технология секвенирования транскриптома широко используется в агрономии, медицине и других областях исследований, включая регулирование развития животных и растений, адаптацию к окружающей среде, иммунное взаимодействие, локализацию генов, генетическую эволюцию видов, а также обнаружение опухолей и генетических заболеваний.
-
Метагеномика (NGS)
Эта аналитическая платформа предназначена для анализа метагеномных данных на основе многолетнего опыта.Он состоит из интегрированного рабочего процесса, содержащего различные часто необходимые метагеномные анализы, включая обработку данных, исследования на уровне видов, исследования на уровне функций генов, объединение метагеномов и т. д. Кроме того, в стандартном рабочем процессе анализа доступны настраиваемые инструменты интеллектуального анализа данных, включая запрос генов и видов. , настройка параметров, генерация персонализированных цифр и т. д.
-
днРНК
Длинные некодирующие РНК (днРНК) — это тип транскриптов длиной более 200 нт, которые не способны кодировать белки.Накопленные данные свидетельствуют о том, что большинство днРНК, скорее всего, будут функциональными.Технологии высокопроизводительного секвенирования и инструменты биоинформационного анализа позволяют нам более эффективно выявлять последовательности днРНК и информацию о позиционировании, а также открывать днРНК с важнейшими регуляторными функциями.BMKCloud с гордостью предоставляет нашим клиентам платформу для анализа секвенирования lncRNA, позволяющую проводить быстрый, надежный и гибкий анализ lncRNA.
-
ГВАС
Полногеномное исследование ассоциаций (GWAS) направлено на выявление генетических вариантов (генотипа), связанных с определенными признаками (фенотипом).Исследования GWA исследуют генетические маркеры, охватывающие весь геном большого количества людей, и прогнозируют ассоциации генотип-фенотип с помощью статистического анализа на уровне популяции.Полногеномное повторное секвенирование потенциально может обнаружить все генетические варианты.В сочетании с фенотипическими данными GWAS может быть обработан для идентификации SNP, QTL и генов-кандидатов, связанных с фенотипом, что в значительной степени подтверждает современную селекцию животных и растений.SLAF — это самостоятельно разработанная упрощенная стратегия секвенирования генома, которая обнаруживает распределенные по всему геному маркеры, SNP.Эти SNP, как молекулярно-генетические маркеры, могут быть обработаны для исследований ассоциации с целевыми признаками.Это экономически эффективная стратегия выявления сложных признаков, связанных с генетическими вариациями.
-
Полноразмерная транскриптомика Nanopore
Сложные и изменчивые альтернативные изоформы в организмах являются важными генетическими механизмами регуляции экспрессии генов и разнообразия белков.Точная идентификация структур транскриптов является основой для углубленного изучения закономерностей регуляции экспрессии генов.Платформа секвенирования Nanopore успешно вывела транскриптомные исследования на уровень изоформ.Эта аналитическая платформа предназначена для анализа данных RNA-Seq, генерируемых на платформе Nanopore на основе эталонного генома, что обеспечивает качественный и количественный анализ как на уровне генов, так и на уровне транскриптов.
-
цирк-РНК
Циркулярная РНК (циркулярная РНК) представляет собой тип некодирующей РНК, которая, как недавно обнаружено, играет жизненно важную роль в регуляторных сетях, участвующих в развитии устойчивости к окружающей среде и т. д. В отличие от линейных молекул РНК, например мРНК, днРНК, 3' и 5' концы циркРНК соединены вместе, образуя кольцевую структуру, которая предохраняет их от расщепления экзонуклеазой и более стабильна, чем большая часть линейных РНК.Было обнаружено, что CircRNA выполняет разнообразные функции в регуляции экспрессии генов.ЦирРНК может действовать как церНК, которая конкурентно связывает микроРНК, известную как губка микроРНК.Платформа анализа секвенирования CircRNA позволяет анализировать структуру и экспрессию CircRNA, прогнозировать целевые значения и проводить совместный анализ с другими типами молекул РНК.
